MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma gallisepticum WI01_2001.043-13-2P chromosome

Total Repeats: 506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018410	ATATTT	2	12	82	93	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018410	AACTAA	2	12	4203	4214	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401768912
3	NC_018410	GCAATC	2	12	5891	5902	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401768914
4	NC_018410	GATCTT	2	12	6134	6145	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401768915
5	NC_018410	AGAAAA	2	12	8483	8494	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401768918
6	NC_018410	AATCTT	2	12	9862	9873	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401768920
7	NC_018410	CTGATA	2	12	13994	14005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401768924
8	NC_018410	ACCTGA	2	12	19971	19982	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401768928
9	NC_018410	TTTTTA	2	12	20634	20645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018410	TAAGAA	2	12	21361	21372	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	401768930
11	NC_018410	CATTAG	2	12	22254	22265	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401768931
12	NC_018410	TCAAGA	2	12	25310	25321	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401768932
13	NC_018410	TTAATG	2	12	25791	25802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401768932
14	NC_018410	CAAAGA	2	12	27038	27049	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401768932
15	NC_018410	TGATCT	2	12	27997	28008	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401768932
16	NC_018410	ATTATC	2	12	32726	32737	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401768938
17	NC_018410	GCTAAA	2	12	33522	33533	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401768938
18	NC_018410	AACTAA	2	12	34504	34515	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401768938
19	NC_018410	AAGCAA	2	12	35618	35629	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401768940
20	NC_018410	AGCTAA	2	12	37600	37611	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401768942
21	NC_018410	AATAAC	2	12	41079	41090	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401768943
22	NC_018410	CATTAG	2	12	44936	44947	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401768946
23	NC_018410	TTAAGA	2	12	47549	47560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401768948
24	NC_018410	AATCTT	2	12	47940	47951	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401768948
25	NC_018410	TTAAAA	2	12	50202	50213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018410	CTAAAG	2	12	52405	52416	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401768950
27	NC_018410	AATCGT	2	12	56531	56542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401768953
28	NC_018410	TTGAGC	2	12	57677	57688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	401768955
29	NC_018410	ACCTAA	2	12	58241	58252	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401768955
30	NC_018410	AAACCA	2	12	60410	60421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	401768957
31	NC_018410	TTATAT	3	18	61385	61402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018410	AAAATC	2	12	65968	65979	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401768961
33	NC_018410	AAGAAA	2	12	68579	68590	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401768966
34	NC_018410	TTTATG	2	12	69819	69830	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401768968
35	NC_018410	AACAAA	2	12	70786	70797	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401768969
36	NC_018410	AGGTAA	2	12	71102	71113	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	401768970
37	NC_018410	AGTTAA	2	12	72643	72654	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401768974
38	NC_018410	TAAAGG	2	12	74385	74396	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	401768978
39	NC_018410	AAGCGA	2	12	81134	81145	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018410	ATATCG	2	12	83464	83475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018410	CTATTT	2	12	85135	85146	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401768986
42	NC_018410	AATATT	2	12	85818	85829	50 %	50 %	0 %	0 %	401768986
43	NC_018410	AATAAA	2	12	87317	87328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	401768987
44	NC_018410	ATTTAG	2	12	87360	87371	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401768987
45	NC_018410	AATGTT	2	12	89462	89473	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401768988
46	NC_018410	AATCTT	2	12	91545	91556	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401768990
47	NC_018410	TCACGA	2	12	91608	91619	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401768990
48	NC_018410	AAGAAA	2	12	98308	98319	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401768996
49	NC_018410	CTTGAT	2	12	100817	100828	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401768998
50	NC_018410	TATATC	2	12	102102	102113	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401768998
51	NC_018410	GTGCAA	2	12	104261	104272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	401768999
52	NC_018410	AAAACA	2	12	106869	106880	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401769001
53	NC_018410	CAAAAG	2	12	109538	109549	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401769004
54	NC_018410	GTTTTA	2	12	110458	110469	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401769005
55	NC_018410	TTAAAG	2	12	114561	114572	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401769006
56	NC_018410	TAGAAG	2	12	117336	117347	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	401769007
57	NC_018410	TTTTCT	2	12	119200	119211	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	401769008
58	NC_018410	ATCCAT	2	12	119757	119768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401769008
59	NC_018410	ATTAAT	2	12	124030	124041	50 %	50 %	0 %	0 %	401769010
60	NC_018410	CTTTAA	2	12	127234	127245	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769016
61	NC_018410	ATAAAT	2	12	129444	129455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	401769018
62	NC_018410	TTAGTT	2	12	132827	132838	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018410	ACAGAA	2	12	135493	135504	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018410	AATTAC	2	12	138745	138756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401769027
65	NC_018410	CTCGAT	3	18	140899	140916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401769028
66	NC_018410	GAACAA	2	12	142945	142956	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401769029
67	NC_018410	AAAAAG	2	12	143108	143119	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401769029
68	NC_018410	GACAAA	2	12	143272	143283	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401769029
69	NC_018410	AAAACA	2	12	144789	144800	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401769031
70	NC_018410	TAATAT	2	12	144924	144935	50 %	50 %	0 %	0 %	401769031
71	NC_018410	TTTAAC	2	12	149599	149610	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018410	TGTTAA	2	12	150964	150975	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401769038
73	NC_018410	TTTGAT	2	12	152373	152384	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401769040
74	NC_018410	TAAATC	2	12	154510	154521	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401769041
75	NC_018410	TTAGAT	2	12	156710	156721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401769042
76	NC_018410	TGGTGA	2	12	158196	158207	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401769043
77	NC_018410	AATCTA	2	12	162920	162931	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401769049
78	NC_018410	TTAAAG	2	12	163496	163507	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401769050
79	NC_018410	AAAGCT	2	12	165181	165192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401769050
80	NC_018410	ATTGGT	2	12	170687	170698	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401769055
81	NC_018410	ACATTC	2	12	171149	171160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401769055
82	NC_018410	ATTCTT	2	12	171505	171516	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401769055
83	NC_018410	CAGGTG	2	12	175440	175451	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	401769058
84	NC_018410	GAAAAA	2	12	175598	175609	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401769058
85	NC_018410	TTACTA	2	12	179910	179921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769066
86	NC_018410	GGTTTA	2	12	180937	180948	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401769068
87	NC_018410	ATAATC	2	12	181068	181079	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401769068
88	NC_018410	ATTTAA	2	12	181324	181335	50 %	50 %	0 %	0 %	401769070
89	NC_018410	GATTTT	2	12	183647	183658	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	401769072
90	NC_018410	CTTTAA	2	12	183672	183683	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769072
91	NC_018410	CTTTAT	2	12	185604	185615	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401769074
92	NC_018410	ATTTTT	2	12	186674	186685	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018410	TTTTGT	2	12	186787	186798	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401769075
94	NC_018410	TTTATT	2	12	190964	190975	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401769080
95	NC_018410	AGAAAA	2	12	191953	191964	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401769080
96	NC_018410	TTTTGT	2	12	192152	192163	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401769081
97	NC_018410	TTTATT	2	12	196329	196340	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401769086
98	NC_018410	AGAAAA	2	12	197318	197329	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401769086
99	NC_018410	TTTTGT	2	12	197516	197527	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401769087
100	NC_018410	ACTTAA	2	12	198101	198112	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401769087
101	NC_018410	CTTGGG	2	12	199421	199432	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	401769088
102	NC_018410	ATCTTA	2	12	199528	199539	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769088
103	NC_018410	TATCAT	2	12	200715	200726	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769089
104	NC_018410	TACTGA	2	12	201302	201313	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401769090
105	NC_018410	AAATGA	2	12	205183	205194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	401769092
106	NC_018410	CAAAAA	2	12	205911	205922	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401769092
107	NC_018410	AAACAA	2	12	206702	206713	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401769093
108	NC_018410	TTTATT	2	12	207239	207250	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	401769093
109	NC_018410	AAAAGA	2	12	213927	213938	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	401769098
110	NC_018410	ATCAAA	2	12	214040	214051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401769098
111	NC_018410	AAATTA	2	12	217236	217247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	401769101
112	NC_018410	CAATAT	2	12	218132	218143	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018410	GGGTTT	2	12	218594	218605	0 %	50 %	50 %	0 %	401769103
114	NC_018410	TTAATC	2	12	220737	220748	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018410	TAAATT	2	12	222298	222309	50 %	50 %	0 %	0 %	401769105
116	NC_018410	TATGAT	2	12	223736	223747	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401769105
117	NC_018410	CAAGTT	2	12	224338	224349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401769106
118	NC_018410	GGGATT	2	12	225116	225127	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401769107
119	NC_018410	AAAACT	2	12	225797	225808	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018410	TCAAGA	2	12	226373	226384	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	401769108
121	NC_018410	CTACTT	2	12	226660	226671	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	401769108
122	NC_018410	CCTAAA	2	12	226713	226724	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401769108
123	NC_018410	AGATTA	2	12	228786	228797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401769108
124	NC_018410	GGTATT	2	12	229011	229022	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401769108
125	NC_018410	AATAAA	2	12	232522	232533	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	401769109
126	NC_018410	ATGCTA	2	12	232893	232904	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401769110
127	NC_018410	TCAAAA	2	12	239675	239686	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	401769113
128	NC_018410	CCAAAT	2	12	240981	240992	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	401769113
129	NC_018410	CATCGT	2	12	244698	244709	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	401769115
130	NC_018410	CTTTGT	2	12	247389	247400	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	401769116
131	NC_018410	CAAAAA	2	12	249878	249889	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	401769120
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133	NC_018410	GAAAAA	2	12	253413	253424	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018410	CAACAC	5	30	253648	253677	50 %	0 %	0 %	50 %	401769123
135	NC_018410	AATCCT	2	12	256031	256042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401769124
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142	NC_018410	TAAAAA	2	12	262753	262764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018410	CAACTT	2	12	263594	263605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401769127
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148	NC_018410	GTTAAA	2	12	273029	273040	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018410	TTTACT	2	12	277313	277324	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401769138
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152	NC_018410	TTTTAT	2	12	281003	281014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018410	GATTAA	2	12	281792	281803	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401769144
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172	NC_018410	TGCTAA	2	12	317390	317401	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401769161
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353	NC_018410	TTTCAC	2	12	635859	635870	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	401769419
354	NC_018410	TGCAAA	2	12	638088	638099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
355	NC_018410	AAACTT	2	12	638915	638926	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401769424
356	NC_018410	TTTATC	2	12	641768	641779	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401769426
357	NC_018410	GCAATC	2	12	642318	642329	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401769426
358	NC_018410	TTGTTT	2	12	642572	642583	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	401769426
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360	NC_018410	TATCAA	2	12	642967	642978	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401769426
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362	NC_018410	CGTTAT	2	12	648085	648096	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401769429
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370	NC_018410	TTAATC	2	12	669144	669155	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769442
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372	NC_018410	TTTAAT	2	12	669580	669591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
373	NC_018410	TTCGAT	2	12	669748	669759	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401769443
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378	NC_018410	AAAATA	2	12	680524	680535	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
379	NC_018410	AATCTA	2	12	681604	681615	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401769457
380	NC_018410	ATTTGA	2	12	682364	682375	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	401769457
381	NC_018410	TGCTTC	2	12	683564	683575	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	401769458
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384	NC_018410	TGGTGA	2	12	694477	694488	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401769467
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419	NC_018410	AAAGAT	2	12	762741	762752	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
420	NC_018410	GTTGGA	2	12	763538	763549	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	401769515
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423	NC_018410	AAAGAT	2	12	769817	769828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_018410	TGGTGC	2	12	773117	773128	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	401769519
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430	NC_018410	ATCCAT	2	12	779697	779708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	401769523
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442	NC_018410	AAAGAT	2	12	821358	821369	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	401769567
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447	NC_018410	ATGCTT	2	12	839481	839492	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401769583
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452	NC_018410	AAGATT	2	12	846264	846275	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	401769588
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454	NC_018410	ATTGGT	2	12	850582	850593	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	401769593
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458	NC_018410	CAATGT	2	12	862904	862915	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	401769601
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461	NC_018410	AAGAAC	2	12	865109	865120	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
462	NC_018410	TCTTAA	2	12	867302	867313	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769602
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467	NC_018410	CTAAAC	2	12	876363	876374	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
468	NC_018410	TTGATC	2	12	877079	877090	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	401769610
469	NC_018410	AAGCAA	2	12	879637	879648	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	401769610
470	NC_018410	TAAAGA	2	12	880847	880858	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	401769611
471	NC_018410	CATTAA	2	12	881062	881073	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	401769611
472	NC_018410	ATTACT	2	12	881168	881179	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	401769611
473	NC_018410	AATGAG	2	12	882012	882023	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	401769611
474	NC_018410	TCTTTA	2	12	884953	884964	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	401769612
475	NC_018410	TTAATC	2	12	885724	885735	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
476	NC_018410	TCAGAA	2	12	886165	886176	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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478	NC_018410	AACCTG	2	12	891300	891311	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	401769619
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481	NC_018410	TAAAAG	2	12	896581	896592	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	401769624
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500	NC_018410	TTATAT	2	12	925758	925769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	401769644

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