MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HC isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 3181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018416	TAT	2	6	9	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
2	NC_018416	CAG	2	6	29	34	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404264
3	NC_018416	TAA	2	6	101	106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404264
4	NC_018416	ATT	2	6	251	256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
5	NC_018416	ATT	2	6	357	362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
6	NC_018416	ATT	2	6	373	378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
7	NC_018416	TAT	3	9	483	491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
8	NC_018416	TAA	2	6	519	524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404264
9	NC_018416	ATT	2	6	620	625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
10	NC_018416	ATA	2	6	649	654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404264
11	NC_018416	AGA	2	6	658	663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404264
12	NC_018416	AAC	2	6	735	740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400404264
13	NC_018416	CAG	2	6	800	805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404264
14	NC_018416	TAA	2	6	861	866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404264
15	NC_018416	AGT	2	6	877	882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404264
16	NC_018416	TAT	2	6	975	980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
17	NC_018416	AAG	2	6	1013	1018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404264
18	NC_018416	ATT	4	12	1039	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
19	NC_018416	TAA	2	6	1068	1073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404264
20	NC_018416	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
21	NC_018416	ATT	3	9	1164	1172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
22	NC_018416	ATT	2	6	1219	1224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404264
23	NC_018416	ATA	2	6	1234	1239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404264
24	NC_018416	AAT	2	6	1328	1333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404264
25	NC_018416	ATT	2	6	1344	1349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
26	NC_018416	ATA	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
27	NC_018416	TAA	2	6	1406	1411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
28	NC_018416	TGG	2	6	1472	1477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400404265
29	NC_018416	TAA	2	6	1495	1500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
30	NC_018416	GGT	2	6	1518	1523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400404265
31	NC_018416	ATT	2	6	1543	1548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
32	NC_018416	ATT	2	6	1652	1657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
33	NC_018416	TAA	2	6	1672	1677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
34	NC_018416	ATT	2	6	1886	1891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
35	NC_018416	TAA	2	6	1895	1900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
36	NC_018416	CCT	2	6	1917	1922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400404265
37	NC_018416	ATT	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
38	NC_018416	ATA	3	9	2011	2019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
39	NC_018416	TTA	2	6	2029	2034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
40	NC_018416	ATC	3	9	2081	2089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404265
41	NC_018416	ATC	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404265
42	NC_018416	AGA	2	6	2141	2146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404265
43	NC_018416	ATC	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404265
44	NC_018416	CTT	2	6	2242	2247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404265
45	NC_018416	TTA	2	6	2272	2277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
46	NC_018416	ATT	2	6	2338	2343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
47	NC_018416	TAA	2	6	2387	2392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
48	NC_018416	AAC	2	6	2420	2425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400404265
49	NC_018416	GAG	2	6	2433	2438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400404265
50	NC_018416	GCA	2	6	2439	2444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404265
51	NC_018416	TGC	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400404265
52	NC_018416	ATT	3	9	2492	2500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
53	NC_018416	ATT	2	6	2609	2614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
54	NC_018416	TTA	2	6	2661	2666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404265
55	NC_018416	CTT	2	6	2671	2676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404265
56	NC_018416	TAA	2	6	2696	2701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
57	NC_018416	ATA	3	9	2775	2783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404265
58	NC_018416	AAT	3	9	2862	2870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404266
59	NC_018416	ATT	2	6	2871	2876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404266
60	NC_018416	TAT	2	6	3000	3005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404266
61	NC_018416	ATT	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404266
62	NC_018416	TAA	2	6	3134	3139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404266
63	NC_018416	ATT	2	6	3148	3153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404266
64	NC_018416	TAT	2	6	3249	3254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404266
65	NC_018416	ATT	2	6	3300	3305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404266
66	NC_018416	TCA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404266
67	NC_018416	TAA	2	6	3341	3346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404266
68	NC_018416	ATA	2	6	3347	3352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404266
69	NC_018416	TTA	2	6	3434	3439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404266
70	NC_018416	ATT	2	6	3445	3450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404266
71	NC_018416	CAT	2	6	3504	3509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404267
72	NC_018416	AAT	2	6	3511	3516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404267
73	NC_018416	AGG	2	6	3562	3567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400404267
74	NC_018416	ATT	2	6	3571	3576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404267
75	NC_018416	TAT	2	6	3612	3617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404267
76	NC_018416	TTA	2	6	3644	3649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404267
77	NC_018416	TAT	2	6	3699	3704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404267
78	NC_018416	TAA	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404267
79	NC_018416	ATA	2	6	3712	3717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404267
80	NC_018416	ATA	3	9	3820	3828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404268
81	NC_018416	TAA	2	6	3830	3835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404268
82	NC_018416	TTA	2	6	3853	3858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404268
83	NC_018416	ATT	2	6	3892	3897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404268
84	NC_018416	TAA	2	6	3929	3934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404268
85	NC_018416	TAA	2	6	4063	4068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404268
86	NC_018416	AAT	2	6	4097	4102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404268
87	NC_018416	TAA	2	6	4112	4117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404268
88	NC_018416	TAA	2	6	4142	4147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404268
89	NC_018416	TAT	2	6	4154	4159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404268
90	NC_018416	AAT	2	6	4326	4331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404269
91	NC_018416	TAA	2	6	4343	4348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404270
92	NC_018416	ATG	2	6	4354	4359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404270
93	NC_018416	ATT	2	6	4407	4412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404270
94	NC_018416	AAT	2	6	4479	4484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404270
95	NC_018416	GAA	2	6	4551	4556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404270
96	NC_018416	TCT	2	6	4857	4862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404270
97	NC_018416	TAA	2	6	4864	4869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404270
98	NC_018416	GTA	2	6	4872	4877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404270
99	NC_018416	GCA	2	6	4944	4949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404270
100	NC_018416	TAA	2	6	5020	5025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404270
101	NC_018416	ATG	2	6	5029	5034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404270
102	NC_018416	ATT	3	9	5072	5080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404270
103	NC_018416	ACC	2	6	5087	5092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400404270
104	NC_018416	ATT	2	6	5138	5143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404270
105	NC_018416	ATC	2	6	5150	5155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404270
106	NC_018416	AAT	2	6	5225	5230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404270
107	NC_018416	CTT	2	6	5254	5259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404270
108	NC_018416	CAA	2	6	5266	5271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400404270
109	NC_018416	ATA	2	6	5394	5399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404270
110	NC_018416	TTC	2	6	5468	5473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404270
111	NC_018416	TTA	2	6	5526	5531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404270
112	NC_018416	ATA	2	6	5548	5553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404270
113	NC_018416	ATT	2	6	5554	5559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404270
114	NC_018416	ATT	2	6	5570	5575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404270
115	NC_018416	TAA	3	9	5587	5595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404270
116	NC_018416	GAA	2	6	5643	5648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404270
117	NC_018416	ATA	4	12	5701	5712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404270
118	NC_018416	TAT	2	6	5747	5752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404270
119	NC_018416	TAT	2	6	5796	5801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404271
120	NC_018416	AAT	2	6	5885	5890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404271
121	NC_018416	TAA	2	6	5935	5940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404271
122	NC_018416	AAC	2	6	5968	5973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400404271
123	NC_018416	TAA	2	6	5998	6003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404271
124	NC_018416	TTA	2	6	6009	6014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404271
125	NC_018416	TTA	2	6	6020	6025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404271
126	NC_018416	TAA	2	6	6040	6045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404271
127	NC_018416	ATT	4	12	6056	6067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404271
128	NC_018416	TTA	2	6	6173	6178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404271
129	NC_018416	AAT	2	6	6311	6316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404271
130	NC_018416	ATT	3	9	6354	6362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404271
131	NC_018416	CTG	3	9	6396	6404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400404271
132	NC_018416	ATA	2	6	6488	6493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404271
133	NC_018416	GAA	2	6	6512	6517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404272
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