MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum NY01_2001.047-5-1P chromosome

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018409	AAAAC	2	10	824	833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018409	ATCAT	2	10	1087	1096	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018409	AAAGT	2	10	1575	1584	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018409	ATATT	2	10	1852	1861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018409	AGTTA	2	10	30063	30072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018409	ATTTT	2	10	36629	36638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018409	TTAAT	2	10	49815	49824	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018409	TTAGC	2	10	63813	63822	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018409	TTTAT	2	10	64365	64374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018409	GCAAA	2	10	68435	68444	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018409	CTAAA	2	10	78894	78903	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018409	TTTAA	2	10	80110	80119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018409	CAAAC	2	10	80211	80220	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018409	ATCAA	2	10	80425	80434	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018409	ATATA	2	10	80440	80449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018409	CTCAT	2	10	83001	83010	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018409	CTTCC	2	10	83275	83284	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_018409	TAATA	2	10	87015	87024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018409	TAAAA	2	10	94945	94954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018409	ATATA	2	10	105269	105278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018409	GAGAT	2	10	118494	118503	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018409	ATCTC	2	10	118520	118529	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018409	GTTTT	2	10	118685	118694	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018409	ACATA	2	10	122774	122783	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018409	TTTGC	2	10	122901	122910	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018409	ATTTT	2	10	132803	132812	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018409	TATTT	2	10	134301	134310	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018409	TTACT	2	10	134780	134789	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018409	AATTA	2	10	134984	134993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018409	TAAAT	2	10	141283	141292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018409	GTTAG	2	10	149572	149581	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018409	CATTT	2	10	150021	150030	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018409	TCTTA	2	10	169391	169400	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018409	TTTTA	2	10	174708	174717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018409	TAAAG	2	10	180009	180018	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018409	TTTTA	2	10	181524	181533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018409	TGATC	2	10	182966	182975	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018409	TAAAA	2	10	207275	207284	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018409	TAGCT	2	10	208083	208092	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018409	TATAT	2	10	216094	216103	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018409	TCTTT	2	10	256285	256294	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018409	TAGTT	2	10	283942	283951	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018409	TATTT	2	10	284944	284953	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018409	CTAAC	2	10	286515	286524	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_018409	AGAGA	2	10	311596	311605	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018409	ATATT	2	10	317368	317377	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018409	AGTTA	2	10	317480	317489	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018409	TAATT	2	10	319653	319662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018409	TCTAG	2	10	325478	325487	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018409	TCGTG	2	10	325897	325906	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018409	TAGGG	2	10	326278	326287	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018409	ATCAA	2	10	326954	326963	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018409	ATATA	2	10	326969	326978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018409	CTCAT	2	10	329530	329539	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_018409	CTTCC	2	10	329804	329813	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_018409	AATTA	2	10	354899	354908	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018409	ATTAT	2	10	354928	354937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018409	TAAAT	2	10	359701	359710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018409	ATTAA	2	10	359712	359721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018409	TATAT	2	10	362685	362694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018409	AGTTA	2	10	367429	367438	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018409	ATTTT	2	10	369862	369871	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018409	ATTAA	2	10	377883	377892	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018409	AAATT	2	10	377997	378006	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018409	TAGTT	2	10	380272	380281	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018409	TAAAA	2	10	384806	384815	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018409	AAGTT	2	10	385092	385101	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018409	AAATT	2	10	395586	395595	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018409	AAGAA	2	10	414308	414317	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018409	ATATA	2	10	439508	439517	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018409	GTCAG	2	10	441300	441309	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018409	ATCTA	2	10	452478	452487	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018409	TTAAC	2	10	454088	454097	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018409	TAAAA	2	10	471729	471738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018409	TAATT	2	10	481086	481095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018409	TAAAA	2	10	521972	521981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018409	ATCTT	2	10	522788	522797	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018409	ATTTA	2	10	527289	527298	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018409	AAATT	2	10	537721	537730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018409	TTAGT	2	10	537767	537776	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018409	ATTTT	2	10	540389	540398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018409	TGATA	2	10	547304	547313	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018409	AGTAA	2	10	549798	549807	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018409	TTAAA	2	10	578050	578059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018409	ATCAA	2	10	579618	579627	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018409	TTTAT	2	10	586189	586198	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018409	TAGTC	2	10	586742	586751	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_018409	TAATT	2	10	587470	587479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018409	TGAAA	2	10	591942	591951	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018409	AAATT	2	10	593657	593666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018409	ATTTA	2	10	593681	593690	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018409	AAATC	2	10	594973	594982	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018409	TAATT	2	10	598947	598956	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018409	CATTT	2	10	606136	606145	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018409	AAATG	2	10	606152	606161	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018409	TATTT	2	10	618345	618354	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018409	TTAAT	2	10	629698	629707	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018409	AAATA	2	10	631296	631305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018409	CTTAT	2	10	632570	632579	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018409	ATTAT	2	10	635727	635736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018409	TTAAC	2	10	650000	650009	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018409	TAATA	2	10	662986	662995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018409	TTTAA	2	10	663411	663420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018409	GCTAA	2	10	687080	687089	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018409	AGATC	2	10	687591	687600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018409	TTAAG	2	10	689526	689535	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018409	TTTTG	2	10	689567	689576	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018409	AAATC	2	10	693333	693342	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018409	ATTTA	2	10	695221	695230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018409	ATTTA	2	10	695434	695443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018409	CAAAA	2	10	705563	705572	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018409	TATAA	2	10	710466	710475	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018409	AAATT	2	10	713496	713505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018409	TATTT	2	10	719904	719913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018409	CCAAA	2	10	782932	782941	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_018409	AAAAG	2	10	803794	803803	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018409	TTTTC	2	10	804634	804643	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018409	TTTTA	2	10	823251	823260	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018409	ATTAA	2	10	832629	832638	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018409	CCCTA	2	10	837106	837115	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
121	NC_018409	CACGA	2	10	837487	837496	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018409	CTAGA	2	10	837906	837915	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018409	TATCT	2	10	847508	847517	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018409	AAAGC	2	10	863635	863644	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018409	AGAAA	2	10	863798	863807	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018409	AGATC	2	10	868883	868892	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018409	TTAAT	2	10	874867	874876	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018409	CAATT	2	10	883393	883402	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018409	AATTA	2	10	891895	891904	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018409	AATCA	2	10	911917	911926	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_018409	ATAGC	2	10	923270	923279	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018409	TCCTT	2	10	923413	923422	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_018409	AATTT	2	10	923621	923630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018409	AATCA	2	10	937569	937578	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018409	TAACC	2	10	952703	952712	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.