MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum WI01_2001.043-13-2P chromosome

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018410	AAAAC	2	10	824	833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018410	ATCAT	2	10	1087	1096	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018410	AAAGT	2	10	1575	1584	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018410	ATATT	2	10	1852	1861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018410	AGTTA	2	10	30062	30071	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018410	ATTTT	2	10	36628	36637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018410	TTAAT	2	10	49814	49823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018410	TTAGC	2	10	63813	63822	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018410	TTTAT	2	10	64365	64374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018410	GCAAA	2	10	68435	68444	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018410	CTAAA	2	10	78894	78903	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018410	TTTAA	2	10	80110	80119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018410	CAAAC	2	10	80211	80220	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018410	ATCAA	2	10	80425	80434	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018410	ATATA	2	10	80440	80449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018410	CTCAT	2	10	83001	83010	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018410	CTTCC	2	10	83275	83284	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_018410	TAATA	2	10	87015	87024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018410	TAAAA	2	10	94945	94954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018410	ATATA	2	10	105269	105278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018410	GAGAT	2	10	118494	118503	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018410	ATCTC	2	10	118520	118529	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018410	GTTTT	2	10	118685	118694	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018410	ACATA	2	10	122774	122783	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018410	TTTGC	2	10	122900	122909	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018410	ATTTT	2	10	132814	132823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018410	TATTT	2	10	134311	134320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018410	TTACT	2	10	134790	134799	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018410	AATTA	2	10	134994	135003	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018410	TAAAT	2	10	141298	141307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018410	GTTAG	2	10	149587	149596	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018410	CATTT	2	10	150036	150045	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018410	TCTTA	2	10	169406	169415	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018410	TTTTA	2	10	174723	174732	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018410	TAAAG	2	10	180024	180033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018410	TTTTA	2	10	181539	181548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018410	TGATC	2	10	182981	182990	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018410	TAAAA	2	10	201939	201948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018410	TAGCT	2	10	202747	202756	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018410	TATAT	2	10	210758	210767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018410	TCTTT	2	10	250949	250958	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018410	GAAAA	2	10	262951	262960	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018410	TTACT	2	10	265189	265198	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018410	TAGTT	2	10	270469	270478	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018410	TATTT	2	10	271471	271480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018410	CTAAC	2	10	273043	273052	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_018410	AGAGA	2	10	298125	298134	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018410	ATATT	2	10	303896	303905	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018410	AGTTA	2	10	304008	304017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018410	TAATT	2	10	306181	306190	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018410	TCTAG	2	10	312006	312015	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018410	TCGTG	2	10	312425	312434	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018410	TAGGG	2	10	312806	312815	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018410	ATCAA	2	10	313482	313491	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018410	ATATA	2	10	313497	313506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018410	CTCAT	2	10	316058	316067	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_018410	CTTCC	2	10	316332	316341	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_018410	AATTA	2	10	341409	341418	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018410	ATTAT	2	10	341438	341447	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018410	ATTTA	2	10	345119	345128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018410	TAAAT	2	10	346206	346215	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018410	ATTAA	2	10	346217	346226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018410	TATAT	2	10	349190	349199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018410	AGTTA	2	10	353934	353943	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018410	ATTTT	2	10	356367	356376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018410	ATTAA	2	10	364389	364398	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018410	AAATT	2	10	364503	364512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018410	TAGTT	2	10	366778	366787	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018410	TAAAA	2	10	371312	371321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018410	AAGTT	2	10	371598	371607	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018410	AAATT	2	10	382090	382099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018410	AAGAA	2	10	400821	400830	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018410	ATATA	2	10	426021	426030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018410	GTCAG	2	10	427813	427822	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018410	ATCTA	2	10	438992	439001	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018410	TTAAC	2	10	440602	440611	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018410	TAAAA	2	10	458243	458252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018410	TAATT	2	10	467600	467609	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018410	TAAAA	2	10	508485	508494	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018410	ATCTT	2	10	509301	509310	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018410	ATTTA	2	10	513802	513811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018410	AAATT	2	10	524234	524243	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018410	TTAGT	2	10	524280	524289	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018410	ATTTT	2	10	526923	526932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018410	TTAAA	2	10	552974	552983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018410	ATCAA	2	10	554542	554551	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018410	TTTAT	2	10	561112	561121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018410	TAGTC	2	10	561665	561674	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018410	TAATT	2	10	562393	562402	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018410	TGAAA	2	10	566865	566874	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018410	AAATT	2	10	568580	568589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018410	ATTTA	2	10	568604	568613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018410	AAATC	2	10	569896	569905	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018410	TAATT	2	10	573870	573879	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018410	CATTT	2	10	581059	581068	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018410	AAATG	2	10	581075	581084	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018410	TATTT	2	10	593268	593277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018410	TTAAT	2	10	604621	604630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018410	AAATA	2	10	606219	606228	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018410	CTTAT	2	10	607493	607502	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018410	ATTAT	2	10	610650	610659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018410	TTAAC	2	10	624923	624932	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018410	TAATA	2	10	637909	637918	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018410	TTTAA	2	10	638334	638343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018410	AGATC	2	10	662475	662484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018410	TTAAG	2	10	664410	664419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018410	TTTTG	2	10	664451	664460	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018410	AAATC	2	10	668216	668225	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018410	ATTTA	2	10	670104	670113	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018410	ATTTA	2	10	670317	670326	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018410	CAAAA	2	10	680446	680455	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018410	TATAA	2	10	685331	685340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018410	AAATT	2	10	688361	688370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018410	TATTT	2	10	694769	694778	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018410	CCAAA	2	10	757824	757833	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_018410	AAAAG	2	10	777920	777929	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018410	TTTTC	2	10	778760	778769	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018410	TTTTA	2	10	797388	797397	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018410	ATTAA	2	10	806766	806775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018410	CCCTA	2	10	811243	811252	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
121	NC_018410	CACGA	2	10	811624	811633	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018410	CTAGA	2	10	812043	812052	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018410	TATCT	2	10	821645	821654	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018410	ACTTC	2	10	829878	829887	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_018410	AAAGC	2	10	837772	837781	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018410	AGAAA	2	10	837935	837944	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018410	AGATC	2	10	843020	843029	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018410	TTAAT	2	10	849004	849013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018410	CAATT	2	10	857530	857539	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018410	AATTA	2	10	866100	866109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018410	AATTA	2	10	866232	866241	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018410	AATCA	2	10	886256	886265	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018410	ATAGC	2	10	897602	897611	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018410	TCCTT	2	10	897745	897754	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_018410	AATTT	2	10	897953	897962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018410	AATCA	2	10	911888	911897	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018410	TAACC	2	10	927022	927031	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.