MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018299	CG	3	6	1028	1033	0 %	0 %	50 %	50 %	399995317
2	NC_018299	CG	3	6	2010	2015	0 %	0 %	50 %	50 %	399995317
3	NC_018299	CG	3	6	2211	2216	0 %	0 %	50 %	50 %	399995317
4	NC_018299	CG	3	6	2506	2511	0 %	0 %	50 %	50 %	399995317
5	NC_018299	GC	3	6	2532	2537	0 %	0 %	50 %	50 %	399995317
6	NC_018299	GC	3	6	3081	3086	0 %	0 %	50 %	50 %	399995319
7	NC_018299	GC	3	6	3234	3239	0 %	0 %	50 %	50 %	399995319
8	NC_018299	CG	3	6	3656	3661	0 %	0 %	50 %	50 %	399995320
9	NC_018299	GC	3	6	4142	4147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018299	CG	4	8	4484	4491	0 %	0 %	50 %	50 %	399995321
11	NC_018299	GC	3	6	4610	4615	0 %	0 %	50 %	50 %	399995321
12	NC_018299	CG	3	6	4931	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	399995321
13	NC_018299	CG	3	6	5047	5052	0 %	0 %	50 %	50 %	399995321
14	NC_018299	CG	3	6	5200	5205	0 %	0 %	50 %	50 %	399995321
15	NC_018299	GC	3	6	5674	5679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018299	GC	3	6	5798	5803	0 %	0 %	50 %	50 %	399995323
17	NC_018299	GC	3	6	5838	5843	0 %	0 %	50 %	50 %	399995323
18	NC_018299	CT	3	6	5959	5964	0 %	50 %	0 %	50 %	399995323
19	NC_018299	GC	3	6	6056	6061	0 %	0 %	50 %	50 %	399995323
20	NC_018299	TG	3	6	6065	6070	0 %	50 %	50 %	0 %	399995323
21	NC_018299	CG	3	6	6620	6625	0 %	0 %	50 %	50 %	399995324
22	NC_018299	CG	3	6	6782	6787	0 %	0 %	50 %	50 %	399995324
23	NC_018299	GC	4	8	8393	8400	0 %	0 %	50 %	50 %	399995325
24	NC_018299	GC	3	6	8524	8529	0 %	0 %	50 %	50 %	399995326
25	NC_018299	GC	3	6	8839	8844	0 %	0 %	50 %	50 %	399995326
26	NC_018299	GC	3	6	8873	8878	0 %	0 %	50 %	50 %	399995326
27	NC_018299	CT	3	6	9688	9693	0 %	50 %	0 %	50 %	399995327
28	NC_018299	GA	3	6	9819	9824	50 %	0 %	50 %	0 %	399995327
29	NC_018299	GC	3	6	10421	10426	0 %	0 %	50 %	50 %	399995330
30	NC_018299	TC	3	6	11130	11135	0 %	50 %	0 %	50 %	399995330
31	NC_018299	CG	3	6	12172	12177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018299	GA	3	6	12243	12248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018299	GA	3	6	12268	12273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018299	CA	3	6	12934	12939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018299	CG	3	6	13801	13806	0 %	0 %	50 %	50 %	399995334
36	NC_018299	GC	3	6	13995	14000	0 %	0 %	50 %	50 %	399995334
37	NC_018299	GC	3	6	14305	14310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018299	GC	3	6	14549	14554	0 %	0 %	50 %	50 %	399995335
39	NC_018299	GC	3	6	14776	14781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018299	GC	4	8	15449	15456	0 %	0 %	50 %	50 %	399995336
41	NC_018299	CG	3	6	15499	15504	0 %	0 %	50 %	50 %	399995336
42	NC_018299	GA	3	6	15738	15743	50 %	0 %	50 %	0 %	399995337
43	NC_018299	GC	3	6	16304	16309	0 %	0 %	50 %	50 %	399995337
44	NC_018299	CG	3	6	17258	17263	0 %	0 %	50 %	50 %	399995337
45	NC_018299	CG	3	6	17952	17957	0 %	0 %	50 %	50 %	399995338
46	NC_018299	CG	3	6	18361	18366	0 %	0 %	50 %	50 %	399995338
47	NC_018299	CG	4	8	19079	19086	0 %	0 %	50 %	50 %	399995339
48	NC_018299	AG	3	6	19999	20004	50 %	0 %	50 %	0 %	399995340
49	NC_018299	GC	3	6	21348	21353	0 %	0 %	50 %	50 %	399995341
50	NC_018299	TC	3	6	22071	22076	0 %	50 %	0 %	50 %	399995342
51	NC_018299	CG	3	6	22452	22457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018299	CG	3	6	22575	22580	0 %	0 %	50 %	50 %	399995343
53	NC_018299	CT	3	6	22829	22834	0 %	50 %	0 %	50 %	399995343
54	NC_018299	CG	3	6	23019	23024	0 %	0 %	50 %	50 %	399995344
55	NC_018299	GC	3	6	23272	23277	0 %	0 %	50 %	50 %	399995344
56	NC_018299	GC	3	6	23338	23343	0 %	0 %	50 %	50 %	399995344
57	NC_018299	CG	4	8	23842	23849	0 %	0 %	50 %	50 %	399995345
58	NC_018299	GC	3	6	24543	24548	0 %	0 %	50 %	50 %	399995345
59	NC_018299	CG	3	6	24607	24612	0 %	0 %	50 %	50 %	399995345
60	NC_018299	CG	4	8	24863	24870	0 %	0 %	50 %	50 %	399995345
61	NC_018299	GC	3	6	24928	24933	0 %	0 %	50 %	50 %	399995345
62	NC_018299	CG	3	6	25524	25529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018299	TG	3	6	25832	25837	0 %	50 %	50 %	0 %	399995346
64	NC_018299	CG	3	6	26001	26006	0 %	0 %	50 %	50 %	399995346
65	NC_018299	GA	3	6	26392	26397	50 %	0 %	50 %	0 %	399995347
66	NC_018299	GC	3	6	26742	26747	0 %	0 %	50 %	50 %	399995347
67	NC_018299	GC	3	6	27170	27175	0 %	0 %	50 %	50 %	399995347
68	NC_018299	GC	4	8	27437	27444	0 %	0 %	50 %	50 %	399995347
69	NC_018299	CG	3	6	27738	27743	0 %	0 %	50 %	50 %	399995348
70	NC_018299	CG	3	6	28165	28170	0 %	0 %	50 %	50 %	399995349
71	NC_018299	CT	3	6	28821	28826	0 %	50 %	0 %	50 %	399995350
72	NC_018299	CG	3	6	29115	29120	0 %	0 %	50 %	50 %	399995351
73	NC_018299	GC	3	6	29220	29225	0 %	0 %	50 %	50 %	399995351
74	NC_018299	CT	4	8	30082	30089	0 %	50 %	0 %	50 %	399995353
75	NC_018299	CG	3	6	30242	30247	0 %	0 %	50 %	50 %	399995353
76	NC_018299	GA	3	6	30301	30306	50 %	0 %	50 %	0 %	399995353
77	NC_018299	CG	3	6	30832	30837	0 %	0 %	50 %	50 %	399995353
78	NC_018299	GC	3	6	30870	30875	0 %	0 %	50 %	50 %	399995353
79	NC_018299	GC	3	6	31365	31370	0 %	0 %	50 %	50 %	399995353
80	NC_018299	CG	3	6	32970	32975	0 %	0 %	50 %	50 %	399995354
81	NC_018299	AC	3	6	33887	33892	50 %	0 %	0 %	50 %	399995355
82	NC_018299	CT	3	6	33961	33966	0 %	50 %	0 %	50 %	399995355
83	NC_018299	TC	3	6	34556	34561	0 %	50 %	0 %	50 %	399995355
84	NC_018299	TG	3	6	34707	34712	0 %	50 %	50 %	0 %	399995356
85	NC_018299	GC	3	6	34859	34864	0 %	0 %	50 %	50 %	399995356
86	NC_018299	TC	3	6	35103	35108	0 %	50 %	0 %	50 %	399995356
87	NC_018299	CG	3	6	35146	35151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018299	CG	3	6	35242	35247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018299	CG	3	6	35334	35339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018299	TG	3	6	35359	35364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018299	CG	3	6	35425	35430	0 %	0 %	50 %	50 %	399995357
92	NC_018299	CG	3	6	36167	36172	0 %	0 %	50 %	50 %	399995357
93	NC_018299	TC	3	6	36605	36610	0 %	50 %	0 %	50 %	399995357
94	NC_018299	CG	3	6	36954	36959	0 %	0 %	50 %	50 %	399995357
95	NC_018299	GT	3	6	37374	37379	0 %	50 %	50 %	0 %	399995357
96	NC_018299	TC	3	6	37619	37624	0 %	50 %	0 %	50 %	399995357
97	NC_018299	GC	3	6	37926	37931	0 %	0 %	50 %	50 %	399995358
98	NC_018299	TC	3	6	38563	38568	0 %	50 %	0 %	50 %	399995359
99	NC_018299	TC	3	6	38622	38627	0 %	50 %	0 %	50 %	399995359
100	NC_018299	CG	3	6	39741	39746	0 %	0 %	50 %	50 %	399995361
101	NC_018299	CG	3	6	39858	39863	0 %	0 %	50 %	50 %	399995361
102	NC_018299	GC	3	6	39875	39880	0 %	0 %	50 %	50 %	399995361
103	NC_018299	CT	3	6	39890	39895	0 %	50 %	0 %	50 %	399995361
104	NC_018299	GC	3	6	39930	39935	0 %	0 %	50 %	50 %	399995361
105	NC_018299	GC	3	6	40208	40213	0 %	0 %	50 %	50 %	399995361
106	NC_018299	CG	3	6	40289	40294	0 %	0 %	50 %	50 %	399995361
107	NC_018299	CG	3	6	40802	40807	0 %	0 %	50 %	50 %	399995361
108	NC_018299	GT	3	6	41231	41236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018299	AC	3	6	41652	41657	50 %	0 %	0 %	50 %	399995363
110	NC_018299	AC	3	6	41798	41803	50 %	0 %	0 %	50 %	399995364
111	NC_018299	CG	3	6	42060	42065	0 %	0 %	50 %	50 %	399995364
112	NC_018299	AG	3	6	42726	42731	50 %	0 %	50 %	0 %	399995364
113	NC_018299	CG	3	6	43007	43012	0 %	0 %	50 %	50 %	399995365
114	NC_018299	TC	3	6	43648	43653	0 %	50 %	0 %	50 %	399995367
115	NC_018299	CG	3	6	43783	43788	0 %	0 %	50 %	50 %	399995368
116	NC_018299	CG	3	6	44097	44102	0 %	0 %	50 %	50 %	399995368
117	NC_018299	GC	3	6	44312	44317	0 %	0 %	50 %	50 %	399995368
118	NC_018299	GC	3	6	44345	44350	0 %	0 %	50 %	50 %	399995368
119	NC_018299	AG	3	6	44613	44618	50 %	0 %	50 %	0 %	399995368
120	NC_018299	GC	3	6	44647	44652	0 %	0 %	50 %	50 %	399995368
121	NC_018299	GC	3	6	44973	44978	0 %	0 %	50 %	50 %	399995369
122	NC_018299	GC	3	6	45142	45147	0 %	0 %	50 %	50 %	399995369
123	NC_018299	CG	3	6	45619	45624	0 %	0 %	50 %	50 %	399995369
124	NC_018299	GC	3	6	45658	45663	0 %	0 %	50 %	50 %	399995369
125	NC_018299	AT	3	6	46210	46215	50 %	50 %	0 %	0 %	399995370
126	NC_018299	AC	3	6	46292	46297	50 %	0 %	0 %	50 %	399995370
127	NC_018299	AC	3	6	46752	46757	50 %	0 %	0 %	50 %	399995371
128	NC_018299	CA	3	6	46777	46782	50 %	0 %	0 %	50 %	399995371
129	NC_018299	AG	3	6	46808	46813	50 %	0 %	50 %	0 %	399995371
130	NC_018299	GC	3	6	46954	46959	0 %	0 %	50 %	50 %	399995371
131	NC_018299	CG	3	6	47091	47096	0 %	0 %	50 %	50 %	399995371
132	NC_018299	GC	3	6	47453	47458	0 %	0 %	50 %	50 %	399995372
133	NC_018299	CA	3	6	47483	47488	50 %	0 %	0 %	50 %	399995372
134	NC_018299	GC	3	6	47853	47858	0 %	0 %	50 %	50 %	399995374
135	NC_018299	CG	3	6	48256	48261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018299	CG	3	6	49273	49278	0 %	0 %	50 %	50 %	399995376
137	NC_018299	CG	3	6	49561	49566	0 %	0 %	50 %	50 %	399995376
138	NC_018299	TG	3	6	49997	50002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018299	CG	3	6	50039	50044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018299	TC	3	6	50154	50159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018299	GC	3	6	50630	50635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018299	GC	3	6	51553	51558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018299	CG	3	6	51634	51639	0 %	0 %	50 %	50 %	399995379
144	NC_018299	CG	3	6	52764	52769	0 %	0 %	50 %	50 %	399995381
145	NC_018299	CG	3	6	53011	53016	0 %	0 %	50 %	50 %	399995381
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