MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii CE isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018414	AGAA	2	8	327	334	75 %	0 %	25 %	0 %	400403788
2	NC_018414	TATT	2	8	441	448	25 %	75 %	0 %	0 %	400403788
3	NC_018414	TAAA	2	8	599	606	75 %	25 %	0 %	0 %	400403788
4	NC_018414	TTTA	2	8	681	688	25 %	75 %	0 %	0 %	400403788
5	NC_018414	ATTT	2	8	763	770	25 %	75 %	0 %	0 %	400403788
6	NC_018414	TAAA	2	8	860	867	75 %	25 %	0 %	0 %	400403788
7	NC_018414	ATTC	2	8	1551	1558	25 %	50 %	0 %	25 %	400403789
8	NC_018414	CATT	2	8	1593	1600	25 %	50 %	0 %	25 %	400403789
9	NC_018414	TAGA	2	8	1612	1619	50 %	25 %	25 %	0 %	400403789
10	NC_018414	TAAA	2	8	2095	2102	75 %	25 %	0 %	0 %	400403789
11	NC_018414	TTTA	2	8	2218	2225	25 %	75 %	0 %	0 %	400403789
12	NC_018414	ATTA	2	8	2534	2541	50 %	50 %	0 %	0 %	400403789
13	NC_018414	TATT	2	8	2915	2922	25 %	75 %	0 %	0 %	400403790
14	NC_018414	ATAA	2	8	2923	2930	75 %	25 %	0 %	0 %	400403790
15	NC_018414	TAAA	2	8	2972	2979	75 %	25 %	0 %	0 %	400403790
16	NC_018414	TACC	2	8	3116	3123	25 %	25 %	0 %	50 %	400403790
17	NC_018414	ATTT	2	8	3279	3286	25 %	75 %	0 %	0 %	400403790
18	NC_018414	ATTT	2	8	3332	3339	25 %	75 %	0 %	0 %	400403790
19	NC_018414	AAAT	2	8	3745	3752	75 %	25 %	0 %	0 %	400403792
20	NC_018414	TAAT	2	8	3760	3767	50 %	50 %	0 %	0 %	400403792
21	NC_018414	ATAA	2	8	3837	3844	75 %	25 %	0 %	0 %	400403792
22	NC_018414	ATTT	2	8	3915	3922	25 %	75 %	0 %	0 %	400403792
23	NC_018414	TAAT	2	8	4316	4323	50 %	50 %	0 %	0 %	400403793
24	NC_018414	TAAA	2	8	4386	4393	75 %	25 %	0 %	0 %	400403794
25	NC_018414	TAAA	2	8	4491	4498	75 %	25 %	0 %	0 %	400403794
26	NC_018414	TATG	2	8	4877	4884	25 %	50 %	25 %	0 %	400403794
27	NC_018414	TAAT	2	8	4908	4915	50 %	50 %	0 %	0 %	400403794
28	NC_018414	TTTA	2	8	5212	5219	25 %	75 %	0 %	0 %	400403794
29	NC_018414	ATTT	2	8	5355	5362	25 %	75 %	0 %	0 %	400403794
30	NC_018414	AATT	2	8	5713	5720	50 %	50 %	0 %	0 %	400403794
31	NC_018414	ATAA	2	8	5851	5858	75 %	25 %	0 %	0 %	400403795
32	NC_018414	ATAA	2	8	6040	6047	75 %	25 %	0 %	0 %	400403795
33	NC_018414	ACAA	2	8	6291	6298	75 %	0 %	0 %	25 %	400403795
34	NC_018414	ATAA	2	8	6349	6356	75 %	25 %	0 %	0 %	400403795
35	NC_018414	TTTA	2	8	6859	6866	25 %	75 %	0 %	0 %	400403796
36	NC_018414	TGAT	2	8	6949	6956	25 %	50 %	25 %	0 %	400403796
37	NC_018414	ATGA	2	8	7179	7186	50 %	25 %	25 %	0 %	400403796
38	NC_018414	CAAC	2	8	7356	7363	50 %	0 %	0 %	50 %	400403796
39	NC_018414	AAGA	2	8	7390	7397	75 %	0 %	25 %	0 %	400403796
40	NC_018414	TATT	3	12	7908	7919	25 %	75 %	0 %	0 %	400403797
41	NC_018414	ATTT	2	8	7962	7969	25 %	75 %	0 %	0 %	400403797
42	NC_018414	TAAT	2	8	8088	8095	50 %	50 %	0 %	0 %	400403797
43	NC_018414	ATTA	2	8	8472	8479	50 %	50 %	0 %	0 %	400403798
44	NC_018414	ATTA	2	8	8514	8521	50 %	50 %	0 %	0 %	400403798
45	NC_018414	ATTT	2	8	8561	8568	25 %	75 %	0 %	0 %	400403798
46	NC_018414	GAAA	2	8	8604	8611	75 %	0 %	25 %	0 %	400403798
47	NC_018414	TAAA	2	8	8902	8909	75 %	25 %	0 %	0 %	400403799
48	NC_018414	TAAA	2	8	9286	9293	75 %	25 %	0 %	0 %	400403799
49	NC_018414	TAAT	2	8	9408	9415	50 %	50 %	0 %	0 %	400403799
50	NC_018414	TAAT	2	8	9444	9451	50 %	50 %	0 %	0 %	400403799
51	NC_018414	TATT	2	8	9609	9616	25 %	75 %	0 %	0 %	400403799
52	NC_018414	TATT	2	8	9658	9665	25 %	75 %	0 %	0 %	400403799
53	NC_018414	TTCT	2	8	9797	9804	0 %	75 %	0 %	25 %	400403799
54	NC_018414	AAAT	2	8	9982	9989	75 %	25 %	0 %	0 %	400403799
55	NC_018414	ACAT	2	8	10099	10106	50 %	25 %	0 %	25 %	400403799
56	NC_018414	CTCC	2	8	10117	10124	0 %	25 %	0 %	75 %	400403799
57	NC_018414	CATC	2	8	10131	10138	25 %	25 %	0 %	50 %	400403799
58	NC_018414	AATT	2	8	10306	10313	50 %	50 %	0 %	0 %	400403799
59	NC_018414	TTAA	2	8	10374	10381	50 %	50 %	0 %	0 %	400403799
60	NC_018414	ATTT	2	8	10436	10443	25 %	75 %	0 %	0 %	400403799
61	NC_018414	TAAT	2	8	10765	10772	50 %	50 %	0 %	0 %	400403800
62	NC_018414	ATAA	2	8	10911	10918	75 %	25 %	0 %	0 %	400403800
63	NC_018414	TAAA	2	8	11125	11132	75 %	25 %	0 %	0 %	400403800
64	NC_018414	ATTA	2	8	11193	11200	50 %	50 %	0 %	0 %	400403800
65	NC_018414	TAAT	2	8	11212	11219	50 %	50 %	0 %	0 %	400403800
66	NC_018414	ATTT	2	8	11350	11357	25 %	75 %	0 %	0 %	400403800
67	NC_018414	AAAT	2	8	11524	11531	75 %	25 %	0 %	0 %	400403800
68	NC_018414	TTTA	2	8	11740	11747	25 %	75 %	0 %	0 %	400403800
69	NC_018414	TAAT	2	8	11845	11852	50 %	50 %	0 %	0 %	400403800
70	NC_018414	TTTA	2	8	11866	11873	25 %	75 %	0 %	0 %	400403800
71	NC_018414	TAAA	2	8	12085	12092	75 %	25 %	0 %	0 %	400403800
72	NC_018414	TAAA	2	8	12142	12149	75 %	25 %	0 %	0 %	400403800
73	NC_018414	TAAT	2	8	12260	12267	50 %	50 %	0 %	0 %	400403801
74	NC_018414	AAAT	2	8	12269	12276	75 %	25 %	0 %	0 %	400403801
75	NC_018414	TTAT	2	8	12328	12335	25 %	75 %	0 %	0 %	400403801
76	NC_018414	TATT	2	8	12422	12429	25 %	75 %	0 %	0 %	400403801
77	NC_018414	AATT	2	8	12573	12580	50 %	50 %	0 %	0 %	400403801
78	NC_018414	TAAA	2	8	12581	12588	75 %	25 %	0 %	0 %	400403801
79	NC_018414	TAAT	2	8	12686	12693	50 %	50 %	0 %	0 %	400403801
80	NC_018414	TTAT	2	8	12834	12841	25 %	75 %	0 %	0 %	400403801
81	NC_018414	TAAA	2	8	12912	12919	75 %	25 %	0 %	0 %	400403801
82	NC_018414	ATTA	2	8	12951	12958	50 %	50 %	0 %	0 %	400403802
83	NC_018414	TAAA	2	8	12959	12966	75 %	25 %	0 %	0 %	400403802
84	NC_018414	TAAT	2	8	13442	13449	50 %	50 %	0 %	0 %	400403803
85	NC_018414	ATTT	2	8	13887	13894	25 %	75 %	0 %	0 %	400403803
86	NC_018414	TAAA	2	8	13937	13944	75 %	25 %	0 %	0 %	400403803
87	NC_018414	ATTT	2	8	14172	14179	25 %	75 %	0 %	0 %	400403803
88	NC_018414	ATGT	2	8	14308	14315	25 %	50 %	25 %	0 %	400403804
89	NC_018414	ATTT	2	8	14536	14543	25 %	75 %	0 %	0 %	400403804
90	NC_018414	TAAA	2	8	14600	14607	75 %	25 %	0 %	0 %	400403804
91	NC_018414	ATTA	2	8	14953	14960	50 %	50 %	0 %	0 %	400403805
92	NC_018414	ATTA	2	8	15242	15249	50 %	50 %	0 %	0 %	400403805
93	NC_018414	TAAA	2	8	15261	15268	75 %	25 %	0 %	0 %	400403805
94	NC_018414	ATAA	2	8	15410	15417	75 %	25 %	0 %	0 %	400403805
95	NC_018414	ATTT	2	8	15695	15702	25 %	75 %	0 %	0 %	400403806
96	NC_018414	TAAA	2	8	16064	16071	75 %	25 %	0 %	0 %	400403806
97	NC_018414	AAAT	2	8	16807	16814	75 %	25 %	0 %	0 %	400403808
98	NC_018414	TTAT	2	8	16918	16925	25 %	75 %	0 %	0 %	400403808
99	NC_018414	TTAA	2	8	17055	17062	50 %	50 %	0 %	0 %	400403808
100	NC_018414	AAAT	2	8	17200	17207	75 %	25 %	0 %	0 %	400403808
101	NC_018414	AATA	2	8	17636	17643	75 %	25 %	0 %	0 %	400403808
102	NC_018414	TAAA	2	8	18229	18236	75 %	25 %	0 %	0 %	400403808
103	NC_018414	AATT	3	12	18424	18435	50 %	50 %	0 %	0 %	400403808
104	NC_018414	TAAT	2	8	18523	18530	50 %	50 %	0 %	0 %	400403808
105	NC_018414	TTTA	2	8	18539	18546	25 %	75 %	0 %	0 %	400403808
106	NC_018414	ATTT	2	8	18789	18796	25 %	75 %	0 %	0 %	400403808
107	NC_018414	TAAA	2	8	19018	19025	75 %	25 %	0 %	0 %	400403808
108	NC_018414	AATA	2	8	19304	19311	75 %	25 %	0 %	0 %	400403808
109	NC_018414	AATT	2	8	19313	19320	50 %	50 %	0 %	0 %	400403808
110	NC_018414	GAAA	2	8	19635	19642	75 %	0 %	25 %	0 %	400403808
111	NC_018414	ATAA	2	8	19752	19759	75 %	25 %	0 %	0 %	400403808
112	NC_018414	ATTT	2	8	20067	20074	25 %	75 %	0 %	0 %	400403809
113	NC_018414	TATT	2	8	20092	20099	25 %	75 %	0 %	0 %	400403809
114	NC_018414	TTTA	2	8	20132	20139	25 %	75 %	0 %	0 %	400403809
115	NC_018414	ATTT	2	8	20169	20176	25 %	75 %	0 %	0 %	400403809
116	NC_018414	ATTA	2	8	20206	20213	50 %	50 %	0 %	0 %	400403809
117	NC_018414	ACAA	2	8	20465	20472	75 %	0 %	0 %	25 %	400403809
118	NC_018414	GAAA	2	8	20486	20493	75 %	0 %	25 %	0 %	400403809
119	NC_018414	TTAT	2	8	21042	21049	25 %	75 %	0 %	0 %	400403810
120	NC_018414	TAAA	2	8	21434	21441	75 %	25 %	0 %	0 %	400403810
121	NC_018414	ATTT	2	8	21558	21565	25 %	75 %	0 %	0 %	400403810
122	NC_018414	ATTT	2	8	21610	21617	25 %	75 %	0 %	0 %	400403810
123	NC_018414	AATA	2	8	21693	21700	75 %	25 %	0 %	0 %	400403810
124	NC_018414	TTAT	2	8	21828	21835	25 %	75 %	0 %	0 %	400403810
125	NC_018414	ATGG	2	8	21950	21957	25 %	25 %	50 %	0 %	400403810
126	NC_018414	TAAA	2	8	22256	22263	75 %	25 %	0 %	0 %	400403810
127	NC_018414	ATAC	2	8	22342	22349	50 %	25 %	0 %	25 %	400403810
128	NC_018414	ATTC	2	8	22501	22508	25 %	50 %	0 %	25 %	400403810
129	NC_018414	TATT	2	8	22549	22556	25 %	75 %	0 %	0 %	400403810
130	NC_018414	AATT	2	8	22641	22648	50 %	50 %	0 %	0 %	400403810
131	NC_018414	TATT	2	8	22671	22678	25 %	75 %	0 %	0 %	400403810
132	NC_018414	TTTA	2	8	22743	22750	25 %	75 %	0 %	0 %	400403811
133	NC_018414	ATTT	2	8	23045	23052	25 %	75 %	0 %	0 %	400403812
134	NC_018414	ATTA	2	8	23073	23080	50 %	50 %	0 %	0 %	400403812
135	NC_018414	TCAT	2	8	23097	23104	25 %	50 %	0 %	25 %	400403812
136	NC_018414	AAAT	2	8	23115	23122	75 %	25 %	0 %	0 %	400403812
137	NC_018414	ATAA	2	8	23183	23190	75 %	25 %	0 %	0 %	400403812
138	NC_018414	ATTT	2	8	23291	23298	25 %	75 %	0 %	0 %	400403813
139	NC_018414	ATTT	2	8	23387	23394	25 %	75 %	0 %	0 %	400403813
140	NC_018414	TAGA	2	8	23478	23485	50 %	25 %	25 %	0 %	400403813
141	NC_018414	TTTA	2	8	23562	23569	25 %	75 %	0 %	0 %	400403813
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