MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018299	TTTC	2	8	43	50	0 %	75 %	0 %	25 %	399995315
2	NC_018299	AGGA	2	8	1223	1230	50 %	0 %	50 %	0 %	399995317
3	NC_018299	CTGG	2	8	2311	2318	0 %	25 %	50 %	25 %	399995317
4	NC_018299	CAGG	2	8	2773	2780	25 %	0 %	50 %	25 %	399995318
5	NC_018299	GCCA	2	8	2933	2940	25 %	0 %	25 %	50 %	399995318
6	NC_018299	GCCG	2	8	3038	3045	0 %	0 %	50 %	50 %	399995319
7	NC_018299	GAAT	2	8	3149	3156	50 %	25 %	25 %	0 %	399995319
8	NC_018299	ACGG	2	8	3163	3170	25 %	0 %	50 %	25 %	399995319
9	NC_018299	CTGA	2	8	3210	3217	25 %	25 %	25 %	25 %	399995319
10	NC_018299	TTCT	2	8	3288	3295	0 %	75 %	0 %	25 %	399995319
11	NC_018299	CGAC	2	8	3323	3330	25 %	0 %	25 %	50 %	399995319
12	NC_018299	TGGC	2	8	4527	4534	0 %	25 %	50 %	25 %	399995321
13	NC_018299	GACC	2	8	4619	4626	25 %	0 %	25 %	50 %	399995321
14	NC_018299	GGCT	2	8	4662	4669	0 %	25 %	50 %	25 %	399995321
15	NC_018299	GGCG	2	8	5398	5405	0 %	0 %	75 %	25 %	399995321
16	NC_018299	GCCC	2	8	5715	5722	0 %	0 %	25 %	75 %	399995323
17	NC_018299	TTCG	2	8	7078	7085	0 %	50 %	25 %	25 %	399995324
18	NC_018299	TGAG	2	8	7165	7172	25 %	25 %	50 %	0 %	399995324
19	NC_018299	TCGA	2	8	7511	7518	25 %	25 %	25 %	25 %	399995324
20	NC_018299	GCCG	2	8	7856	7863	0 %	0 %	50 %	50 %	399995325
21	NC_018299	TCGC	2	8	8500	8507	0 %	25 %	25 %	50 %	399995326
22	NC_018299	AAAC	2	8	9236	9243	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018299	GAAT	2	8	9743	9750	50 %	25 %	25 %	0 %	399995327
24	NC_018299	TGCT	2	8	10476	10483	0 %	50 %	25 %	25 %	399995330
25	NC_018299	GGTA	2	8	10579	10586	25 %	25 %	50 %	0 %	399995330
26	NC_018299	CCAG	2	8	10690	10697	25 %	0 %	25 %	50 %	399995330
27	NC_018299	TCGA	2	8	11364	11371	25 %	25 %	25 %	25 %	399995330
28	NC_018299	GTTT	2	8	11960	11967	0 %	75 %	25 %	0 %	399995331
29	NC_018299	CGAA	2	8	11972	11979	50 %	0 %	25 %	25 %	399995331
30	NC_018299	TCCA	2	8	13205	13212	25 %	25 %	0 %	50 %	399995333
31	NC_018299	TCAA	2	8	13605	13612	50 %	25 %	0 %	25 %	399995334
32	NC_018299	ACTA	2	8	14752	14759	50 %	25 %	0 %	25 %	399995335
33	NC_018299	ACGC	2	8	14911	14918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018299	TGCA	2	8	15310	15317	25 %	25 %	25 %	25 %	399995336
35	NC_018299	CCGC	2	8	15826	15833	0 %	0 %	25 %	75 %	399995337
36	NC_018299	GCCT	2	8	17577	17584	0 %	25 %	25 %	50 %	399995337
37	NC_018299	GGGA	2	8	18071	18078	25 %	0 %	75 %	0 %	399995338
38	NC_018299	GCCC	2	8	19097	19104	0 %	0 %	25 %	75 %	399995339
39	NC_018299	CCGA	2	8	19170	19177	25 %	0 %	25 %	50 %	399995339
40	NC_018299	CCTT	2	8	19940	19947	0 %	50 %	0 %	50 %	399995340
41	NC_018299	CGCC	2	8	19956	19963	0 %	0 %	25 %	75 %	399995340
42	NC_018299	ACGA	2	8	21162	21169	50 %	0 %	25 %	25 %	399995341
43	NC_018299	TGCC	2	8	21206	21213	0 %	25 %	25 %	50 %	399995341
44	NC_018299	GGCC	2	8	21216	21223	0 %	0 %	50 %	50 %	399995341
45	NC_018299	CAAA	2	8	21674	21681	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018299	CGTA	2	8	22989	22996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018299	GATC	2	8	23062	23069	25 %	25 %	25 %	25 %	399995344
48	NC_018299	CATC	2	8	23140	23147	25 %	25 %	0 %	50 %	399995344
49	NC_018299	CGTC	2	8	23206	23213	0 %	25 %	25 %	50 %	399995344
50	NC_018299	CGCC	2	8	23607	23614	0 %	0 %	25 %	75 %	399995345
51	NC_018299	ATAA	2	8	24029	24036	75 %	25 %	0 %	0 %	399995345
52	NC_018299	CGGC	2	8	24051	24058	0 %	0 %	50 %	50 %	399995345
53	NC_018299	ATTG	2	8	24640	24647	25 %	50 %	25 %	0 %	399995345
54	NC_018299	GCCA	2	8	25007	25014	25 %	0 %	25 %	50 %	399995345
55	NC_018299	ACAA	2	8	25137	25144	75 %	0 %	0 %	25 %	399995345
56	NC_018299	TCAA	2	8	25299	25306	50 %	25 %	0 %	25 %	399995345
57	NC_018299	CGGC	2	8	25475	25482	0 %	0 %	50 %	50 %	399995345
58	NC_018299	TTCG	2	8	25490	25497	0 %	50 %	25 %	25 %	399995345
59	NC_018299	AGGC	2	8	26822	26829	25 %	0 %	50 %	25 %	399995347
60	NC_018299	GGGC	2	8	27093	27100	0 %	0 %	75 %	25 %	399995347
61	NC_018299	TGCG	2	8	27506	27513	0 %	25 %	50 %	25 %	399995347
62	NC_018299	ACCA	2	8	27617	27624	50 %	0 %	0 %	50 %	399995347
63	NC_018299	AAGG	2	8	27763	27770	50 %	0 %	50 %	0 %	399995348
64	NC_018299	CGGC	2	8	28751	28758	0 %	0 %	50 %	50 %	399995350
65	NC_018299	CCGG	2	8	28933	28940	0 %	0 %	50 %	50 %	399995350
66	NC_018299	GAAA	2	8	29940	29947	75 %	0 %	25 %	0 %	399995353
67	NC_018299	CGGC	2	8	30555	30562	0 %	0 %	50 %	50 %	399995353
68	NC_018299	GGTC	2	8	30624	30631	0 %	25 %	50 %	25 %	399995353
69	NC_018299	CTGC	2	8	30735	30742	0 %	25 %	25 %	50 %	399995353
70	NC_018299	CCAG	2	8	30849	30856	25 %	0 %	25 %	50 %	399995353
71	NC_018299	GCCG	2	8	30901	30908	0 %	0 %	50 %	50 %	399995353
72	NC_018299	GTCG	2	8	30945	30952	0 %	25 %	50 %	25 %	399995353
73	NC_018299	TGGC	2	8	31003	31010	0 %	25 %	50 %	25 %	399995353
74	NC_018299	GGCA	2	8	31483	31490	25 %	0 %	50 %	25 %	399995353
75	NC_018299	GGCG	2	8	32031	32038	0 %	0 %	75 %	25 %	399995354
76	NC_018299	GCAC	2	8	32192	32199	25 %	0 %	25 %	50 %	399995354
77	NC_018299	TCGA	2	8	34580	34587	25 %	25 %	25 %	25 %	399995355
78	NC_018299	AGAA	2	8	35715	35722	75 %	0 %	25 %	0 %	399995357
79	NC_018299	CTCC	2	8	36494	36501	0 %	25 %	0 %	75 %	399995357
80	NC_018299	TCGG	2	8	37212	37219	0 %	25 %	50 %	25 %	399995357
81	NC_018299	CCTT	2	8	37446	37453	0 %	50 %	0 %	50 %	399995357
82	NC_018299	CCCG	2	8	37648	37655	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_018299	TGAC	2	8	37672	37679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018299	GAAC	2	8	37782	37789	50 %	0 %	25 %	25 %	399995358
85	NC_018299	CATT	2	8	38641	38648	25 %	50 %	0 %	25 %	399995359
86	NC_018299	CCGT	2	8	39717	39724	0 %	25 %	25 %	50 %	399995361
87	NC_018299	CGAG	2	8	40188	40195	25 %	0 %	50 %	25 %	399995361
88	NC_018299	TGAG	2	8	41193	41200	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018299	CTTG	2	8	41254	41261	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018299	ATCT	2	8	42551	42558	25 %	50 %	0 %	25 %	399995364
91	NC_018299	CTGG	2	8	42646	42653	0 %	25 %	50 %	25 %	399995364
92	NC_018299	CTGC	2	8	42865	42872	0 %	25 %	25 %	50 %	399995365
93	NC_018299	ATTC	2	8	44052	44059	25 %	50 %	0 %	25 %	399995368
94	NC_018299	TGCC	2	8	44281	44288	0 %	25 %	25 %	50 %	399995368
95	NC_018299	GCCG	2	8	45302	45309	0 %	0 %	50 %	50 %	399995369
96	NC_018299	AAGC	2	8	45311	45318	50 %	0 %	25 %	25 %	399995369
97	NC_018299	TCCG	2	8	45342	45349	0 %	25 %	25 %	50 %	399995369
98	NC_018299	TGCT	2	8	45592	45599	0 %	50 %	25 %	25 %	399995369
99	NC_018299	GAGC	2	8	46068	46075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018299	ACGG	2	8	46308	46315	25 %	0 %	50 %	25 %	399995370
101	NC_018299	TCGA	2	8	46693	46700	25 %	25 %	25 %	25 %	399995371
102	NC_018299	CAGC	2	8	46830	46837	25 %	0 %	25 %	50 %	399995371
103	NC_018299	CGAC	2	8	46847	46854	25 %	0 %	25 %	50 %	399995371
104	NC_018299	CGAG	2	8	47231	47238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018299	CGAA	2	8	47349	47356	50 %	0 %	25 %	25 %	399995372
106	NC_018299	CCAG	2	8	47432	47439	25 %	0 %	25 %	50 %	399995372
107	NC_018299	GAAC	2	8	47614	47621	50 %	0 %	25 %	25 %	399995373
108	NC_018299	CGCA	2	8	48424	48431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018299	TCCA	2	8	48474	48481	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018299	TGAG	2	8	48602	48609	25 %	25 %	50 %	0 %	399995375
111	NC_018299	GCCT	2	8	49677	49684	0 %	25 %	25 %	50 %	399995377
112	NC_018299	CCTG	2	8	49801	49808	0 %	25 %	25 %	50 %	399995377
113	NC_018299	CGTG	2	8	49909	49916	0 %	25 %	50 %	25 %	399995377
114	NC_018299	TGAC	2	8	50197	50204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018299	CCGA	2	8	50537	50544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018299	GGGC	2	8	50786	50793	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018299	GCCA	2	8	50954	50961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018299	AGAT	2	8	51029	51036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018299	AGAA	2	8	51506	51513	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018299	GTCA	2	8	52022	52029	25 %	25 %	25 %	25 %	399995380
121	NC_018299	CGTG	2	8	52372	52379	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018299	CAGC	2	8	52646	52653	25 %	0 %	25 %	50 %	399995381
123	NC_018299	CGCT	2	8	52898	52905	0 %	25 %	25 %	50 %	399995381
124	NC_018299	CTGC	2	8	53155	53162	0 %	25 %	25 %	50 %	399995381
125	NC_018299	TATT	2	8	53448	53455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018299	GAGC	2	8	53981	53988	25 %	0 %	50 %	25 %	399995382
127	NC_018299	CGAT	2	8	53992	53999	25 %	25 %	25 %	25 %	399995382
128	NC_018299	AGCC	2	8	54374	54381	25 %	0 %	25 %	50 %	399995383
129	NC_018299	CTGC	2	8	54435	54442	0 %	25 %	25 %	50 %	399995383
130	NC_018299	CGCT	2	8	54587	54594	0 %	25 %	25 %	50 %	399995383
131	NC_018299	ACAA	2	8	54939	54946	75 %	0 %	0 %	25 %	399995384
132	NC_018299	TGCC	2	8	54950	54957	0 %	25 %	25 %	50 %	399995384
133	NC_018299	AAGC	2	8	55292	55299	50 %	0 %	25 %	25 %	399995384
134	NC_018299	TGCC	2	8	55939	55946	0 %	25 %	25 %	50 %	399995384
135	NC_018299	GCCC	2	8	56328	56335	0 %	0 %	25 %	75 %	399995384
136	NC_018299	TCGC	2	8	56389	56396	0 %	25 %	25 %	50 %	399995384
137	NC_018299	GGCG	2	8	56477	56484	0 %	0 %	75 %	25 %	399995384
138	NC_018299	TCAG	2	8	56529	56536	25 %	25 %	25 %	25 %	399995384
139	NC_018299	TGCC	2	8	56717	56724	0 %	25 %	25 %	50 %	399995384
140	NC_018299	AGCA	2	8	56780	56787	50 %	0 %	25 %	25 %	399995384
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142	NC_018299	CGGC	2	8	58249	58256	0 %	0 %	50 %	50 %	399995387
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