MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii CS isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018415	TTTTA	2	10	39050	39059	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018415	TTAAT	2	10	61178	61187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018415	ATTTA	2	10	72985	72994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018415	ATAAA	2	10	83977	83986	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018415	ATTTT	2	10	87714	87723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018415	TTTTA	2	10	88467	88476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018415	CTCTA	2	10	98685	98694	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_018415	ATATA	2	10	103862	103871	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018415	AAATT	2	10	110191	110200	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018415	TAAAA	2	10	110659	110668	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018415	AATAA	3	15	112730	112744	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018415	ATTAA	2	10	113265	113274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018415	TTTTA	2	10	113633	113642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018415	TATAT	2	10	113735	113744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018415	TTAAA	2	10	119324	119333	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.