MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum NC96_1596-4-2P chromosome

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018408	ATATTT	2	12	82	93	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018408	TTTTTA	2	12	20635	20646	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018408	TTAAAA	2	12	50203	50214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018408	TTATAT	3	18	61386	61403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018408	AAGCGA	2	12	81135	81146	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018408	ATATCG	2	12	83465	83476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018408	TTAGTT	2	12	132820	132831	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018408	ACAGAA	2	12	135487	135498	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018408	TTTAAC	2	12	149599	149610	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018408	ATTTTT	2	12	186674	186685	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018408	CAATAT	2	12	223495	223506	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018408	TTAATC	2	12	226100	226111	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018408	AAAACT	2	12	231160	231171	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018408	GAAAAA	2	12	258776	258787	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018408	GTTAAA	2	12	281378	281389	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018408	TTTTAT	2	12	289351	289362	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018408	ATTTAA	2	12	316264	316275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018408	AGGCGA	2	12	320432	320443	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018408	AAGCGA	2	12	322539	322550	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018408	ATATCG	2	12	324869	324880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018408	GCTTAT	2	12	354940	354951	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018408	TTATTT	2	12	363901	363912	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018408	GATCAT	2	12	381987	381998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018408	ATTTAT	2	12	389011	389022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018408	ATTAAA	2	12	399270	399281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018408	TTTATT	2	12	429560	429571	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018408	CAAAAA	2	12	429591	429602	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018408	ATATTT	2	12	434419	434430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018408	TAAAAA	2	12	461309	461320	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018408	TTTGCT	2	12	476288	476299	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018408	ATCAGC	2	12	489615	489626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018408	TTATCA	2	12	489910	489921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018408	TTTTAT	2	12	495745	495756	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018408	AGTTGA	2	12	506927	506938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018408	ATTTTT	2	12	542692	542703	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018408	GTTTTG	2	12	561597	561608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018408	GTTTTT	2	12	561856	561867	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018408	TTAAAT	2	12	611164	611175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018408	TAGAAA	2	12	635526	635537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018408	TTATAA	2	12	653237	653248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018408	GTTTTT	2	12	667598	667609	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018408	TAAAAA	2	12	676442	676453	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018408	TGCAAA	2	12	680571	680582	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018408	TATTTA	2	12	710759	710770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018408	TTTAAT	2	12	715701	715712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018408	AAAATA	2	12	726648	726659	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018408	AAAGAT	2	12	806509	806520	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018408	AAAGAT	2	12	808954	808965	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018408	GAAAAT	2	12	823835	823846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018408	ATCTAG	2	12	825110	825121	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018408	TGTTCT	2	12	825918	825929	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018408	TCGCCT	2	12	858977	858988	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018408	ATATTT	2	12	867988	867999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018408	TATAAA	2	12	892583	892594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018408	CAATAA	2	12	910796	910807	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018408	ATTAAA	2	12	911678	911689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018408	CTAAAC	2	12	922784	922795	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018408	TTAATC	2	12	932145	932156	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018408	AACTAA	2	12	963575	963586	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.