MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii CE isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018414	TAAT	2	8	8185	8192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018414	ATTT	2	8	13132	13139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018414	ATTT	2	8	29057	29064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018414	TCGT	2	8	35466	35473	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018414	AAAT	2	8	35668	35675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018414	TATT	2	8	39023	39030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018414	ATGA	2	8	39215	39222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018414	TTTA	2	8	51980	51987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018414	ATTT	2	8	52046	52053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018414	TAAA	2	8	52241	52248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018414	ATTT	2	8	56868	56875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018414	GTAG	2	8	60432	60439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018414	ATTA	2	8	60725	60732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018414	ACTT	2	8	61161	61168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018414	TAAA	2	8	68516	68523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018414	TAAA	2	8	68527	68534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018414	AATA	2	8	70498	70505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018414	AAAT	2	8	70557	70564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018414	ATTT	2	8	70571	70578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018414	TTAT	2	8	70585	70592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018414	TTAT	2	8	72819	72826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018414	TTTA	2	8	72976	72983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018414	AATT	2	8	88306	88313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018414	ATTT	2	8	109653	109660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018414	TAAT	2	8	110332	110339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018414	CTTT	2	8	111317	111324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018414	ATTA	2	8	111543	111550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018414	ATTT	2	8	112157	112164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018414	ATTT	2	8	112346	112353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018414	ATTA	2	8	113294	113301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018414	TAAT	2	8	113331	113338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018414	CCTT	2	8	113589	113596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018414	TAAT	2	8	149812	149819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018414	TAAT	2	8	149823	149830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018414	ATAA	2	8	161564	161571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.