MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum CA06_2006.052-5-2P chromosome

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018412	AAAAC	2	10	823	832	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018412	ATCAT	2	10	1086	1095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018412	AAAGT	2	10	1574	1583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018412	ATATT	2	10	1851	1860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018412	AGTTA	2	10	30062	30071	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018412	ATTTT	2	10	36628	36637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018412	TTAAT	2	10	49805	49814	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018412	TTAGC	2	10	63802	63811	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018412	TTTAT	2	10	64354	64363	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018412	GCAAA	2	10	68424	68433	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018412	CTAAA	2	10	78883	78892	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018412	TTTAA	2	10	80099	80108	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018412	CAAAC	2	10	80200	80209	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018412	ATCAA	2	10	80414	80423	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018412	ATATA	2	10	80429	80438	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018412	CTCAT	2	10	82990	82999	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018412	CTTCC	2	10	83264	83273	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_018412	TAATA	2	10	87003	87012	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018412	TAAAA	2	10	94933	94942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018412	ATATA	2	10	105257	105266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018412	GAGAT	2	10	118482	118491	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018412	ATCTC	2	10	118508	118517	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018412	GTTTT	2	10	118674	118683	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018412	ACATA	2	10	122763	122772	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018412	TTTGC	2	10	122890	122899	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018412	ATTTT	2	10	132792	132801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018412	TATTT	2	10	134290	134299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018412	TTACT	2	10	134770	134779	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018412	AATTA	2	10	134974	134983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018412	GTTAA	2	10	136145	136154	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018412	ATCAA	2	10	136300	136309	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018412	CATTA	2	10	136690	136699	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018412	TAAAT	2	10	141277	141286	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018412	GTTAG	2	10	149566	149575	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018412	CATTT	2	10	150016	150025	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018412	TCTTA	2	10	169386	169395	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018412	TTTTA	2	10	174703	174712	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018412	TAAAG	2	10	180004	180013	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018412	TTTTA	2	10	181519	181528	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018412	TGATC	2	10	182961	182970	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018412	TAAAA	2	10	201918	201927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018412	TAGCT	2	10	202726	202735	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018412	TATAT	2	10	210738	210747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018412	TCTTT	2	10	250926	250935	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018412	TAGTT	2	10	273340	273349	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018412	TATTT	2	10	274342	274351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018412	CTAAC	2	10	275913	275922	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_018412	AGAGA	2	10	300994	301003	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018412	ATATT	2	10	306765	306774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018412	AGTTA	2	10	306877	306886	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018412	TAATT	2	10	309051	309060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018412	TCTAG	2	10	314876	314885	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018412	TCGTG	2	10	315295	315304	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018412	TAGGG	2	10	315676	315685	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018412	ATCAA	2	10	316352	316361	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018412	ATATA	2	10	316367	316376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018412	CTCAT	2	10	318929	318938	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_018412	CTTCC	2	10	319203	319212	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_018412	AATTA	2	10	344304	344313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018412	ATTAT	2	10	344333	344342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018412	ATTTA	2	10	348019	348028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018412	TAAAT	2	10	349106	349115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018412	ATTAA	2	10	349117	349126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018412	TATAT	2	10	352090	352099	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018412	AGTTA	2	10	356833	356842	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018412	ATTTT	2	10	359266	359275	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018412	ATTAA	2	10	367288	367297	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018412	AAATT	2	10	367402	367411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018412	TAGTT	2	10	369676	369685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018412	TAAAA	2	10	374210	374219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018412	AAGTT	2	10	374496	374505	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018412	AAATT	2	10	385017	385026	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018412	AAGAA	2	10	403748	403757	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018412	ATATA	2	10	428930	428939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018412	GTCAG	2	10	430722	430731	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018412	TTACT	2	10	458341	458350	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018412	TATCA	2	10	460826	460835	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018412	ATCTA	2	10	471053	471062	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018412	TTAAC	2	10	472663	472672	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018412	TAAAA	2	10	490305	490314	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018412	TAATT	2	10	499662	499671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018412	TAAAA	2	10	540548	540557	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018412	ATCTT	2	10	541364	541373	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018412	ATTTA	2	10	545865	545874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018412	AAATT	2	10	556297	556306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018412	TTAGT	2	10	556343	556352	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018412	ATTTT	2	10	558965	558974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018412	TTAAA	2	10	589759	589768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018412	ATCAA	2	10	591327	591336	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018412	TTTAT	2	10	597897	597906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018412	TAGTC	2	10	598450	598459	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018412	TAATT	2	10	599179	599188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018412	TGAAA	2	10	603651	603660	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018412	AAATT	2	10	605366	605375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018412	ATTTA	2	10	605390	605399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018412	AAATC	2	10	606682	606691	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018412	TAATT	2	10	610656	610665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018412	CATTT	2	10	617845	617854	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018412	AAATG	2	10	617861	617870	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018412	TATTT	2	10	630057	630066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018412	TTAAT	2	10	641410	641419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018412	AAATA	2	10	643008	643017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018412	CTTAT	2	10	644282	644291	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018412	ATTAT	2	10	647439	647448	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018412	TTAAC	2	10	661712	661721	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018412	TAATA	2	10	674698	674707	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018412	TTTAA	2	10	675123	675132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018412	AGATC	2	10	699265	699274	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018412	TTAAG	2	10	701200	701209	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018412	TTTTG	2	10	701241	701250	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018412	ATTTA	2	10	706894	706903	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018412	ATTTA	2	10	707107	707116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018412	CAAAA	2	10	717239	717248	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018412	TATAA	2	10	722142	722151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018412	AAATT	2	10	725172	725181	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018412	TATTT	2	10	731580	731589	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018412	CCAAA	2	10	794725	794734	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_018412	AAAAG	2	10	815610	815619	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018412	TTTTC	2	10	816450	816459	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018412	TTTTA	2	10	835078	835087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018412	ATTAA	2	10	844456	844465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018412	CCCTA	2	10	848933	848942	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
123	NC_018412	CACGA	2	10	849314	849323	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_018412	CTAGA	2	10	849733	849742	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018412	TATCT	2	10	859335	859344	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018412	ACTTC	2	10	867568	867577	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_018412	AAAGC	2	10	875462	875471	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018412	AGAAA	2	10	875625	875634	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018412	AGATC	2	10	880710	880719	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018412	TTAAT	2	10	886694	886703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018412	CAATT	2	10	895220	895229	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018412	AATTA	2	10	902667	902676	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018412	AATTA	2	10	902799	902808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018412	AATCA	2	10	922825	922834	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018412	ACAAA	2	10	927745	927754	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018412	ATAGC	2	10	934173	934182	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018412	TCCTT	2	10	934316	934325	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_018412	AATTT	2	10	934524	934533	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018412	AATCA	2	10	948456	948465	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018412	TAACC	2	10	963590	963599	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.