MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018303	GC	3	6	477	482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018303	GA	3	6	1276	1281	50 %	0 %	50 %	0 %	399995568
3	NC_018303	GC	3	6	1539	1544	0 %	0 %	50 %	50 %	399995568
4	NC_018303	GC	3	6	2032	2037	0 %	0 %	50 %	50 %	399995569
5	NC_018303	CT	3	6	3995	4000	0 %	50 %	0 %	50 %	399995570
6	NC_018303	CG	3	6	4354	4359	0 %	0 %	50 %	50 %	399995571
7	NC_018303	CG	3	6	4373	4378	0 %	0 %	50 %	50 %	399995571
8	NC_018303	GC	3	6	4681	4686	0 %	0 %	50 %	50 %	399995572
9	NC_018303	GC	4	8	5511	5518	0 %	0 %	50 %	50 %	399995573
10	NC_018303	GC	3	6	5667	5672	0 %	0 %	50 %	50 %	399995573
11	NC_018303	CT	3	6	5828	5833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018303	GC	3	6	5973	5978	0 %	0 %	50 %	50 %	399995574
13	NC_018303	AC	3	6	6306	6311	50 %	0 %	0 %	50 %	399995574
14	NC_018303	CA	3	6	6748	6753	50 %	0 %	0 %	50 %	399995574
15	NC_018303	CG	3	6	7534	7539	0 %	0 %	50 %	50 %	399995576
16	NC_018303	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	399995576
17	NC_018303	GT	3	6	8787	8792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018303	GC	3	6	9386	9391	0 %	0 %	50 %	50 %	399995579
19	NC_018303	CG	3	6	9424	9429	0 %	0 %	50 %	50 %	399995579
20	NC_018303	CG	3	6	9756	9761	0 %	0 %	50 %	50 %	399995579
21	NC_018303	AG	3	6	11294	11299	50 %	0 %	50 %	0 %	399995580
22	NC_018303	GA	3	6	11761	11766	50 %	0 %	50 %	0 %	399995581
23	NC_018303	GC	3	6	11878	11883	0 %	0 %	50 %	50 %	399995581
24	NC_018303	CT	3	6	11935	11940	0 %	50 %	0 %	50 %	399995581
25	NC_018303	GC	4	8	12312	12319	0 %	0 %	50 %	50 %	399995582
26	NC_018303	AG	3	6	13180	13185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018303	GC	3	6	13563	13568	0 %	0 %	50 %	50 %	399995583
28	NC_018303	TC	3	6	14057	14062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018303	CA	3	6	14376	14381	50 %	0 %	0 %	50 %	399995584
30	NC_018303	AC	3	6	14655	14660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018303	CG	3	6	16457	16462	0 %	0 %	50 %	50 %	399995586
32	NC_018303	CG	3	6	16619	16624	0 %	0 %	50 %	50 %	399995586
33	NC_018303	GC	3	6	18776	18781	0 %	0 %	50 %	50 %	399995589
34	NC_018303	GC	3	6	19292	19297	0 %	0 %	50 %	50 %	399995589
35	NC_018303	AT	3	6	19864	19869	50 %	50 %	0 %	0 %	399995590
36	NC_018303	AT	3	6	20566	20571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018303	AC	3	6	21087	21092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018303	CA	3	6	21159	21164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018303	CG	3	6	21559	21564	0 %	0 %	50 %	50 %	399995591
40	NC_018303	GC	3	6	22310	22315	0 %	0 %	50 %	50 %	399995591
41	NC_018303	GC	3	6	22706	22711	0 %	0 %	50 %	50 %	399995591
42	NC_018303	CG	3	6	23272	23277	0 %	0 %	50 %	50 %	399995591
43	NC_018303	AC	3	6	23657	23662	50 %	0 %	0 %	50 %	399995592
44	NC_018303	CA	3	6	24099	24104	50 %	0 %	0 %	50 %	399995592
45	NC_018303	GC	3	6	24510	24515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018303	CG	3	6	24734	24739	0 %	0 %	50 %	50 %	399995593
47	NC_018303	AG	3	6	25030	25035	50 %	0 %	50 %	0 %	399995594
48	NC_018303	AC	3	6	26120	26125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018303	GC	3	6	26369	26374	0 %	0 %	50 %	50 %	399995598
50	NC_018303	GC	3	6	26479	26484	0 %	0 %	50 %	50 %	399995598
51	NC_018303	CG	3	6	26818	26823	0 %	0 %	50 %	50 %	399995599
52	NC_018303	TC	3	6	27357	27362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018303	CA	3	6	27441	27446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018303	CG	3	6	27608	27613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018303	GC	3	6	28565	28570	0 %	0 %	50 %	50 %	399995602
56	NC_018303	CG	4	8	28596	28603	0 %	0 %	50 %	50 %	399995602
57	NC_018303	CG	3	6	29063	29068	0 %	0 %	50 %	50 %	399995603
58	NC_018303	GC	3	6	29193	29198	0 %	0 %	50 %	50 %	399995603
59	NC_018303	GC	3	6	29652	29657	0 %	0 %	50 %	50 %	399995604
60	NC_018303	AT	3	6	30568	30573	50 %	50 %	0 %	0 %	399995605
61	NC_018303	GC	3	6	30637	30642	0 %	0 %	50 %	50 %	399995605
62	NC_018303	CG	3	6	30865	30870	0 %	0 %	50 %	50 %	399995605
63	NC_018303	GC	4	8	31779	31786	0 %	0 %	50 %	50 %	399995606
64	NC_018303	CG	3	6	33342	33347	0 %	0 %	50 %	50 %	399995609
65	NC_018303	GC	3	6	34038	34043	0 %	0 %	50 %	50 %	399995609
66	NC_018303	GT	3	6	34149	34154	0 %	50 %	50 %	0 %	399995609
67	NC_018303	GT	3	6	34491	34496	0 %	50 %	50 %	0 %	399995609
68	NC_018303	CG	3	6	34974	34979	0 %	0 %	50 %	50 %	399995609
69	NC_018303	CG	4	8	35187	35194	0 %	0 %	50 %	50 %	399995609
70	NC_018303	GC	3	6	35222	35227	0 %	0 %	50 %	50 %	399995609
71	NC_018303	CG	3	6	36336	36341	0 %	0 %	50 %	50 %	399995610
72	NC_018303	CG	3	6	36501	36506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018303	GC	3	6	37972	37977	0 %	0 %	50 %	50 %	399995614
74	NC_018303	GC	3	6	39049	39054	0 %	0 %	50 %	50 %	399995615
75	NC_018303	CT	3	6	39575	39580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018303	AT	3	6	39612	39617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018303	TC	3	6	40110	40115	0 %	50 %	0 %	50 %	399995616
78	NC_018303	CG	4	8	40650	40657	0 %	0 %	50 %	50 %	399995616
79	NC_018303	GC	3	6	41068	41073	0 %	0 %	50 %	50 %	399995616
80	NC_018303	GC	4	8	41648	41655	0 %	0 %	50 %	50 %	399995617
81	NC_018303	CT	3	6	42233	42238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018303	AT	3	6	42413	42418	50 %	50 %	0 %	0 %	399995618
83	NC_018303	CT	3	6	42516	42521	0 %	50 %	0 %	50 %	399995618
84	NC_018303	CT	3	6	43154	43159	0 %	50 %	0 %	50 %	399995618
85	NC_018303	GC	3	6	43527	43532	0 %	0 %	50 %	50 %	399995618
86	NC_018303	GC	3	6	44634	44639	0 %	0 %	50 %	50 %	399995619
87	NC_018303	CG	4	8	45177	45184	0 %	0 %	50 %	50 %	399995620
88	NC_018303	CG	3	6	45305	45310	0 %	0 %	50 %	50 %	399995620
89	NC_018303	GC	3	6	45585	45590	0 %	0 %	50 %	50 %	399995621
90	NC_018303	CG	3	6	45849	45854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018303	GC	3	6	45944	45949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018303	GC	3	6	46214	46219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018303	CG	3	6	47039	47044	0 %	0 %	50 %	50 %	399995623
94	NC_018303	CG	3	6	47055	47060	0 %	0 %	50 %	50 %	399995623
95	NC_018303	CG	3	6	47111	47116	0 %	0 %	50 %	50 %	399995623
96	NC_018303	CG	4	8	47386	47393	0 %	0 %	50 %	50 %	399995623
97	NC_018303	TG	3	6	47596	47601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018303	CG	3	6	47702	47707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.