MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HC isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018416	T	7	7	8970	8976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018416	T	8	8	9041	9048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018416	A	6	6	13906	13911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018416	A	7	7	13925	13931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018416	A	7	7	13993	13999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018416	A	8	8	14002	14009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018416	T	9	9	21312	21320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018416	A	8	8	26928	26935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018416	A	6	6	26957	26962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018416	A	6	6	26967	26972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018416	T	6	6	29042	29047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018416	T	8	8	29051	29058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018416	A	12	12	29061	29072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018416	A	7	7	29075	29081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018416	T	8	8	35307	35314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018416	A	7	7	35356	35362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018416	A	6	6	35501	35506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018416	A	7	7	38899	38905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018416	T	21	21	46111	46131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018416	A	7	7	46158	46164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018416	A	8	8	46166	46173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018416	T	9	9	46174	46182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018416	A	9	9	46183	46191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018416	A	7	7	46209	46215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018416	A	9	9	51766	51774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018416	T	8	8	51775	51782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018416	T	6	6	51830	51835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018416	A	13	13	52043	52055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018416	A	8	8	60216	60223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018416	A	6	6	60481	60486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018416	A	7	7	60488	60494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018416	T	10	10	60517	60526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018416	T	8	8	60542	60549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018416	T	8	8	60562	60569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018416	T	8	8	60591	60598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018416	A	11	11	61410	61420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018416	A	10	10	61431	61440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018416	T	7	7	63248	63254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018416	A	9	9	67941	67949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018416	T	7	7	73653	73659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018416	T	6	6	73672	73677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018416	T	6	6	73686	73691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018416	A	9	9	73695	73703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018416	A	14	14	73732	73745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018416	T	6	6	73768	73773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018416	T	7	7	73785	73791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018416	A	8	8	73822	73829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018416	A	6	6	73854	73859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018416	T	6	6	73863	73868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018416	A	7	7	76007	76013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018416	A	7	7	76118	76124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018416	A	9	9	76147	76155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018416	T	16	16	87078	87093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018416	A	6	6	90123	90128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018416	T	6	6	90189	90194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018416	T	10	10	90260	90269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018416	A	7	7	90332	90338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018416	A	8	8	90347	90354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018416	T	10	10	90410	90419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018416	A	6	6	90420	90425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018416	T	6	6	90429	90434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018416	T	6	6	90480	90485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018416	A	9	9	90486	90494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018416	T	6	6	90509	90514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018416	A	8	8	90591	90598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018416	T	7	7	90599	90605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018416	T	6	6	90608	90613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018416	T	9	9	90647	90655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018416	A	7	7	92290	92296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018416	T	7	7	101609	101615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018416	A	6	6	101741	101746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018416	T	10	10	104493	104502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018416	A	8	8	105457	105464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018416	T	8	8	113335	113342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018416	A	7	7	113345	113351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018416	T	6	6	114157	114162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018416	T	6	6	114511	114516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018416	T	6	6	114789	114794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018416	T	8	8	114880	114887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018416	A	6	6	114919	114924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018416	T	6	6	114973	114978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018416	T	10	10	115132	115141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018416	T	6	6	115226	115231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018416	A	8	8	115966	115973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018416	A	7	7	115977	115983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018416	A	6	6	115985	115990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018416	T	7	7	116000	116006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018416	T	22	22	116028	116049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018416	T	11	11	116257	116267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018416	T	7	7	116301	116307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018416	T	7	7	116999	117005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018416	A	6	6	117376	117381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018416	A	8	8	117386	117393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018416	T	6	6	117409	117414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018416	T	7	7	117772	117778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018416	T	6	6	117859	117864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018416	A	9	9	124445	124453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018416	A	8	8	124548	124555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018416	A	6	6	128192	128197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018416	T	9	9	128236	128244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018416	T	6	6	128255	128260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018416	A	6	6	128344	128349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018416	T	9	9	128388	128396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018416	T	6	6	128407	128412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018416	A	8	8	154982	154989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018416	A	6	6	154998	155003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018416	A	7	7	155183	155189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018416	A	6	6	155198	155203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018416	A	15	15	165355	165369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.