MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum NC96_1596-4-2P chromosome

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018408	AAAAC	2	10	824	833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018408	ATCAT	2	10	1087	1096	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018408	AAAGT	2	10	1575	1584	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018408	ATATT	2	10	1852	1861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018408	AGTTA	2	10	30063	30072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018408	ATTTT	2	10	36629	36638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018408	TTAAT	2	10	49815	49824	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018408	TTAGC	2	10	63814	63823	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018408	TTTAT	2	10	64366	64375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018408	GCAAA	2	10	68436	68445	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018408	CTAAA	2	10	78895	78904	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018408	TTTAA	2	10	80111	80120	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018408	CAAAC	2	10	80212	80221	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018408	ATCAA	2	10	80426	80435	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018408	ATATA	2	10	80441	80450	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018408	CTCAT	2	10	83002	83011	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018408	CTTCC	2	10	83276	83285	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_018408	TAATA	2	10	87016	87025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018408	TAAAA	2	10	94946	94955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018408	ATATA	2	10	105270	105279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018408	GAGAT	2	10	118495	118504	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018408	ATCTC	2	10	118521	118530	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018408	GTTTT	2	10	118686	118695	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018408	ACATA	2	10	122775	122784	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018408	TTTGC	2	10	122902	122911	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018408	ATTTT	2	10	132807	132816	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018408	TATTT	2	10	134305	134314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018408	TTACT	2	10	134784	134793	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018408	AATTA	2	10	134988	134997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018408	TAAAT	2	10	141298	141307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018408	GTTAG	2	10	149587	149596	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018408	CATTT	2	10	150036	150045	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018408	TCTTA	2	10	169406	169415	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018408	TTTTA	2	10	174723	174732	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018408	TAAAG	2	10	180024	180033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018408	TTTTA	2	10	181539	181548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018408	TGATC	2	10	182981	182990	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018408	TAAAA	2	10	207302	207311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018408	TAGCT	2	10	208110	208119	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018408	TATAT	2	10	216121	216130	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018408	TCTTT	2	10	256312	256321	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018408	TAGTT	2	10	278819	278828	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018408	TATTT	2	10	279821	279830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018408	CTAAC	2	10	281392	281401	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_018408	AGAGA	2	10	306473	306482	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018408	ATATT	2	10	312244	312253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018408	AGTTA	2	10	312356	312365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018408	TAATT	2	10	314529	314538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018408	TCTAG	2	10	320354	320363	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018408	TCGTG	2	10	320773	320782	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018408	TAGGG	2	10	321154	321163	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018408	ATCAA	2	10	321830	321839	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018408	ATATA	2	10	321845	321854	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018408	CTCAT	2	10	324406	324415	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_018408	CTTCC	2	10	324680	324689	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_018408	AATTA	2	10	349780	349789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018408	ATTAT	2	10	349809	349818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018408	TAAAT	2	10	354582	354591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018408	ATTAA	2	10	354593	354602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018408	TATAT	2	10	357566	357575	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018408	AGTTA	2	10	362310	362319	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018408	ATTTT	2	10	364744	364753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018408	ATTAA	2	10	372766	372775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018408	AAATT	2	10	372880	372889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018408	TAGTT	2	10	375155	375164	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018408	TAAAA	2	10	379689	379698	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018408	AAGTT	2	10	379975	379984	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018408	AAATT	2	10	390469	390478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018408	AAGAA	2	10	409200	409209	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018408	ATATA	2	10	434400	434409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018408	GTCAG	2	10	436192	436201	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018408	TTACT	2	10	463743	463752	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018408	TATCA	2	10	466246	466255	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018408	ATCTA	2	10	476461	476470	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018408	TTAAC	2	10	478071	478080	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018408	TAAAA	2	10	495712	495721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018408	TAATT	2	10	505069	505078	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018408	TAAAA	2	10	545948	545957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018408	ATCTT	2	10	546764	546773	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018408	ATTTA	2	10	551264	551273	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018408	AAATT	2	10	561696	561705	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018408	TTAGT	2	10	561742	561751	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018408	ATTTT	2	10	564376	564385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018408	TTAAA	2	10	595457	595466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018408	ATCAA	2	10	597025	597034	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018408	TTTAT	2	10	603595	603604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018408	TAGTC	2	10	604148	604157	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_018408	TAATT	2	10	604876	604885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018408	TGAAA	2	10	609348	609357	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018408	AAATT	2	10	611063	611072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018408	ATTTA	2	10	611087	611096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018408	AAATC	2	10	612379	612388	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018408	TAATT	2	10	616353	616362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018408	CATTT	2	10	623542	623551	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018408	AAATG	2	10	623558	623567	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018408	TATTT	2	10	635751	635760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018408	TTAAT	2	10	647104	647113	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018408	AAATA	2	10	648702	648711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018408	CTTAT	2	10	649976	649985	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018408	ATTAT	2	10	653133	653142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018408	TTAAC	2	10	667406	667415	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018408	TAATA	2	10	680392	680401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018408	TTTAA	2	10	680817	680826	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018408	AGATC	2	10	708595	708604	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018408	TTAAG	2	10	710530	710539	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018408	TTTTG	2	10	710571	710580	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018408	AAATC	2	10	714337	714346	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018408	ATTTA	2	10	716225	716234	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018408	ATTTA	2	10	716438	716447	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018408	CAAAA	2	10	726570	726579	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018408	TATAA	2	10	731473	731482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018408	AAATT	2	10	734503	734512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018408	TATTT	2	10	740911	740920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018408	CCAAA	2	10	804047	804056	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_018408	AAAAG	2	10	824934	824943	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018408	TTTTC	2	10	825774	825783	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018408	TTTTA	2	10	844402	844411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018408	ATTAA	2	10	853780	853789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018408	CCCTA	2	10	858257	858266	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
120	NC_018408	CACGA	2	10	858638	858647	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_018408	CTAGA	2	10	859057	859066	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018408	TATCT	2	10	868659	868668	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018408	ACTTC	2	10	876893	876902	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_018408	AGATC	2	10	890036	890045	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018408	TTAAT	2	10	896020	896029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018408	CAATT	2	10	904546	904555	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018408	AATTA	2	10	912520	912529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018408	AATTA	2	10	912652	912661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018408	ATAGC	2	10	944009	944018	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018408	TCCTT	2	10	944152	944161	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_018408	AATTT	2	10	944360	944369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018408	AATCA	2	10	958301	958310	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018408	TAACC	2	10	973435	973444	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.