MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018304	AGGT	2	8	351	358	25 %	25 %	50 %	0 %	399912628
2	NC_018304	TCGA	2	8	766	773	25 %	25 %	25 %	25 %	399912628
3	NC_018304	GGCA	2	8	795	802	25 %	0 %	50 %	25 %	399912628
4	NC_018304	GATG	2	8	925	932	25 %	25 %	50 %	0 %	399912628
5	NC_018304	TCCG	2	8	2040	2047	0 %	25 %	25 %	50 %	399912628
6	NC_018304	GATC	2	8	2149	2156	25 %	25 %	25 %	25 %	399912628
7	NC_018304	ATGC	2	8	2475	2482	25 %	25 %	25 %	25 %	399912628
8	NC_018304	TACC	2	8	2689	2696	25 %	25 %	0 %	50 %	399912628
9	NC_018304	GCCT	2	8	3722	3729	0 %	25 %	25 %	50 %	399912629
10	NC_018304	CCGT	2	8	4160	4167	0 %	25 %	25 %	50 %	399912629
11	NC_018304	GATA	2	8	4971	4978	50 %	25 %	25 %	0 %	399912631
12	NC_018304	ATTT	2	8	5647	5654	25 %	75 %	0 %	0 %	399912631
13	NC_018304	GGCA	2	8	5859	5866	25 %	0 %	50 %	25 %	399912631
14	NC_018304	CGCT	2	8	6778	6785	0 %	25 %	25 %	50 %	399912632
15	NC_018304	TGGA	2	8	8075	8082	25 %	25 %	50 %	0 %	399912633
16	NC_018304	CGTC	2	8	8296	8303	0 %	25 %	25 %	50 %	399912633
17	NC_018304	ATGT	2	8	8808	8815	25 %	50 %	25 %	0 %	399912634
18	NC_018304	TCCC	2	8	8847	8854	0 %	25 %	0 %	75 %	399912634
19	NC_018304	AAAC	2	8	8888	8895	75 %	0 %	0 %	25 %	399912634
20	NC_018304	GCAG	2	8	9488	9495	25 %	0 %	50 %	25 %	399912634
21	NC_018304	CATT	2	8	9557	9564	25 %	50 %	0 %	25 %	399912634
22	NC_018304	CGCA	2	8	9766	9773	25 %	0 %	25 %	50 %	399912634

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.