MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018303	CCTTT	2	10	2184	2193	0 %	60 %	0 %	40 %	399995570
2	NC_018303	TCGTT	2	10	2219	2228	0 %	60 %	20 %	20 %	399995570
3	NC_018303	CATGC	2	10	4632	4641	20 %	20 %	20 %	40 %	399995571
4	NC_018303	CCAGC	2	10	5220	5229	20 %	0 %	20 %	60 %	399995573
5	NC_018303	GATTT	2	10	5545	5554	20 %	60 %	20 %	0 %	399995573
6	NC_018303	TTGAT	2	10	5726	5735	20 %	60 %	20 %	0 %	399995573
7	NC_018303	CGCTG	2	10	6078	6087	0 %	20 %	40 %	40 %	399995574
8	NC_018303	CCGGA	2	10	10952	10961	20 %	0 %	40 %	40 %	399995580
9	NC_018303	TGAGC	2	10	12148	12157	20 %	20 %	40 %	20 %	399995582
10	NC_018303	GCAAC	2	10	14982	14991	40 %	0 %	20 %	40 %	399995585
11	NC_018303	AGCCG	2	10	15423	15432	20 %	0 %	40 %	40 %	399995585
12	NC_018303	GCCGT	2	10	16584	16593	0 %	20 %	40 %	40 %	399995586
13	NC_018303	GCGAA	2	10	16806	16815	40 %	0 %	40 %	20 %	399995586
14	NC_018303	TTCAT	2	10	17068	17077	20 %	60 %	0 %	20 %	399995587
15	NC_018303	CCAAT	2	10	17307	17316	40 %	20 %	0 %	40 %	399995587
16	NC_018303	TGCGC	2	10	19463	19472	0 %	20 %	40 %	40 %	399995590
17	NC_018303	TTTCC	2	10	19703	19712	0 %	60 %	0 %	40 %	399995590
18	NC_018303	TCCGG	2	10	26504	26513	0 %	20 %	40 %	40 %	399995598
19	NC_018303	CTTTC	2	10	26943	26952	0 %	60 %	0 %	40 %	399995600
20	NC_018303	GATTG	2	10	30288	30297	20 %	40 %	40 %	0 %	399995605
21	NC_018303	GATCC	2	10	31086	31095	20 %	20 %	20 %	40 %	399995606
22	NC_018303	GCGCC	2	10	31114	31123	0 %	0 %	40 %	60 %	399995606
23	NC_018303	AAGCC	2	10	32059	32068	40 %	0 %	20 %	40 %	399995606
24	NC_018303	ATCGG	2	10	34878	34887	20 %	20 %	40 %	20 %	399995609
25	NC_018303	CTCCC	2	10	34951	34960	0 %	20 %	0 %	80 %	399995609
26	NC_018303	TTGGA	2	10	35396	35405	20 %	40 %	40 %	0 %	399995610
27	NC_018303	CGCTG	2	10	35958	35967	0 %	20 %	40 %	40 %	399995610
28	NC_018303	CCGGC	2	10	36700	36709	0 %	0 %	40 %	60 %	399995611
29	NC_018303	CCCCT	2	10	37150	37159	0 %	20 %	0 %	80 %	399995613
30	NC_018303	CGAGG	2	10	38458	38467	20 %	0 %	60 %	20 %	399995614
31	NC_018303	GGCGG	2	10	38544	38553	0 %	0 %	80 %	20 %	399995615
32	NC_018303	GCATG	2	10	42620	42629	20 %	20 %	40 %	20 %	399995618
33	NC_018303	TCCGC	2	10	47144	47153	0 %	20 %	20 %	60 %	399995623

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.