MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HC isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018416	AT	4	8	9028	9035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018416	TA	3	6	26923	26928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018416	TA	3	6	39064	39069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018416	AT	5	10	39075	39084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018416	AT	4	8	60584	60591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018416	TA	3	6	61393	61398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018416	GA	3	6	67893	67898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018416	TA	3	6	73830	73835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018416	AT	6	12	76020	76031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018416	TA	3	6	76157	76162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018416	AT	3	6	90108	90113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018416	AT	3	6	90271	90276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018416	AT	3	6	90292	90297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018416	AT	3	6	90306	90311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018416	TA	3	6	90385	90390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018416	AT	3	6	90642	90647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018416	AT	3	6	105351	105356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018416	TA	3	6	105443	105448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018416	TA	3	6	114179	114184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018416	TG	3	6	115406	115411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018416	TA	3	6	115773	115778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018416	TA	3	6	115808	115813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018416	TA	3	6	116249	116254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018416	AT	4	8	116312	116319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018416	GT	3	6	116441	116446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018416	GT	3	6	116613	116618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018416	AT	3	6	117251	117256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018416	CA	3	6	117459	117464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018416	AT	4	8	117680	117687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018416	TA	3	6	117706	117711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018416	AT	3	6	128220	128225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018416	AT	3	6	128372	128377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018416	TA	3	6	155190	155195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.