MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum NC06_2006.080-5-2P chromosome

Total Repeats: 441

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018411	AACTAA	2	12	4203	4214	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401769659
2	NC_018411	GCAATC	2	12	5891	5902	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401769661
3	NC_018411	GATCTT	2	12	6134	6145	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401769662
4	NC_018411	AGAAAA	2	12	8483	8494	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401769665
5	NC_018411	AATCTT	2	12	9862	9873	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769667
6	NC_018411	CTGATA	2	12	13994	14005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401769671
7	NC_018411	ACCTGA	2	12	19972	19983	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401769675
8	NC_018411	TAAGAA	2	12	21362	21373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	401769677
9	NC_018411	CATTAG	2	12	22255	22266	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401769678
10	NC_018411	TCAAGA	2	12	25311	25322	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401769679
11	NC_018411	TTAATG	2	12	25792	25803	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401769679
12	NC_018411	CAAAGA	2	12	27039	27050	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401769679
13	NC_018411	TGATCT	2	12	27998	28009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401769679
14	NC_018411	ATTATC	2	12	32727	32738	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769685
15	NC_018411	GCTAAA	2	12	33523	33534	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401769685
16	NC_018411	AACTAA	2	12	34505	34516	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401769685
17	NC_018411	AAGCAA	2	12	35619	35630	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401769687
18	NC_018411	AGCTAA	2	12	37601	37612	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401769689
19	NC_018411	AATAAC	2	12	41080	41091	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401769690
20	NC_018411	CATTAG	2	12	44928	44939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401769693
21	NC_018411	TTAAGA	2	12	47541	47552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401769695
22	NC_018411	AATCTT	2	12	47932	47943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769695
23	NC_018411	CTAAAG	2	12	52397	52408	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401769697
24	NC_018411	AATCGT	2	12	56523	56534	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401769700
25	NC_018411	TTGAGC	2	12	57669	57680	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	401769702
26	NC_018411	ACCTAA	2	12	58233	58244	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401769702
27	NC_018411	AAACCA	2	12	60402	60413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	401769704
28	NC_018411	AAAATC	2	12	65960	65971	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401769708
29	NC_018411	AAGAAA	2	12	68572	68583	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401769713
30	NC_018411	TTTATG	2	12	69812	69823	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401769715
31	NC_018411	AACAAA	2	12	70779	70790	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401769716
32	NC_018411	AGGTAA	2	12	71095	71106	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	401769717
33	NC_018411	AGTTAA	2	12	72636	72647	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401769721
34	NC_018411	TAAAGG	2	12	74378	74389	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	401769725
35	NC_018411	CTATTT	2	12	85128	85139	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401769733
36	NC_018411	AATATT	2	12	85811	85822	50 %	50 %	0 %	0 %	401769733
37	NC_018411	AATAAA	2	12	87310	87321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	401769734
38	NC_018411	ATTTAG	2	12	87353	87364	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401769734
39	NC_018411	AATGTT	2	12	89455	89466	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401769735
40	NC_018411	AATCTT	2	12	91538	91549	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769737
41	NC_018411	TCACGA	2	12	91601	91612	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401769737
42	NC_018411	AAGAAA	2	12	98300	98311	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401769743
43	NC_018411	CTTGAT	2	12	100809	100820	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401769745
44	NC_018411	TATATC	2	12	102094	102105	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769745
45	NC_018411	GTGCAA	2	12	104253	104264	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	401769746
46	NC_018411	AAAACA	2	12	106861	106872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401769748
47	NC_018411	CAAAAG	2	12	109530	109541	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401769751
48	NC_018411	GTTTTA	2	12	110450	110461	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401769752
49	NC_018411	TTAAAG	2	12	114553	114564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401769753
50	NC_018411	TAGAAG	2	12	117328	117339	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	401769754
51	NC_018411	TTTTCT	2	12	119192	119203	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	401769755
52	NC_018411	ATCCAT	2	12	119749	119760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401769755
53	NC_018411	ATTAAT	2	12	124092	124103	50 %	50 %	0 %	0 %	401769757
54	NC_018411	CTTTAA	2	12	127296	127307	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769763
55	NC_018411	ATAAAT	2	12	129506	129517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	401769765
56	NC_018411	AATTAC	2	12	138808	138819	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401769774
57	NC_018411	CTCGAT	3	18	140962	140979	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401769775
58	NC_018411	GAACAA	2	12	143008	143019	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401769776
59	NC_018411	AAAAAG	2	12	143171	143182	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401769776
60	NC_018411	GACAAA	2	12	143335	143346	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401769776
61	NC_018411	AAAACA	2	12	144852	144863	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401769778
62	NC_018411	TAATAT	2	12	144987	144998	50 %	50 %	0 %	0 %	401769778
63	NC_018411	ATTTAA	2	12	148598	148609	50 %	50 %	0 %	0 %	401769783
64	NC_018411	TGTTAA	2	12	151378	151389	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401769785
65	NC_018411	TTTGAT	2	12	152787	152798	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401769787
66	NC_018411	TAAATC	2	12	154924	154935	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401769788
67	NC_018411	TTAGAT	2	12	157124	157135	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401769789
68	NC_018411	TGGTGA	2	12	158610	158621	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401769790
69	NC_018411	AATCTA	2	12	163334	163345	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401769796
70	NC_018411	TTAAAG	2	12	163910	163921	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401769797
71	NC_018411	AAAGCT	2	12	165595	165606	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401769797
72	NC_018411	ATTGGT	2	12	171101	171112	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401769802
73	NC_018411	ACATTC	2	12	171563	171574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401769802
74	NC_018411	ATTCTT	2	12	171919	171930	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401769802
75	NC_018411	CAGGTG	2	12	175854	175865	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	401769805
76	NC_018411	GAAAAA	2	12	176012	176023	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401769805
77	NC_018411	TTACTA	2	12	180324	180335	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769813
78	NC_018411	GGTTTA	2	12	181351	181362	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401769815
79	NC_018411	ATAATC	2	12	181482	181493	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401769815
80	NC_018411	ATTTAA	2	12	181738	181749	50 %	50 %	0 %	0 %	401769817
81	NC_018411	GATTTT	2	12	184061	184072	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401769819
82	NC_018411	CTTTAA	2	12	184086	184097	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769819
83	NC_018411	CTTTAT	2	12	186018	186029	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401769821
84	NC_018411	TTTTGT	2	12	187201	187212	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401769822
85	NC_018411	TTTATT	2	12	191378	191389	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401769827
86	NC_018411	AGAAAA	2	12	192367	192378	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401769827
87	NC_018411	TTTTGT	2	12	192565	192576	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401769828
88	NC_018411	TTTATT	2	12	196742	196753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401769833
89	NC_018411	AGAAAA	2	12	197731	197742	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401769833
90	NC_018411	TTTTGT	2	12	197929	197940	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401769834
91	NC_018411	ACTTAA	2	12	198514	198525	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401769834
92	NC_018411	CTTGGG	2	12	199834	199845	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	401769835
93	NC_018411	ATCTTA	2	12	199941	199952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769835
94	NC_018411	TATCAT	2	12	201128	201139	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769836
95	NC_018411	TACTGA	2	12	201715	201726	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401769837
96	NC_018411	AAATGA	2	12	205596	205607	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	401769839
97	NC_018411	CAAAAA	2	12	206324	206335	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401769839
98	NC_018411	TTTATT	2	12	207652	207663	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401769840
99	NC_018411	AAAAGA	2	12	214340	214351	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401769845
100	NC_018411	ATCAAA	2	12	214453	214464	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401769845
101	NC_018411	AAATTA	2	12	217649	217660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	401769848
102	NC_018411	GGGTTT	2	12	219007	219018	0 %	50 %	50 %	0 %	401769850
103	NC_018411	TAAATT	2	12	222711	222722	50 %	50 %	0 %	0 %	401769852
104	NC_018411	TATGAT	2	12	224149	224160	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401769852
105	NC_018411	CAAGTT	2	12	224751	224762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401769853
106	NC_018411	GGGATT	2	12	225529	225540	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401769854
107	NC_018411	TCAAGA	2	12	226786	226797	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401769855
108	NC_018411	CTACTT	2	12	227073	227084	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	401769855
109	NC_018411	CCTAAA	2	12	227126	227137	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401769855
110	NC_018411	AGATTA	2	12	229196	229207	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401769855
111	NC_018411	GGTATT	2	12	229421	229432	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401769855
112	NC_018411	AATAAA	2	12	232932	232943	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	401769856
113	NC_018411	ATGCTA	2	12	233303	233314	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401769857
114	NC_018411	TCAAAA	2	12	240085	240096	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401769860
115	NC_018411	CCAAAT	2	12	241391	241402	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401769860
116	NC_018411	CATCGT	2	12	245108	245119	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401769862
117	NC_018411	CTTTGT	2	12	247799	247810	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	401769863
118	NC_018411	CAAAAA	2	12	250288	250299	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401769867
119	NC_018411	GGGATC	2	12	252131	252142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	401769868
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233	NC_018411	AAAAAC	2	12	479602	479613	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401770044
234	NC_018411	AGTTGA	2	12	480096	480107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	401770044
235	NC_018411	TAATCG	2	12	481355	481366	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401770044
236	NC_018411	TAAAAA	2	12	484072	484083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	401770047
237	NC_018411	CTTCAG	2	12	487041	487052	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401770050
238	NC_018411	CTGTTT	2	12	487764	487775	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	401770050
239	NC_018411	ATCAAA	2	12	490153	490164	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401770052
240	NC_018411	TTTTCA	2	12	492425	492436	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401770054
241	NC_018411	AGCATG	2	12	492724	492735	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	401770054
242	NC_018411	TAACAA	2	12	495524	495535	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401770057
243	NC_018411	TGAACG	2	12	501240	501251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	401770062
244	NC_018411	TCTTGT	2	12	503678	503689	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	401770065
245	NC_018411	AGCTTT	2	12	503881	503892	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401770065
246	NC_018411	GTAGCA	2	12	508042	508053	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	401770069
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249	NC_018411	TGCTCA	2	12	511315	511326	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401770071
250	NC_018411	ACAAAA	2	12	511352	511363	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401770071
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252	NC_018411	AACTAA	2	12	520192	520203	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401770080
253	NC_018411	CTTACC	2	12	521596	521607	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	401770080
254	NC_018411	ACAGTT	2	12	528292	528303	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401770085
255	NC_018411	ATTTTA	2	12	530167	530178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	401770086
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258	NC_018411	TGAGCC	2	12	533463	533474	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	401770087
259	NC_018411	TTATCA	2	12	535435	535446	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401770088
260	NC_018411	TTGGAT	2	12	536822	536833	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401770088
261	NC_018411	TCTGTT	2	12	538112	538123	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	401770089
262	NC_018411	GGAGTT	2	12	539204	539215	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401770089
263	NC_018411	GTTGGA	6	36	546433	546468	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401770093
264	NC_018411	AGCTGA	2	12	548192	548203	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	401770094
265	NC_018411	TGTTGG	2	12	548222	548233	0 %	50 %	50 %	0 %	401770094
266	NC_018411	GGGTTC	2	12	549177	549188	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	401770094
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269	NC_018411	TGGTTG	2	12	557853	557864	0 %	50 %	50 %	0 %	401770098
270	NC_018411	TTGATG	2	12	561790	561801	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401770101
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274	NC_018411	AGTCTT	2	12	570609	570620	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401770110
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322	NC_018411	GATCTT	2	12	667639	667650	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401770189
323	NC_018411	AGCTTT	2	12	670084	670095	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401770190
324	NC_018411	TTGAAT	2	12	674034	674045	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401770190
325	NC_018411	CACGGT	2	12	675573	675584	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	401770191
326	NC_018411	TCATGA	2	12	675930	675941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401770191
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329	NC_018411	TTCGAT	2	12	682531	682542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401770197
330	NC_018411	GACCAC	2	12	685702	685713	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	401770201
331	NC_018411	TACTGC	2	12	686891	686902	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401770201
332	NC_018411	TTCAAC	2	12	686927	686938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401770201
333	NC_018411	CGTGAC	2	12	688396	688407	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	401770204
334	NC_018411	AATCTA	2	12	694390	694401	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401770211
335	NC_018411	ATTTGA	2	12	695150	695161	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401770211
336	NC_018411	TGCTTC	2	12	696368	696379	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	401770212
337	NC_018411	CCTTCA	2	12	696417	696428	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	401770212
338	NC_018411	TTTATA	2	12	705493	705504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	401770220
339	NC_018411	TGGTGA	2	12	707281	707292	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401770221
340	NC_018411	CGATCG	2	12	707858	707869	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	401770222
341	NC_018411	TTTTGT	2	12	708254	708265	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401770222
342	NC_018411	TAGCTC	2	12	708901	708912	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401770223
343	NC_018411	TGCTTC	2	12	710505	710516	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	401770224
344	NC_018411	TAATGA	2	12	710673	710684	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401770224
345	NC_018411	TTCAAA	2	12	712520	712531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401770224
346	NC_018411	AACATC	2	12	713313	713324	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401770224
347	NC_018411	TAACAT	2	12	713333	713344	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401770224
348	NC_018411	ACTATT	2	12	716104	716115	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401770225
349	NC_018411	AAATAA	2	12	716896	716907	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	401770225
350	NC_018411	AAAGCT	2	12	719583	719594	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401770227
351	NC_018411	GATAAA	2	12	720527	720538	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	401770229
352	NC_018411	TTTTTG	2	12	727765	727776	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401770231
353	NC_018411	TTTTTG	2	12	733463	733474	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401770236
354	NC_018411	CATAAC	2	12	741362	741373	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401770242
355	NC_018411	GATATA	2	12	747996	748007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401770249
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360	NC_018411	TTAGTT	2	12	752500	752511	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401770253
361	NC_018411	AGTGCT	2	12	754203	754214	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	401770255
362	NC_018411	AGTTGA	2	12	758723	758734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	401770260
363	NC_018411	AAATTT	2	12	763966	763977	50 %	50 %	0 %	0 %	401770263
364	NC_018411	CATTTG	2	12	764027	764038	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401770263
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367	NC_018411	GTTGTA	21	126	765247	765372	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401770263
368	NC_018411	TTATCA	2	12	766504	766515	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401770264
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371	NC_018411	GGAGTT	2	12	770279	770290	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401770265
372	NC_018411	TGTAGT	2	12	776404	776415	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401770268
373	NC_018411	AGCTGA	2	12	779196	779207	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	401770269
374	NC_018411	TGTTGG	2	12	779226	779237	0 %	50 %	50 %	0 %	401770269
375	NC_018411	GGGTTC	2	12	780178	780189	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	401770269
376	NC_018411	GTTGGA	2	12	783760	783771	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401770271
377	NC_018411	TGGTGC	2	12	786281	786292	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	401770272
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379	NC_018411	ATCCAT	2	12	792897	792908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401770276
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