MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum VA94_7994-1-7P chromosome

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018406	ATATTT	2	12	82	93	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018406	TTTTTA	2	12	20635	20646	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018406	TTAAAA	2	12	50203	50214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018406	TTATAT	3	18	61386	61403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018406	AAGCGA	2	12	81134	81145	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018406	ATATCG	2	12	83464	83475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018406	TTAGTT	2	12	132819	132830	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018406	ACAGAA	2	12	135486	135497	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018406	TTTAAC	2	12	149592	149603	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018406	ATTTTT	2	12	186667	186678	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018406	CAATAT	2	12	234216	234227	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018406	TTAATC	2	12	236821	236832	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018406	AAAACT	2	12	241881	241892	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018406	GTTAAA	2	12	292096	292107	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018406	TTTTAT	2	12	300069	300080	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018406	ATTTAA	2	12	326983	326994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018406	AGGCGA	2	12	331151	331162	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018406	AAGCGA	2	12	333258	333269	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018406	ATATCG	2	12	335588	335599	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018406	GCTTAT	2	12	365636	365647	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018406	TTATTT	2	12	374597	374608	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018406	GATCAT	2	12	392681	392692	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018406	ATTTAT	2	12	399704	399715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018406	ATTAAA	2	12	409963	409974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018406	TTTATT	2	12	440253	440264	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018406	CAAAAA	2	12	440284	440295	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018406	ATATTT	2	12	445112	445123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018406	TTTGCT	2	12	457890	457901	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018406	ATCAGC	2	12	471217	471228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018406	TTATCA	2	12	471512	471523	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018406	TTTTAT	2	12	477347	477358	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018406	AGTTGA	2	12	488529	488540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018406	ATTTTT	2	12	524294	524305	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018406	GTTTTG	2	12	543206	543217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018406	GTTTTT	2	12	543465	543476	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018406	TTAAAT	2	12	592791	592802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018406	TAGAAA	2	12	617153	617164	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018406	TTATAA	2	12	634864	634875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018406	GTTTTT	2	12	649225	649236	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018406	TAAAAA	2	12	658069	658080	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018406	TGCAAA	2	12	662198	662209	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018406	TATTTA	2	12	688727	688738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018406	TTTAAT	2	12	693669	693680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018406	AAAATA	2	12	704616	704627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018406	AAAGAT	2	12	784384	784395	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018406	AAAGAT	2	12	786811	786822	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018406	GAAAAT	2	12	801672	801683	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018406	ATCTAG	2	12	802947	802958	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018406	TGTTCT	2	12	803755	803766	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018406	TCGCCT	2	12	836814	836825	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018406	ATATTT	2	12	845825	845836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018406	TGATAA	2	12	863605	863616	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018406	TATAAA	2	12	870419	870430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018406	CAATAA	2	12	888632	888643	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018406	ATTAAA	2	12	889448	889459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018406	CTAAAC	2	12	900619	900630	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018406	TTAATC	2	12	909980	909991	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018406	AACTAA	2	12	941428	941439	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.