MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii CE isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018414	T	9	9	8229	8237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018414	A	9	9	10565	10573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018414	T	6	6	13069	13074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018414	A	6	6	13119	13124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018414	T	7	7	13142	13148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018414	A	9	9	13151	13159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018414	A	10	10	13185	13194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018414	A	10	10	13203	13212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018414	A	8	8	35608	35615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018414	A	8	8	39065	39072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018414	A	8	8	39087	39094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018414	A	8	8	39096	39103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018414	A	9	9	40567	40575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018414	T	6	6	46323	46328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018414	A	6	6	46340	46345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018414	A	6	6	46383	46388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018414	A	6	6	46421	46426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018414	A	8	8	51957	51964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018414	T	8	8	51968	51975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018414	A	7	7	52031	52037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018414	T	7	7	52051	52057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018414	A	8	8	52290	52297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018414	A	9	9	52305	52313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018414	T	8	8	52334	52341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018414	T	6	6	60491	60496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018414	T	7	7	60502	60508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018414	T	7	7	60663	60669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018414	A	7	7	60707	60713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018414	T	7	7	60785	60791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018414	T	8	8	60810	60817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018414	A	8	8	61664	61671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018414	A	10	10	61683	61692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018414	T	8	8	63520	63527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018414	A	11	11	64446	64456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018414	T	8	8	64460	64467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018414	T	7	7	64478	64484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018414	A	7	7	64488	64494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018414	A	6	6	64497	64502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018414	A	14	14	64586	64599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018414	A	6	6	68621	68626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018414	A	14	14	70439	70452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018414	T	7	7	70483	70489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018414	T	7	7	70491	70497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018414	T	7	7	70518	70524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018414	T	9	9	70528	70536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018414	A	10	10	70542	70551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018414	T	6	6	70592	70597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018414	A	7	7	70627	70633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018414	T	6	6	70649	70654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018414	A	6	6	70679	70684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018414	A	9	9	70699	70707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018414	A	6	6	70820	70825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018414	A	9	9	72810	72818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018414	A	6	6	72887	72892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018414	A	9	9	72967	72975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018414	T	9	9	84003	84011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018414	T	8	8	87322	87329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018414	T	8	8	87339	87346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018414	A	7	7	87353	87359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018414	A	6	6	87368	87373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018414	T	8	8	87436	87443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018414	A	6	6	87458	87463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018414	T	9	9	87501	87509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018414	T	9	9	87536	87544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018414	A	6	6	87618	87623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018414	T	7	7	87626	87632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018414	A	9	9	87651	87659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018414	T	11	11	87660	87670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018414	A	10	10	87671	87680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018414	A	7	7	87683	87689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018414	T	6	6	87692	87697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018414	T	7	7	87709	87715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018414	T	11	11	88205	88215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018414	A	6	6	88270	88275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018414	A	8	8	88330	88337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018414	A	6	6	88388	88393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018414	T	8	8	88401	88408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018414	T	8	8	88480	88487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018414	T	18	18	88489	88506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018414	A	9	9	88523	88531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018414	T	8	8	88535	88542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018414	A	15	15	88548	88562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018414	T	10	10	88563	88572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018414	T	9	9	88574	88582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018414	A	8	8	88627	88634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018414	T	6	6	88639	88644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018414	T	6	6	88646	88651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018414	T	8	8	88659	88666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018414	T	6	6	98727	98732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018414	T	6	6	98742	98747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018414	T	8	8	98811	98818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018414	A	6	6	101361	101366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018414	A	8	8	101368	101375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018414	T	8	8	102319	102326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018414	T	7	7	102423	102429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018414	T	7	7	102432	102438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018414	T	8	8	103867	103874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018414	A	10	10	109390	109399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018414	T	7	7	109404	109410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018414	T	7	7	110209	110215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018414	A	8	8	110704	110711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018414	T	6	6	110877	110882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018414	A	7	7	111015	111021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018414	T	7	7	111028	111034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018414	T	6	6	111279	111284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018414	A	6	6	111778	111783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018414	T	6	6	111983	111988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018414	T	8	8	112030	112037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018414	A	8	8	112044	112051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018414	A	8	8	112094	112101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018414	T	6	6	112105	112110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018414	A	10	10	112208	112217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018414	A	9	9	112368	112376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018414	A	7	7	112645	112651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018414	T	6	6	112750	112755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018414	T	8	8	112760	112767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018414	A	11	11	113457	113467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018414	T	6	6	113468	113473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018414	T	6	6	113477	113482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018414	T	9	9	113837	113845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018414	A	10	10	113919	113928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018414	T	8	8	113938	113945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018414	T	9	9	113956	113964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018414	T	8	8	119369	119376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018414	A	6	6	149660	149665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018414	T	12	12	161550	161561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018414	A	10	10	161570	161579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.