MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum NC95_13295-2-2P chromosome

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018407	AAAAC	2	10	824	833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018407	ATCAT	2	10	1087	1096	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018407	AAAGT	2	10	1575	1584	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018407	ATATT	2	10	1852	1861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018407	AGTTA	2	10	30063	30072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018407	ATTTT	2	10	36629	36638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018407	TTAAT	2	10	49815	49824	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018407	TTAGC	2	10	63814	63823	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018407	TTTAT	2	10	64366	64375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018407	GCAAA	2	10	68436	68445	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018407	CTAAA	2	10	78895	78904	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018407	TTTAA	2	10	80111	80120	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018407	CAAAC	2	10	80212	80221	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018407	ATCAA	2	10	80426	80435	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018407	ATATA	2	10	80441	80450	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018407	CTCAT	2	10	83002	83011	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018407	CTTCC	2	10	83276	83285	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_018407	TAATA	2	10	87016	87025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018407	TAAAA	2	10	94946	94955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018407	ATATA	2	10	105270	105279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018407	GAGAT	2	10	118495	118504	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018407	ATCTC	2	10	118521	118530	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018407	GTTTT	2	10	118686	118695	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018407	ACATA	2	10	122775	122784	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018407	TTTGC	2	10	122902	122911	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018407	ATTTT	2	10	132807	132816	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018407	TATTT	2	10	134305	134314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018407	TTACT	2	10	134784	134793	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018407	AATTA	2	10	134988	134997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018407	TAAAT	2	10	141292	141301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018407	GTTAG	2	10	149581	149590	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018407	CATTT	2	10	150030	150039	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018407	TCTTA	2	10	169400	169409	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018407	TTTTA	2	10	174717	174726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018407	TAAAG	2	10	180018	180027	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018407	TTTTA	2	10	181533	181542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018407	TGATC	2	10	182975	182984	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018407	TAAAA	2	10	207306	207315	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018407	TAGCT	2	10	208114	208123	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018407	TATAT	2	10	216125	216134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018407	TCTTT	2	10	256316	256325	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018407	TAGTT	2	10	278782	278791	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018407	TATTT	2	10	279784	279793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018407	CTAAC	2	10	281355	281364	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_018407	AGAGA	2	10	306437	306446	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018407	ATATT	2	10	312202	312211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018407	AGTTA	2	10	312314	312323	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018407	TAATT	2	10	314487	314496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018407	TCTAG	2	10	320312	320321	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018407	TCGTG	2	10	320731	320740	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018407	TAGGG	2	10	321112	321121	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018407	ATCAA	2	10	321788	321797	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018407	ATATA	2	10	321803	321812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018407	CTCAT	2	10	324364	324373	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_018407	CTTCC	2	10	324638	324647	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_018407	AATTA	2	10	349715	349724	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018407	ATTAT	2	10	349744	349753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018407	TAAAT	2	10	354517	354526	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018407	ATTAA	2	10	354528	354537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018407	TATAT	2	10	357501	357510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018407	AGTTA	2	10	362245	362254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018407	ATTTT	2	10	364678	364687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018407	ATTAA	2	10	372700	372709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018407	AAATT	2	10	372814	372823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018407	TAGTT	2	10	375089	375098	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018407	TAAAA	2	10	379623	379632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018407	AAGTT	2	10	379909	379918	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018407	AAATT	2	10	390400	390409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018407	AAGAA	2	10	409122	409131	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018407	ATATA	2	10	434322	434331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018407	GTCAG	2	10	436114	436123	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018407	ATCTA	2	10	447294	447303	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018407	TTAAC	2	10	448904	448913	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018407	TAAAA	2	10	466545	466554	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018407	TAATT	2	10	475902	475911	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018407	TAAAA	2	10	516786	516795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018407	ATCTT	2	10	517602	517611	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018407	ATTTA	2	10	522103	522112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018407	AAATT	2	10	532535	532544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018407	TTAGT	2	10	532581	532590	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018407	ATTTT	2	10	535206	535215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018407	TTAAA	2	10	566278	566287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018407	ATCAA	2	10	567846	567855	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018407	TTTAT	2	10	574416	574425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018407	TAGTC	2	10	574969	574978	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018407	TAATT	2	10	575697	575706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018407	TGAAA	2	10	580169	580178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018407	AAATT	2	10	581884	581893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018407	ATTTA	2	10	581908	581917	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018407	AAATC	2	10	583200	583209	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018407	TAATT	2	10	587174	587183	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018407	CATTT	2	10	594363	594372	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018407	AAATG	2	10	594379	594388	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018407	TATTT	2	10	606572	606581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018407	TTAAT	2	10	617925	617934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018407	AAATA	2	10	619523	619532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018407	CTTAT	2	10	620797	620806	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018407	ATTAT	2	10	623954	623963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018407	TTAAC	2	10	638227	638236	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018407	TAATA	2	10	651213	651222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018407	TTTAA	2	10	651638	651647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018407	AGATC	2	10	675757	675766	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018407	TTAAG	2	10	677692	677701	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018407	TTTTG	2	10	677733	677742	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018407	AAATC	2	10	681499	681508	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018407	ATTTA	2	10	683387	683396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018407	ATTTA	2	10	683600	683609	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018407	CAAAA	2	10	693732	693741	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018407	TATAA	2	10	698635	698644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018407	AAATT	2	10	701665	701674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018407	TATTT	2	10	708073	708082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018407	CCAAA	2	10	771176	771185	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018407	AAAAG	2	10	792054	792063	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018407	TTTTC	2	10	792894	792903	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018407	TTTTA	2	10	811522	811531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018407	ATTAA	2	10	820900	820909	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018407	CCCTA	2	10	825377	825386	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
118	NC_018407	CACGA	2	10	825758	825767	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_018407	CTAGA	2	10	826177	826186	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018407	TATCT	2	10	835779	835788	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018407	ACTTC	2	10	844012	844021	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018407	TAATC	2	10	848305	848314	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018407	AACAA	2	10	848892	848901	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018407	AAAGC	2	10	851907	851916	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018407	AGAAA	2	10	852070	852079	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018407	AGATC	2	10	857155	857164	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018407	TTAAT	2	10	863139	863148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018407	CAATT	2	10	871665	871674	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018407	AATTA	2	10	880235	880244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018407	AATTA	2	10	880367	880376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018407	AATCA	2	10	900391	900400	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018407	ATAGC	2	10	911735	911744	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018407	TCCTT	2	10	911878	911887	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_018407	AATTT	2	10	912086	912095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018407	AATCA	2	10	926033	926042	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018407	TAACC	2	10	941167	941176	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.