MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii CS isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018415	ATTT	2	8	13122	13129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018415	TAAT	2	8	13158	13165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018415	TATT	2	8	35441	35448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018415	TCGT	2	8	35459	35466	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018415	ATGA	2	8	39207	39214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018415	AATT	2	8	40621	40628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018415	ATTT	2	8	40665	40672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018415	TAAA	2	8	46367	46374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018415	TTTA	2	8	51988	51995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018415	TTAG	2	8	52081	52088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018415	TAAA	2	8	52399	52406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018415	ATTT	2	8	56866	56873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018415	GTAG	2	8	60430	60437	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018415	ATTA	2	8	60714	60721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018415	ATTT	2	8	60856	60863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018415	AAAT	2	8	61675	61682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018415	ATAA	2	8	64621	64628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018415	ATTT	2	8	70591	70598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018415	AATT	2	8	70865	70872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018415	ATTT	2	8	88247	88254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018415	AATT	2	8	88314	88321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018415	AAAT	2	8	88614	88621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018415	ATTT	2	8	98802	98809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018415	GTAT	2	8	109519	109526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018415	ATTT	2	8	109616	109623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018415	TAAT	2	8	110294	110301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018415	CTTT	2	8	111275	111282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018415	TCGC	2	8	112082	112089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018415	ATTT	2	8	112114	112121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018415	ATTT	2	8	112306	112313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018415	ATTA	2	8	113253	113260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018415	TAAT	2	8	113290	113297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018415	CCTT	2	8	113547	113554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.