MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum CA06_2006.052-5-2P chromosome

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018412	ATATTT	2	12	82	93	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018412	TTTTTA	2	12	20634	20645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018412	TTAAAA	2	12	50193	50204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018412	TTATAT	3	18	61374	61391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018412	AAGCGA	2	12	81123	81134	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018412	ATATCG	2	12	83452	83463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018412	TTAGTT	2	12	132805	132816	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018412	ACAGAA	2	12	135473	135484	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018412	TTTAAC	2	12	149578	149589	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018412	ATTTTT	2	12	186654	186665	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018412	CAATAT	2	12	218112	218123	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018412	TTAATC	2	12	220717	220728	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018412	AAAACT	2	12	225777	225788	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018412	GAAAAA	2	12	253391	253402	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018412	GTTAAA	2	12	275899	275910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018412	TTTTAT	2	12	283872	283883	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018412	ATTTAA	2	12	310786	310797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018412	AGGCGA	2	12	314954	314965	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018412	AAGCGA	2	12	317061	317072	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018412	ATATCG	2	12	319392	319403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018412	TTTATA	2	12	347959	347970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018412	GCTTAT	2	12	349464	349475	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018412	TTATTT	2	12	358424	358435	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018412	GATCAT	2	12	376507	376518	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018412	ATTTAT	2	12	383559	383570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018412	ATTAAA	2	12	393818	393829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018412	TTTATT	2	12	424090	424101	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018412	CAAAAA	2	12	424121	424132	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018412	ATATTT	2	12	428949	428960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018412	TAAAAA	2	12	455898	455909	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018412	TTTGCT	2	12	470880	470891	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018412	ATCAGC	2	12	484207	484218	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018412	TTATCA	2	12	484502	484513	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018412	TTTTAT	2	12	490338	490349	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018412	AGTTGA	2	12	501520	501531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018412	ATTTTT	2	12	537286	537297	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018412	GTTTTG	2	12	556198	556209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018412	GTTTTT	2	12	556457	556468	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018412	TTAAAT	2	12	605467	605478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018412	TAGAAA	2	12	629832	629843	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018412	TTATAA	2	12	647543	647554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018412	GTTTTT	2	12	661904	661915	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018412	TAAAAA	2	12	670748	670759	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018412	TGCAAA	2	12	674877	674888	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018412	TATTTA	2	12	701428	701439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018412	TTTAAT	2	12	706370	706381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018412	TTCGAT	2	12	706538	706549	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018412	AAAATA	2	12	717317	717328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018412	AAAGAT	2	12	797183	797194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018412	AAAGAT	2	12	799612	799623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018412	GAAAAT	2	12	814511	814522	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018412	ATCTAG	2	12	815786	815797	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018412	TGTTCT	2	12	816594	816605	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018412	TCGCCT	2	12	849653	849664	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018412	ATATTT	2	12	858664	858675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018412	TGATAA	2	12	876443	876454	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018412	TATAAA	2	12	883257	883268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018412	CAATAA	2	12	901404	901415	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018412	ATTAAA	2	12	901890	901901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018412	CTAAAC	2	12	912932	912943	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018412	TTAATC	2	12	922293	922304	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018412	TCAGAA	2	12	922734	922745	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018412	AACCTG	2	12	927870	927881	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018412	AACTAA	2	12	953730	953741	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.