MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 3753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018299	GAT	2	6	138	143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995315
2	NC_018299	TCA	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995315
3	NC_018299	AGC	2	6	188	193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995315
4	NC_018299	AAG	2	6	229	234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995315
5	NC_018299	TCA	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995315
6	NC_018299	ATG	2	6	301	306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995315
7	NC_018299	TGC	2	6	336	341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995316
8	NC_018299	CGG	2	6	384	389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995316
9	NC_018299	TCT	2	6	432	437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995316
10	NC_018299	CCA	2	6	450	455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995316
11	NC_018299	TGC	2	6	477	482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995316
12	NC_018299	TGC	2	6	532	537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995316
13	NC_018299	CGG	2	6	548	553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995316
14	NC_018299	TCC	2	6	606	611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995316
15	NC_018299	GCC	2	6	634	639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995316
16	NC_018299	AGC	2	6	716	721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995316
17	NC_018299	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995316
18	NC_018299	GAT	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995316
19	NC_018299	TCG	2	6	900	905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995316
20	NC_018299	ATG	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995316
21	NC_018299	CAT	2	6	955	960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995316
22	NC_018299	GCA	2	6	987	992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
23	NC_018299	TGT	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995317
24	NC_018299	CGT	2	6	1065	1070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995317
25	NC_018299	ATC	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995317
26	NC_018299	GGC	2	6	1105	1110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995317
27	NC_018299	CAC	2	6	1119	1124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995317
28	NC_018299	CGG	2	6	1185	1190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995317
29	NC_018299	TTG	2	6	1193	1198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995317
30	NC_018299	GAC	2	6	1341	1346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
31	NC_018299	TGG	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995317
32	NC_018299	GAA	2	6	1513	1518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995317
33	NC_018299	GCC	2	6	1597	1602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995317
34	NC_018299	GCC	2	6	1662	1667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995317
35	NC_018299	TAG	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995317
36	NC_018299	GGC	2	6	1697	1702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995317
37	NC_018299	CGG	2	6	1812	1817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995317
38	NC_018299	ATC	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995317
39	NC_018299	CAG	2	6	1987	1992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
40	NC_018299	TCT	2	6	2049	2054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995317
41	NC_018299	GCA	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
42	NC_018299	TTG	2	6	2184	2189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995317
43	NC_018299	GAC	2	6	2200	2205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
44	NC_018299	GCC	2	6	2285	2290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995317
45	NC_018299	AAG	2	6	2359	2364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995317
46	NC_018299	GCA	2	6	2477	2482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
47	NC_018299	ATC	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995317
48	NC_018299	GTC	2	6	2545	2550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995317
49	NC_018299	CAG	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995318
50	NC_018299	CAC	2	6	2710	2715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995318
51	NC_018299	CTT	2	6	2761	2766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995318
52	NC_018299	CGT	2	6	2790	2795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995318
53	NC_018299	GCC	2	6	2815	2820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995318
54	NC_018299	CGC	2	6	2949	2954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995318
55	NC_018299	ATC	2	6	2966	2971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995318
56	NC_018299	CTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995319
57	NC_018299	GTG	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995319
58	NC_018299	GTC	2	6	3100	3105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995319
59	NC_018299	CGC	2	6	3129	3134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995319
60	NC_018299	GAC	2	6	3135	3140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995319
61	NC_018299	AAC	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995319
62	NC_018299	CGC	3	9	3270	3278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995319
63	NC_018299	TGC	2	6	3346	3351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995319
64	NC_018299	ACT	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995319
65	NC_018299	ACC	2	6	3378	3383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995319
66	NC_018299	GAA	2	6	3570	3575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995320
67	NC_018299	AAG	2	6	3592	3597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995320
68	NC_018299	CTT	2	6	3600	3605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995320
69	NC_018299	GCT	2	6	3643	3648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995320
70	NC_018299	CCA	2	6	3675	3680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995320
71	NC_018299	ACG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995320
72	NC_018299	CAT	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995320
73	NC_018299	GGC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018299	GGA	2	6	3982	3987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018299	CCG	2	6	4056	4061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018299	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018299	GAT	2	6	4134	4139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018299	CGG	2	6	4150	4155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018299	TGA	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018299	ATC	2	6	4172	4177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018299	TGC	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
82	NC_018299	AGC	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995321
83	NC_018299	GCC	2	6	4299	4304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995321
84	NC_018299	CTC	2	6	4371	4376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995321
85	NC_018299	GAA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995321
86	NC_018299	CTG	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
87	NC_018299	AAG	2	6	4456	4461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995321
88	NC_018299	TGG	2	6	4492	4497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995321
89	NC_018299	TTC	2	6	4654	4659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995321
90	NC_018299	GCC	2	6	4698	4703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995321
91	NC_018299	GAG	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995321
92	NC_018299	TCG	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
93	NC_018299	CGG	2	6	4849	4854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995321
94	NC_018299	GTC	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
95	NC_018299	TCG	2	6	5053	5058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
96	NC_018299	GAT	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995321
97	NC_018299	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995322
98	NC_018299	GTC	2	6	5466	5471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995322
99	NC_018299	CAT	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995322
100	NC_018299	ACC	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995322
101	NC_018299	GCT	2	6	5634	5639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018299	CCT	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_018299	TCG	2	6	5816	5821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995323
104	NC_018299	CGA	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995323
105	NC_018299	CGA	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995323
106	NC_018299	CCG	2	6	5896	5901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995323
107	NC_018299	ATG	2	6	6008	6013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995323
108	NC_018299	GCG	2	6	6014	6019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995323
109	NC_018299	GCG	2	6	6081	6086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995323
110	NC_018299	GAC	2	6	6121	6126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995323
111	NC_018299	GAA	2	6	6190	6195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018299	TCG	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018299	CTT	2	6	6286	6291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995324
114	NC_018299	CGA	2	6	6513	6518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995324
115	NC_018299	AAG	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995324
116	NC_018299	GCG	2	6	6722	6727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995324
117	NC_018299	GAC	2	6	6883	6888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995324
118	NC_018299	CGC	2	6	6946	6951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995324
119	NC_018299	CAT	2	6	6955	6960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995324
120	NC_018299	CCA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995324
121	NC_018299	ACG	2	6	7288	7293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995324
122	NC_018299	GAA	2	6	7396	7401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995324
123	NC_018299	CGC	2	6	7460	7465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995324
124	NC_018299	CCT	2	6	7480	7485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995324
125	NC_018299	CTT	2	6	7662	7667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995325
126	NC_018299	GCC	2	6	7720	7725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995325
127	NC_018299	GAC	2	6	7749	7754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995325
128	NC_018299	CGC	2	6	7763	7768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995325
129	NC_018299	GAT	2	6	7884	7889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995325
130	NC_018299	GCC	2	6	7911	7916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995325
131	NC_018299	CGG	2	6	7918	7923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995325
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232	NC_018299	GTC	2	6	14392	14397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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252	NC_018299	GGA	2	6	15970	15975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995337
253	NC_018299	CGC	2	6	15986	15991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995337
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255	NC_018299	CGA	2	6	16101	16106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995337
256	NC_018299	ATC	2	6	16406	16411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995337
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258	NC_018299	TGG	2	6	16429	16434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995337
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499	NC_018299	GGC	2	6	33103	33108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995354
500	NC_018299	ATG	2	6	33144	33149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995354

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