MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018303	GACGGC	2	12	7603	7614	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	399995576
2	NC_018303	CCAGAG	2	12	7868	7879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995577
3	NC_018303	TCCGCG	2	12	11014	11025	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	399995580
4	NC_018303	CAAGCT	2	12	11513	11524	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	399995580
5	NC_018303	AACGGC	2	12	16399	16410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995586
6	NC_018303	GCAGCC	2	12	20103	20114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	399995590
7	NC_018303	TGGCAA	2	12	26665	26676	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995599
8	NC_018303	CCGCTG	2	12	28514	28525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	399995602
9	NC_018303	ACGATG	2	12	28854	28865	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995602
10	NC_018303	CCTTGC	2	12	30374	30385	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	399995605
11	NC_018303	TTGGCG	2	12	30993	31004	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	399995606
12	NC_018303	CCAAGC	2	12	31515	31526	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	399995606
13	NC_018303	CGATCT	2	12	33297	33308	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399995609
14	NC_018303	GCCACG	2	12	38593	38604	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	399995615
15	NC_018303	GAGTAC	2	12	40574	40585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995616
16	NC_018303	CACGCG	2	12	42781	42792	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	399995618
17	NC_018303	TTCGTC	2	12	45223	45234	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	399995620
18	NC_018303	GATCGG	2	12	46769	46780	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	399995623
19	NC_018303	GTTCCG	2	12	46850	46861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995623

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.