MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018294	GCGG	2	8	351	358	0 %	0 %	75 %	25 %	399995010
2	NC_018294	CGGC	2	8	969	976	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
3	NC_018294	TCGG	2	8	1682	1689	0 %	25 %	50 %	25 %	399995011
4	NC_018294	CGAG	2	8	3042	3049	25 %	0 %	50 %	25 %	399995013
5	NC_018294	CCGG	2	8	3917	3924	0 %	0 %	50 %	50 %	399995013
6	NC_018294	TTCG	2	8	4743	4750	0 %	50 %	25 %	25 %	399995015
7	NC_018294	GCAG	2	8	4791	4798	25 %	0 %	50 %	25 %	399995015
8	NC_018294	GGCT	2	8	4884	4891	0 %	25 %	50 %	25 %	399995015
9	NC_018294	CCGC	2	8	5313	5320	0 %	0 %	25 %	75 %	399995016
10	NC_018294	CGCT	2	8	5540	5547	0 %	25 %	25 %	50 %	399995016
11	NC_018294	GATG	2	8	6093	6100	25 %	25 %	50 %	0 %	399995017
12	NC_018294	GACA	2	8	6172	6179	50 %	0 %	25 %	25 %	399995017
13	NC_018294	GCCG	2	8	6587	6594	0 %	0 %	50 %	50 %	399995018
14	NC_018294	ACCT	2	8	6728	6735	25 %	25 %	0 %	50 %	399995018
15	NC_018294	ATCA	2	8	7040	7047	50 %	25 %	0 %	25 %	399995018
16	NC_018294	GATC	2	8	7690	7697	25 %	25 %	25 %	25 %	399995020
17	NC_018294	CGTC	2	8	7894	7901	0 %	25 %	25 %	50 %	399995020
18	NC_018294	CAGG	2	8	8633	8640	25 %	0 %	50 %	25 %	399995021
19	NC_018294	ATGG	2	8	8843	8850	25 %	25 %	50 %	0 %	399995022
20	NC_018294	ACCT	2	8	9625	9632	25 %	25 %	0 %	50 %	399995023
21	NC_018294	ATGG	2	8	9799	9806	25 %	25 %	50 %	0 %	399995023
22	NC_018294	GGCG	2	8	10301	10308	0 %	0 %	75 %	25 %	399995024
23	NC_018294	TTGG	2	8	10413	10420	0 %	50 %	50 %	0 %	399995024
24	NC_018294	GCGG	2	8	11492	11499	0 %	0 %	75 %	25 %	399995027
25	NC_018294	CGAT	2	8	12397	12404	25 %	25 %	25 %	25 %	399995028
26	NC_018294	ATCT	2	8	12554	12561	25 %	50 %	0 %	25 %	399995028
27	NC_018294	AGGG	2	8	13682	13689	25 %	0 %	75 %	0 %	399995030
28	NC_018294	ACTC	2	8	14307	14314	25 %	25 %	0 %	50 %	399995031
29	NC_018294	TCCG	2	8	14416	14423	0 %	25 %	25 %	50 %	399995031
30	NC_018294	GCCG	2	8	14630	14637	0 %	0 %	50 %	50 %	399995031
31	NC_018294	GCCC	2	8	15720	15727	0 %	0 %	25 %	75 %	399995032
32	NC_018294	GCGG	2	8	16512	16519	0 %	0 %	75 %	25 %	399995034
33	NC_018294	CAGC	2	8	16577	16584	25 %	0 %	25 %	50 %	399995034
34	NC_018294	CTGG	2	8	16845	16852	0 %	25 %	50 %	25 %	399995035
35	NC_018294	CCTT	2	8	17144	17151	0 %	50 %	0 %	50 %	399995035
36	NC_018294	CCAT	2	8	18073	18080	25 %	25 %	0 %	50 %	399995036
37	NC_018294	CGCT	2	8	18390	18397	0 %	25 %	25 %	50 %	399995036
38	NC_018294	CAAT	2	8	18403	18410	50 %	25 %	0 %	25 %	399995036
39	NC_018294	CGTC	2	8	19043	19050	0 %	25 %	25 %	50 %	399995037
40	NC_018294	TTCT	2	8	20055	20062	0 %	75 %	0 %	25 %	399995038
41	NC_018294	CGGC	2	8	20963	20970	0 %	0 %	50 %	50 %	399995039
42	NC_018294	CATG	2	8	20991	20998	25 %	25 %	25 %	25 %	399995039
43	NC_018294	GGCC	2	8	21207	21214	0 %	0 %	50 %	50 %	399995039
44	NC_018294	AGCG	2	8	21222	21229	25 %	0 %	50 %	25 %	399995039
45	NC_018294	CCGG	2	8	21771	21778	0 %	0 %	50 %	50 %	399995040
46	NC_018294	TCGG	2	8	22081	22088	0 %	25 %	50 %	25 %	399995041
47	NC_018294	ATGC	2	8	22969	22976	25 %	25 %	25 %	25 %	399995043
48	NC_018294	TGAA	2	8	23860	23867	50 %	25 %	25 %	0 %	399995044
49	NC_018294	TTCG	2	8	25014	25021	0 %	50 %	25 %	25 %	399995046
50	NC_018294	CTTG	2	8	25042	25049	0 %	50 %	25 %	25 %	399995046
51	NC_018294	GCAA	2	8	25094	25101	50 %	0 %	25 %	25 %	399995046
52	NC_018294	CGCA	2	8	25302	25309	25 %	0 %	25 %	50 %	399995047
53	NC_018294	CGGG	2	8	25983	25990	0 %	0 %	75 %	25 %	399995048
54	NC_018294	GGCT	2	8	27748	27755	0 %	25 %	50 %	25 %	399995049
55	NC_018294	TCCA	2	8	29069	29076	25 %	25 %	0 %	50 %	399995051
56	NC_018294	TCGA	2	8	29277	29284	25 %	25 %	25 %	25 %	399995051
57	NC_018294	GATG	2	8	29285	29292	25 %	25 %	50 %	0 %	399995051
58	NC_018294	ATTC	2	8	30113	30120	25 %	50 %	0 %	25 %	399995051
59	NC_018294	GGTC	2	8	30318	30325	0 %	25 %	50 %	25 %	399995052
60	NC_018294	CGGG	2	8	30382	30389	0 %	0 %	75 %	25 %	399995052
61	NC_018294	CCGA	2	8	30494	30501	25 %	0 %	25 %	50 %	399995052
62	NC_018294	CCGG	2	8	31322	31329	0 %	0 %	50 %	50 %	399995052
63	NC_018294	CTGT	2	8	31958	31965	0 %	50 %	25 %	25 %	399995053
64	NC_018294	ACGG	2	8	31997	32004	25 %	0 %	50 %	25 %	399995053
65	NC_018294	TTCC	2	8	32141	32148	0 %	50 %	0 %	50 %	399995053
66	NC_018294	CTAT	2	8	32386	32393	25 %	50 %	0 %	25 %	399995053
67	NC_018294	ACGC	2	8	32782	32789	25 %	0 %	25 %	50 %	399995053
68	NC_018294	TGAA	2	8	32877	32884	50 %	25 %	25 %	0 %	399995053
69	NC_018294	GGCT	2	8	33542	33549	0 %	25 %	50 %	25 %	399995054
70	NC_018294	GCAT	2	8	33656	33663	25 %	25 %	25 %	25 %	399995054
71	NC_018294	TGGG	2	8	33955	33962	0 %	25 %	75 %	0 %	399995054
72	NC_018294	CTTG	2	8	34123	34130	0 %	50 %	25 %	25 %	399995054
73	NC_018294	GGTG	2	8	34394	34401	0 %	25 %	75 %	0 %	399995055
74	NC_018294	CGGA	2	8	35002	35009	25 %	0 %	50 %	25 %	399995055
75	NC_018294	CTCG	2	8	35069	35076	0 %	25 %	25 %	50 %	399995055
76	NC_018294	CTTC	2	8	36195	36202	0 %	50 %	0 %	50 %	399995057
77	NC_018294	CACC	2	8	36702	36709	25 %	0 %	0 %	75 %	399995057
78	NC_018294	ATCC	2	8	39727	39734	25 %	25 %	0 %	50 %	399995061
79	NC_018294	CCGA	2	8	42182	42189	25 %	0 %	25 %	50 %	399995063
80	NC_018294	GCGA	2	8	42361	42368	25 %	0 %	50 %	25 %	399995063
81	NC_018294	CCTG	2	8	43615	43622	0 %	25 %	25 %	50 %	399995064
82	NC_018294	CCGA	2	8	44034	44041	25 %	0 %	25 %	50 %	399995064
83	NC_018294	GATC	2	8	44231	44238	25 %	25 %	25 %	25 %	399995064
84	NC_018294	AAGG	2	8	44255	44262	50 %	0 %	50 %	0 %	399995064
85	NC_018294	ATCC	2	8	44279	44286	25 %	25 %	0 %	50 %	399995064
86	NC_018294	CTTG	2	8	44387	44394	0 %	50 %	25 %	25 %	399995064
87	NC_018294	AGCG	2	8	45328	45335	25 %	0 %	50 %	25 %	399995065
88	NC_018294	AGCG	2	8	45785	45792	25 %	0 %	50 %	25 %	399995066
89	NC_018294	GTCA	2	8	45845	45852	25 %	25 %	25 %	25 %	399995066
90	NC_018294	CGAC	2	8	46534	46541	25 %	0 %	25 %	50 %	399995066
91	NC_018294	GATC	2	8	47829	47836	25 %	25 %	25 %	25 %	399995068
92	NC_018294	TCCA	2	8	48842	48849	25 %	25 %	0 %	50 %	399995069
93	NC_018294	AAGG	2	8	50768	50775	50 %	0 %	50 %	0 %	399995072
94	NC_018294	TCCG	2	8	52955	52962	0 %	25 %	25 %	50 %	399995075
95	NC_018294	CCAT	2	8	52986	52993	25 %	25 %	0 %	50 %	399995075
96	NC_018294	CCGA	2	8	53544	53551	25 %	0 %	25 %	50 %	399995077
97	NC_018294	GTCG	2	8	54032	54039	0 %	25 %	50 %	25 %	399995077
98	NC_018294	GCCG	2	8	54257	54264	0 %	0 %	50 %	50 %	399995077
99	NC_018294	CAAC	2	8	54497	54504	50 %	0 %	0 %	50 %	399995077
100	NC_018294	TCCA	2	8	54582	54589	25 %	25 %	0 %	50 %	399995077
101	NC_018294	GCCA	2	8	55498	55505	25 %	0 %	25 %	50 %	399995078
102	NC_018294	TTGG	2	8	57278	57285	0 %	50 %	50 %	0 %	399995079
103	NC_018294	GAAC	2	8	57871	57878	50 %	0 %	25 %	25 %	399995080
104	NC_018294	CTTT	2	8	59008	59015	0 %	75 %	0 %	25 %	399995080
105	NC_018294	TTGC	2	8	59091	59098	0 %	50 %	25 %	25 %	399995080
106	NC_018294	CTGC	2	8	59257	59264	0 %	25 %	25 %	50 %	399995080
107	NC_018294	ATGA	2	8	60362	60369	50 %	25 %	25 %	0 %	399995081
108	NC_018294	CAGT	2	8	60574	60581	25 %	25 %	25 %	25 %	399995081
109	NC_018294	GCTT	2	8	61673	61680	0 %	50 %	25 %	25 %	399995082
110	NC_018294	GATT	2	8	64289	64296	25 %	50 %	25 %	0 %	399995084
111	NC_018294	AGGA	2	8	65375	65382	50 %	0 %	50 %	0 %	399995085
112	NC_018294	AGTG	2	8	65614	65621	25 %	25 %	50 %	0 %	399995086
113	NC_018294	CAAG	2	8	66125	66132	50 %	0 %	25 %	25 %	399995087
114	NC_018294	GCGG	2	8	66723	66730	0 %	0 %	75 %	25 %	399995088
115	NC_018294	CAGA	2	8	66792	66799	50 %	0 %	25 %	25 %	399995088
116	NC_018294	AAGC	2	8	67203	67210	50 %	0 %	25 %	25 %	399995088
117	NC_018294	GCGA	2	8	67560	67567	25 %	0 %	50 %	25 %	399995089
118	NC_018294	AGAA	2	8	67625	67632	75 %	0 %	25 %	0 %	399995089
119	NC_018294	CTTC	2	8	67963	67970	0 %	50 %	0 %	50 %	399995089
120	NC_018294	CATC	2	8	68062	68069	25 %	25 %	0 %	50 %	399995089
121	NC_018294	CTTG	2	8	68172	68179	0 %	50 %	25 %	25 %	399995090
122	NC_018294	CGTC	2	8	69556	69563	0 %	25 %	25 %	50 %	399995091
123	NC_018294	TGCG	2	8	70282	70289	0 %	25 %	50 %	25 %	399995092
124	NC_018294	GCTC	2	8	70581	70588	0 %	25 %	25 %	50 %	399995092
125	NC_018294	TTGA	2	8	71275	71282	25 %	50 %	25 %	0 %	399995093
126	NC_018294	CCTT	2	8	71542	71549	0 %	50 %	0 %	50 %	399995094
127	NC_018294	GTTT	2	8	71555	71562	0 %	75 %	25 %	0 %	399995094
128	NC_018294	GCCC	2	8	71694	71701	0 %	0 %	25 %	75 %	399995094
129	NC_018294	CGCC	2	8	72750	72757	0 %	0 %	25 %	75 %	399995095
130	NC_018294	TCGC	2	8	73234	73241	0 %	25 %	25 %	50 %	399995096
131	NC_018294	GTCA	2	8	74026	74033	25 %	25 %	25 %	25 %	399995096
132	NC_018294	CATG	2	8	74559	74566	25 %	25 %	25 %	25 %	399995096
133	NC_018294	AAGG	2	8	74841	74848	50 %	0 %	50 %	0 %	399995096
134	NC_018294	GCCG	2	8	75028	75035	0 %	0 %	50 %	50 %	399995097
135	NC_018294	GCGA	2	8	75053	75060	25 %	0 %	50 %	25 %	399995097
136	NC_018294	AGCG	2	8	75127	75134	25 %	0 %	50 %	25 %	399995097
137	NC_018294	GCAG	2	8	75813	75820	25 %	0 %	50 %	25 %	399995099
138	NC_018294	AGGC	2	8	76137	76144	25 %	0 %	50 %	25 %	399995099
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140	NC_018294	TGCC	2	8	76654	76661	0 %	25 %	25 %	50 %	399995100
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