MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum NY01_2001.047-5-1P chromosome

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018409	ATATTT	2	12	82	93	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018409	TTTTTA	2	12	20635	20646	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018409	TTAAAA	2	12	50203	50214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018409	TTATAT	3	18	61384	61401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018409	AAGCGA	2	12	81134	81145	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018409	ATATCG	2	12	83464	83475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018409	TTAGTT	2	12	132816	132827	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018409	ACAGAA	2	12	135484	135495	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018409	AATTAC	2	12	138736	138747	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018409	TTTAAC	2	12	149584	149595	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018409	ATTTTT	2	12	186659	186670	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018409	ATTTTT	2	12	192018	192029	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018409	ATTTTT	2	12	197377	197388	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018409	CAATAT	2	12	223471	223482	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018409	TTAATC	2	12	226076	226087	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018409	AAAACT	2	12	231136	231147	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018409	GTTAAA	2	12	286501	286512	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018409	TTTTAT	2	12	294474	294485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018409	ATTTAA	2	12	321388	321399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018409	AGGCGA	2	12	325556	325567	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018409	AAGCGA	2	12	327663	327674	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018409	ATATCG	2	12	329993	330004	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018409	GCTTAT	2	12	360059	360070	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018409	TTATTT	2	12	369020	369031	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018409	GATCAT	2	12	387105	387116	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018409	ATTTAT	2	12	394128	394139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018409	ATTAAA	2	12	404387	404398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018409	TTTATT	2	12	434668	434679	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018409	CAAAAA	2	12	434699	434710	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018409	ATATTT	2	12	439527	439538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018409	TTTGCT	2	12	452305	452316	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018409	ATCAGC	2	12	465632	465643	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018409	TTATCA	2	12	465927	465938	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018409	TTTTAT	2	12	471762	471773	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018409	AGTTGA	2	12	482944	482955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018409	ATTTTT	2	12	518710	518721	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018409	GTTTTG	2	12	537622	537633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018409	GTTTTT	2	12	537881	537892	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018409	TTAAAT	2	12	593758	593769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018409	TAGAAA	2	12	618120	618131	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018409	TTATAA	2	12	635831	635842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018409	GTTTTT	2	12	650192	650203	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018409	TAAAAA	2	12	659036	659047	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018409	TGCAAA	2	12	663165	663176	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018409	TATTTA	2	12	689755	689766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018409	TTTAAT	2	12	694697	694708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018409	AAAATA	2	12	705641	705652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018409	AAAGAT	2	12	785409	785420	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018409	AAAGAT	2	12	787842	787853	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018409	GAAAAT	2	12	802695	802706	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018409	ATCTAG	2	12	803970	803981	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018409	TGTTCT	2	12	804778	804789	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018409	TCGCCT	2	12	837826	837837	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018409	ATATTT	2	12	846837	846848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018409	TGATAA	2	12	864616	864627	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018409	TATAAA	2	12	871430	871441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018409	CAATAA	2	12	889576	889587	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018409	ATTAAA	2	12	890722	890733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018409	AAGAAC	2	12	890970	890981	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018409	CTAAAC	2	12	902024	902035	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018409	TTAATC	2	12	911385	911396	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018409	TCAGAA	2	12	911826	911837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018409	AACTAA	2	12	942843	942854	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.