MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018294	GCGG	2	8	351	358	0 %	0 %	75 %	25 %	399995010
2	NC_018294	CGGC	2	8	969	976	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
3	NC_018294	TCGG	2	8	1682	1689	0 %	25 %	50 %	25 %	399995011
4	NC_018294	AACC	2	8	1884	1891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018294	CGAT	2	8	1906	1913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018294	CGAG	2	8	3042	3049	25 %	0 %	50 %	25 %	399995013
7	NC_018294	CCGG	2	8	3917	3924	0 %	0 %	50 %	50 %	399995013
8	NC_018294	TTCG	2	8	4743	4750	0 %	50 %	25 %	25 %	399995015
9	NC_018294	GCAG	2	8	4791	4798	25 %	0 %	50 %	25 %	399995015
10	NC_018294	GGCT	2	8	4884	4891	0 %	25 %	50 %	25 %	399995015
11	NC_018294	CCGC	2	8	5313	5320	0 %	0 %	25 %	75 %	399995016
12	NC_018294	CGCT	2	8	5540	5547	0 %	25 %	25 %	50 %	399995016
13	NC_018294	GATG	2	8	6093	6100	25 %	25 %	50 %	0 %	399995017
14	NC_018294	GACA	2	8	6172	6179	50 %	0 %	25 %	25 %	399995017
15	NC_018294	GCCG	2	8	6587	6594	0 %	0 %	50 %	50 %	399995018
16	NC_018294	ACCT	2	8	6728	6735	25 %	25 %	0 %	50 %	399995018
17	NC_018294	ATCA	2	8	7040	7047	50 %	25 %	0 %	25 %	399995018
18	NC_018294	TCCC	2	8	7140	7147	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_018294	TGCT	2	8	7437	7444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018294	CGTC	2	8	7489	7496	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018294	CAAG	2	8	7636	7643	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018294	GATC	2	8	7690	7697	25 %	25 %	25 %	25 %	399995020
23	NC_018294	CGTC	2	8	7894	7901	0 %	25 %	25 %	50 %	399995020
24	NC_018294	CAGG	2	8	8633	8640	25 %	0 %	50 %	25 %	399995021
25	NC_018294	ATGG	2	8	8843	8850	25 %	25 %	50 %	0 %	399995022
26	NC_018294	ACCT	2	8	9625	9632	25 %	25 %	0 %	50 %	399995023
27	NC_018294	ATGG	2	8	9799	9806	25 %	25 %	50 %	0 %	399995023
28	NC_018294	GGCG	2	8	10301	10308	0 %	0 %	75 %	25 %	399995024
29	NC_018294	TTGG	2	8	10413	10420	0 %	50 %	50 %	0 %	399995024
30	NC_018294	GCGG	2	8	11492	11499	0 %	0 %	75 %	25 %	399995027
31	NC_018294	ATAA	2	8	12097	12104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018294	CGAT	2	8	12397	12404	25 %	25 %	25 %	25 %	399995028
33	NC_018294	ATCT	2	8	12554	12561	25 %	50 %	0 %	25 %	399995028
34	NC_018294	GGGC	2	8	13481	13488	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018294	AGGG	2	8	13682	13689	25 %	0 %	75 %	0 %	399995030
36	NC_018294	ACTC	2	8	14307	14314	25 %	25 %	0 %	50 %	399995031
37	NC_018294	TCCG	2	8	14416	14423	0 %	25 %	25 %	50 %	399995031
38	NC_018294	GCCG	2	8	14630	14637	0 %	0 %	50 %	50 %	399995031
39	NC_018294	GCCC	2	8	15720	15727	0 %	0 %	25 %	75 %	399995032
40	NC_018294	GCGG	2	8	16512	16519	0 %	0 %	75 %	25 %	399995034
41	NC_018294	CAGC	2	8	16577	16584	25 %	0 %	25 %	50 %	399995034
42	NC_018294	CTGG	2	8	16845	16852	0 %	25 %	50 %	25 %	399995035
43	NC_018294	CCTT	2	8	17144	17151	0 %	50 %	0 %	50 %	399995035
44	NC_018294	CCAT	2	8	18073	18080	25 %	25 %	0 %	50 %	399995036
45	NC_018294	CGCT	2	8	18390	18397	0 %	25 %	25 %	50 %	399995036
46	NC_018294	CAAT	2	8	18403	18410	50 %	25 %	0 %	25 %	399995036
47	NC_018294	CGTC	2	8	19043	19050	0 %	25 %	25 %	50 %	399995037
48	NC_018294	TTCT	2	8	20055	20062	0 %	75 %	0 %	25 %	399995038
49	NC_018294	CTTC	2	8	20135	20142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018294	CGGC	2	8	20963	20970	0 %	0 %	50 %	50 %	399995039
51	NC_018294	CATG	2	8	20991	20998	25 %	25 %	25 %	25 %	399995039
52	NC_018294	GGCC	2	8	21207	21214	0 %	0 %	50 %	50 %	399995039
53	NC_018294	AGCG	2	8	21222	21229	25 %	0 %	50 %	25 %	399995039
54	NC_018294	TATC	2	8	21307	21314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018294	ACCC	2	8	21337	21344	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_018294	ATCT	2	8	21368	21375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018294	CCGG	2	8	21771	21778	0 %	0 %	50 %	50 %	399995040
58	NC_018294	TCGG	2	8	22081	22088	0 %	25 %	50 %	25 %	399995041
59	NC_018294	ATGC	2	8	22969	22976	25 %	25 %	25 %	25 %	399995043
60	NC_018294	TTCG	2	8	23423	23430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018294	TGAA	2	8	23860	23867	50 %	25 %	25 %	0 %	399995044
62	NC_018294	GCTG	2	8	24171	24178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018294	GTTT	2	8	24355	24362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018294	TCGG	2	8	24366	24373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018294	TTCG	2	8	25014	25021	0 %	50 %	25 %	25 %	399995046
66	NC_018294	CTTG	2	8	25042	25049	0 %	50 %	25 %	25 %	399995046
67	NC_018294	GCAA	2	8	25094	25101	50 %	0 %	25 %	25 %	399995046
68	NC_018294	CGCA	2	8	25302	25309	25 %	0 %	25 %	50 %	399995047
69	NC_018294	CGGG	2	8	25983	25990	0 %	0 %	75 %	25 %	399995048
70	NC_018294	GGCT	2	8	27748	27755	0 %	25 %	50 %	25 %	399995049
71	NC_018294	TTAA	2	8	27921	27928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018294	CGCC	2	8	27962	27969	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_018294	TGCG	2	8	28539	28546	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018294	TCCA	2	8	29069	29076	25 %	25 %	0 %	50 %	399995051
75	NC_018294	TCGA	2	8	29277	29284	25 %	25 %	25 %	25 %	399995051
76	NC_018294	GATG	2	8	29285	29292	25 %	25 %	50 %	0 %	399995051
77	NC_018294	ATTC	2	8	30113	30120	25 %	50 %	0 %	25 %	399995051
78	NC_018294	GGTC	2	8	30318	30325	0 %	25 %	50 %	25 %	399995052
79	NC_018294	CGGG	2	8	30382	30389	0 %	0 %	75 %	25 %	399995052
80	NC_018294	CCGA	2	8	30494	30501	25 %	0 %	25 %	50 %	399995052
81	NC_018294	CCGG	2	8	31322	31329	0 %	0 %	50 %	50 %	399995052
82	NC_018294	GAGC	2	8	31654	31661	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018294	CTGT	2	8	31958	31965	0 %	50 %	25 %	25 %	399995053
84	NC_018294	ACGG	2	8	31997	32004	25 %	0 %	50 %	25 %	399995053
85	NC_018294	TTCC	2	8	32141	32148	0 %	50 %	0 %	50 %	399995053
86	NC_018294	CTAT	2	8	32386	32393	25 %	50 %	0 %	25 %	399995053
87	NC_018294	ACGC	2	8	32782	32789	25 %	0 %	25 %	50 %	399995053
88	NC_018294	TGAA	2	8	32877	32884	50 %	25 %	25 %	0 %	399995053
89	NC_018294	GGCT	2	8	33542	33549	0 %	25 %	50 %	25 %	399995054
90	NC_018294	GCAT	2	8	33656	33663	25 %	25 %	25 %	25 %	399995054
91	NC_018294	TGGG	2	8	33955	33962	0 %	25 %	75 %	0 %	399995054
92	NC_018294	CTTG	2	8	34123	34130	0 %	50 %	25 %	25 %	399995054
93	NC_018294	GGTG	2	8	34394	34401	0 %	25 %	75 %	0 %	399995055
94	NC_018294	CGGA	2	8	35002	35009	25 %	0 %	50 %	25 %	399995055
95	NC_018294	CTCG	2	8	35069	35076	0 %	25 %	25 %	50 %	399995055
96	NC_018294	CTTC	2	8	36195	36202	0 %	50 %	0 %	50 %	399995057
97	NC_018294	CACC	2	8	36702	36709	25 %	0 %	0 %	75 %	399995057
98	NC_018294	CTCC	2	8	38006	38013	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_018294	GCCT	2	8	38210	38217	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018294	GAAC	2	8	38954	38961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018294	ATCC	2	8	39727	39734	25 %	25 %	0 %	50 %	399995061
102	NC_018294	CCGA	2	8	42182	42189	25 %	0 %	25 %	50 %	399995063
103	NC_018294	GCGA	2	8	42361	42368	25 %	0 %	50 %	25 %	399995063
104	NC_018294	CCTG	2	8	43615	43622	0 %	25 %	25 %	50 %	399995064
105	NC_018294	CCGA	2	8	44034	44041	25 %	0 %	25 %	50 %	399995064
106	NC_018294	GATC	2	8	44231	44238	25 %	25 %	25 %	25 %	399995064
107	NC_018294	AAGG	2	8	44255	44262	50 %	0 %	50 %	0 %	399995064
108	NC_018294	ATCC	2	8	44279	44286	25 %	25 %	0 %	50 %	399995064
109	NC_018294	CTTG	2	8	44387	44394	0 %	50 %	25 %	25 %	399995064
110	NC_018294	CTGA	2	8	44746	44753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018294	GTTT	2	8	45032	45039	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018294	AGCG	2	8	45328	45335	25 %	0 %	50 %	25 %	399995065
113	NC_018294	AGCG	2	8	45785	45792	25 %	0 %	50 %	25 %	399995066
114	NC_018294	GTCA	2	8	45845	45852	25 %	25 %	25 %	25 %	399995066
115	NC_018294	CGAC	2	8	46534	46541	25 %	0 %	25 %	50 %	399995066
116	NC_018294	GCAC	2	8	47003	47010	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018294	CTGC	2	8	47036	47043	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018294	GCCT	2	8	47122	47129	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018294	CGGA	2	8	47141	47148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018294	TGGA	2	8	47273	47280	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018294	GGAA	2	8	47361	47368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018294	GATC	2	8	47829	47836	25 %	25 %	25 %	25 %	399995068
123	NC_018294	CCGG	2	8	48175	48182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018294	CGCA	2	8	48584	48591	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018294	TCCA	2	8	48842	48849	25 %	25 %	0 %	50 %	399995069
126	NC_018294	TGAA	2	8	49437	49444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018294	CGTT	2	8	49467	49474	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018294	CGCA	2	8	50005	50012	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018294	TCTT	2	8	50367	50374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018294	AAGG	2	8	50768	50775	50 %	0 %	50 %	0 %	399995072
131	NC_018294	GATC	2	8	51214	51221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018294	CGTT	2	8	52259	52266	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_018294	AGCG	2	8	52319	52326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018294	GCAC	2	8	52377	52384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018294	GACC	2	8	52525	52532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018294	GCCG	2	8	52668	52675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018294	TCGA	2	8	52920	52927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018294	TCCG	2	8	52955	52962	0 %	25 %	25 %	50 %	399995075
139	NC_018294	CCAT	2	8	52986	52993	25 %	25 %	0 %	50 %	399995075
140	NC_018294	CCGA	2	8	53544	53551	25 %	0 %	25 %	50 %	399995077
141	NC_018294	GTCG	2	8	54032	54039	0 %	25 %	50 %	25 %	399995077
142	NC_018294	GCCG	2	8	54257	54264	0 %	0 %	50 %	50 %	399995077
143	NC_018294	CAAC	2	8	54497	54504	50 %	0 %	0 %	50 %	399995077
144	NC_018294	TCCA	2	8	54582	54589	25 %	25 %	0 %	50 %	399995077
145	NC_018294	CCCG	2	8	54631	54638	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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