MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum NC08_2008.031-4-3P chromosome

Total Repeats: 439

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018413	AACTAA	2	12	4203	4214	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401771168
2	NC_018413	GCAATC	2	12	5891	5902	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401771170
3	NC_018413	GATCTT	2	12	6134	6145	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401771171
4	NC_018413	AGAAAA	2	12	8483	8494	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401771174
5	NC_018413	AATCTT	2	12	9862	9873	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401771176
6	NC_018413	CTGATA	2	12	13994	14005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401771180
7	NC_018413	ACCTGA	2	12	19972	19983	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401771184
8	NC_018413	TAAGAA	2	12	21362	21373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	401771186
9	NC_018413	CATTAG	2	12	22255	22266	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401771187
10	NC_018413	TCAAGA	2	12	25311	25322	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401771188
11	NC_018413	TTAATG	2	12	25792	25803	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401771188
12	NC_018413	CAAAGA	2	12	27039	27050	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401771188
13	NC_018413	TGATCT	2	12	27998	28009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401771188
14	NC_018413	ATTATC	2	12	32726	32737	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401771194
15	NC_018413	GCTAAA	2	12	33522	33533	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401771194
16	NC_018413	AACTAA	2	12	34504	34515	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401771194
17	NC_018413	AAGCAA	2	12	35618	35629	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401771196
18	NC_018413	AGCTAA	2	12	37600	37611	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401771198
19	NC_018413	AATAAC	2	12	41079	41090	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401771199
20	NC_018413	CATTAG	2	12	44927	44938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401771202
21	NC_018413	TTAAGA	2	12	47540	47551	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401771204
22	NC_018413	AATCTT	2	12	47931	47942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401771204
23	NC_018413	CTAAAG	2	12	52396	52407	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401771206
24	NC_018413	AATCGT	2	12	56522	56533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401771209
25	NC_018413	TTGAGC	2	12	57668	57679	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	401771211
26	NC_018413	ACCTAA	2	12	58232	58243	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401771211
27	NC_018413	AAACCA	2	12	60401	60412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	401771213
28	NC_018413	AAAATC	2	12	65959	65970	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401771217
29	NC_018413	AAGAAA	2	12	68570	68581	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401771222
30	NC_018413	TTTATG	2	12	69810	69821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401771224
31	NC_018413	AACAAA	2	12	70777	70788	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401771225
32	NC_018413	AGGTAA	2	12	71093	71104	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	401771226
33	NC_018413	AGTTAA	2	12	72634	72645	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401771230
34	NC_018413	TAAAGG	2	12	74376	74387	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	401771234
35	NC_018413	CTATTT	2	12	85127	85138	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401771242
36	NC_018413	AATATT	2	12	85810	85821	50 %	50 %	0 %	0 %	401771242
37	NC_018413	AATAAA	2	12	87309	87320	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	401771243
38	NC_018413	ATTTAG	2	12	87352	87363	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401771243
39	NC_018413	AATGTT	2	12	89454	89465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401771244
40	NC_018413	AATCTT	2	12	91537	91548	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401771246
41	NC_018413	TCACGA	2	12	91600	91611	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401771246
42	NC_018413	AAGAAA	2	12	98300	98311	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401771252
43	NC_018413	CTTGAT	2	12	100809	100820	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401771254
44	NC_018413	TATATC	2	12	102094	102105	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401771254
45	NC_018413	GTGCAA	2	12	104253	104264	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	401771255
46	NC_018413	AAAACA	2	12	106861	106872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401771257
47	NC_018413	CAAAAG	2	12	109530	109541	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401771260
48	NC_018413	GTTTTA	2	12	110450	110461	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401771261
49	NC_018413	TTAAAG	2	12	114553	114564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401771262
50	NC_018413	TAGAAG	2	12	117328	117339	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	401771263
51	NC_018413	TTTTCT	2	12	119192	119203	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	401771264
52	NC_018413	ATCCAT	2	12	119749	119760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401771264
53	NC_018413	ATTAAT	2	12	124014	124025	50 %	50 %	0 %	0 %	401771266
54	NC_018413	CTTTAA	2	12	127218	127229	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401771272
55	NC_018413	ATAAAT	2	12	129428	129439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	401771274
56	NC_018413	AATTAC	2	12	138730	138741	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401771283
57	NC_018413	CTCGAT	3	18	140884	140901	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401771284
58	NC_018413	GAACAA	2	12	142930	142941	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401771285
59	NC_018413	AAAAAG	2	12	143093	143104	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401771285
60	NC_018413	GACAAA	2	12	143257	143268	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401771285
61	NC_018413	AAAACA	2	12	144774	144785	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401771287
62	NC_018413	TAATAT	2	12	144909	144920	50 %	50 %	0 %	0 %	401771287
63	NC_018413	ATTTAA	2	12	148520	148531	50 %	50 %	0 %	0 %	401771292
64	NC_018413	TGTTAA	2	12	151299	151310	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401771293
65	NC_018413	TTTGAT	2	12	152708	152719	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401771295
66	NC_018413	TAAATC	2	12	154845	154856	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401771296
67	NC_018413	TTAGAT	2	12	157045	157056	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401771297
68	NC_018413	TGGTGA	2	12	158531	158542	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401771298
69	NC_018413	AATCTA	2	12	163255	163266	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401771304
70	NC_018413	TTAAAG	2	12	163831	163842	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401771305
71	NC_018413	AAAGCT	2	12	165516	165527	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401771305
72	NC_018413	ATTGGT	2	12	171022	171033	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401771310
73	NC_018413	ACATTC	2	12	171484	171495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401771310
74	NC_018413	ATTCTT	2	12	171840	171851	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401771310
75	NC_018413	CAGGTG	2	12	175775	175786	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	401771313
76	NC_018413	GAAAAA	2	12	175933	175944	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401771313
77	NC_018413	TTACTA	2	12	180245	180256	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401771321
78	NC_018413	GGTTTA	2	12	181272	181283	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401771323
79	NC_018413	ATAATC	2	12	181403	181414	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401771323
80	NC_018413	ATTTAA	2	12	181659	181670	50 %	50 %	0 %	0 %	401771325
81	NC_018413	GATTTT	2	12	184061	184072	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401771327
82	NC_018413	CTTTAA	2	12	184086	184097	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401771327
83	NC_018413	CTTTAT	2	12	186018	186029	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401771329
84	NC_018413	TTTTGT	2	12	187201	187212	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401771330
85	NC_018413	TTTATT	2	12	191378	191389	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401771335
86	NC_018413	AGAAAA	2	12	192367	192378	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401771335
87	NC_018413	TTTTGT	2	12	192565	192576	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401771336
88	NC_018413	TTTATT	2	12	196743	196754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401771341
89	NC_018413	AGAAAA	2	12	197732	197743	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401771341
90	NC_018413	TTTTGT	2	12	197930	197941	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401771342
91	NC_018413	ACTTAA	2	12	198515	198526	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401771342
92	NC_018413	CTTGGG	2	12	199835	199846	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	401771343
93	NC_018413	ATCTTA	2	12	199942	199953	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401771343
94	NC_018413	TATCAT	2	12	201129	201140	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401771344
95	NC_018413	TACTGA	2	12	201716	201727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401771345
96	NC_018413	AAATGA	2	12	205597	205608	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	401771347
97	NC_018413	CAAAAA	2	12	206325	206336	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401771347
98	NC_018413	AAACAA	2	12	207116	207127	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401771348
99	NC_018413	TTTATT	2	12	207653	207664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401771348
100	NC_018413	AAAAGA	2	12	214335	214346	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401771353
101	NC_018413	ATCAAA	2	12	214448	214459	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401771353
102	NC_018413	AAATTA	2	12	217644	217655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	401771356
103	NC_018413	GGGTTT	2	12	219002	219013	0 %	50 %	50 %	0 %	401771358
104	NC_018413	TAAATT	2	12	222706	222717	50 %	50 %	0 %	0 %	401771360
105	NC_018413	TATGAT	2	12	224144	224155	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401771360
106	NC_018413	CAAGTT	2	12	224746	224757	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401771361
107	NC_018413	GGGATT	2	12	225524	225535	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401771362
108	NC_018413	TCAAGA	2	12	226781	226792	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401771363
109	NC_018413	CTACTT	2	12	227068	227079	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	401771363
110	NC_018413	CCTAAA	2	12	227121	227132	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401771363
111	NC_018413	AGATTA	2	12	229188	229199	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401771363
112	NC_018413	GGTATT	2	12	229413	229424	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401771363
113	NC_018413	AATAAA	2	12	232924	232935	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	401771364
114	NC_018413	ATGCTA	2	12	233295	233306	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401771365
115	NC_018413	TCAAAA	2	12	240077	240088	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401771368
116	NC_018413	CCAAAT	2	12	241383	241394	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401771368
117	NC_018413	CATCGT	2	12	245100	245111	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401771370
118	NC_018413	CTTTGT	2	12	247791	247802	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	401771371
119	NC_018413	CAAAAA	2	12	250280	250291	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401771375
120	NC_018413	GGGATC	2	12	252123	252134	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	401771376
121	NC_018413	CAACAC	7	42	254050	254091	50 %	0 %	0 %	50 %	401771378
122	NC_018413	AATCCT	2	12	256448	256459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401771379
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234	NC_018413	TACCAG	2	12	477657	477668	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401771548
235	NC_018413	TTGGTG	2	12	478438	478449	0 %	50 %	50 %	0 %	401771549
236	NC_018413	AAAAAC	2	12	479564	479575	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401771551
237	NC_018413	AGTTGA	2	12	480058	480069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	401771551
238	NC_018413	TAATCG	2	12	481317	481328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401771551
239	NC_018413	TAAAAA	2	12	484032	484043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	401771554
240	NC_018413	CTTCAG	2	12	487001	487012	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401771557
241	NC_018413	CTGTTT	2	12	487724	487735	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	401771557
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243	NC_018413	TTTTCA	2	12	492385	492396	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401771561
244	NC_018413	AGCATG	2	12	492684	492695	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	401771561
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334	NC_018413	TTCAAC	2	12	681959	681970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401771706
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336	NC_018413	AATCTA	2	12	689422	689433	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401771716
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339	NC_018413	CCTTCA	2	12	691449	691460	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	401771717
340	NC_018413	TTTATA	2	12	700525	700536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	401771725
341	NC_018413	TGGTGA	2	12	702313	702324	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401771726
342	NC_018413	CGATCG	2	12	702891	702902	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	401771727
343	NC_018413	TTTTGT	2	12	703287	703298	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401771727
344	NC_018413	TAGCTC	2	12	703934	703945	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401771728
345	NC_018413	TGCTTC	2	12	705538	705549	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	401771729
346	NC_018413	TAATGA	2	12	705706	705717	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401771729
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348	NC_018413	AACATC	2	12	708346	708357	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401771729
349	NC_018413	TAACAT	2	12	708366	708377	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401771729
350	NC_018413	ACTATT	2	12	711128	711139	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401771730
351	NC_018413	AAATAA	2	12	711920	711931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	401771730
352	NC_018413	AAAGCT	2	12	714607	714618	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401771732
353	NC_018413	GATAAA	2	12	715551	715562	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	401771734
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376	NC_018413	TGGTTG	2	12	776399	776410	0 %	50 %	50 %	0 %	401771777
377	NC_018413	ATCCAT	2	12	780442	780453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401771780
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439	NC_018413	TCAATT	2	12	926264	926275	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401771904

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.