MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018299	GC	3	6	4142	4147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018299	GC	3	6	5674	5679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018299	CG	3	6	12172	12177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018299	GA	3	6	12243	12248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018299	GA	3	6	12268	12273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018299	CA	3	6	12934	12939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018299	GC	3	6	14305	14310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018299	GC	3	6	14776	14781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018299	CG	3	6	22452	22457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018299	CG	3	6	25524	25529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018299	CG	3	6	35146	35151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018299	CG	3	6	35242	35247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018299	CG	3	6	35334	35339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018299	TG	3	6	35359	35364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018299	GT	3	6	41231	41236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018299	CG	3	6	48256	48261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018299	TG	3	6	49997	50002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018299	CG	3	6	50039	50044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018299	TC	3	6	50154	50159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018299	GC	3	6	50630	50635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018299	GC	3	6	51553	51558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018299	CG	3	6	54813	54818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018299	GA	3	6	57562	57567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018299	GC	3	6	58865	58870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018299	AC	3	6	73210	73215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018299	AT	4	8	74132	74139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018299	TG	3	6	82237	82242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018299	CT	3	6	85564	85569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018299	CT	3	6	91024	91029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018299	CA	3	6	91224	91229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018299	GC	3	6	91238	91243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018299	CG	3	6	97757	97762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018299	CG	3	6	99820	99825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018299	CG	4	8	102692	102699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018299	GA	3	6	103024	103029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018299	AC	3	6	104337	104342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018299	GC	3	6	104356	104361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018299	GA	4	8	113732	113739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018299	GA	3	6	121388	121393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018299	GC	3	6	122891	122896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018299	GC	3	6	128062	128067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018299	GC	3	6	134004	134009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018299	TC	4	8	134279	134286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018299	GC	3	6	151310	151315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018299	CT	3	6	155326	155331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018299	CG	3	6	159064	159069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018299	AT	3	6	167332	167337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018299	CG	3	6	179255	179260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018299	CG	3	6	184790	184795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018299	GT	3	6	185442	185447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018299	CG	3	6	187396	187401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018299	GC	3	6	192961	192966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018299	GA	3	6	195049	195054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018299	AG	3	6	197365	197370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018299	CT	3	6	197432	197437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018299	AG	3	6	199909	199914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018299	CT	3	6	199924	199929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018299	CG	3	6	200384	200389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018299	GC	4	8	202324	202331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018299	GA	3	6	203391	203396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018299	GA	3	6	204034	204039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018299	GC	3	6	209621	209626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018299	GC	4	8	209670	209677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018299	GC	3	6	211714	211719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018299	TC	3	6	212163	212168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018299	CG	3	6	212232	212237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018299	TC	3	6	213832	213837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018299	CG	3	6	228307	228312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018299	GA	3	6	229479	229484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018299	CG	3	6	229490	229495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018299	GC	3	6	229964	229969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018299	GC	3	6	231556	231561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018299	GC	3	6	232440	232445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018299	GC	3	6	233507	233512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018299	GC	3	6	238683	238688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018299	CG	3	6	241760	241765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018299	GC	3	6	242234	242239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018299	GC	3	6	244234	244239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018299	TG	3	6	247754	247759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.