MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 4043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018294	TGC	3	9	51	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018294	CCG	2	6	194	199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018294	TTC	2	6	210	215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018294	TCG	2	6	231	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995010
5	NC_018294	CCA	2	6	239	244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995010
6	NC_018294	GCG	2	6	294	299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995010
7	NC_018294	GTC	2	6	404	409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995010
8	NC_018294	GCC	2	6	462	467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
9	NC_018294	GAC	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
10	NC_018294	CGA	2	6	507	512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
11	NC_018294	GCC	2	6	556	561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
12	NC_018294	GCA	2	6	609	614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
13	NC_018294	GCC	2	6	673	678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
14	NC_018294	CCG	2	6	706	711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
15	NC_018294	ATC	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995010
16	NC_018294	CAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995010
17	NC_018294	TGC	2	6	814	819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018294	GGC	2	6	931	936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
19	NC_018294	GGC	2	6	1072	1077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
20	NC_018294	AAC	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995011
21	NC_018294	CTT	2	6	1135	1140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995011
22	NC_018294	TCG	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995011
23	NC_018294	CGG	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
24	NC_018294	CGA	2	6	1260	1265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995011
25	NC_018294	GCG	2	6	1333	1338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
26	NC_018294	GCC	2	6	1367	1372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995011
27	NC_018294	CGT	2	6	1393	1398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995011
28	NC_018294	CGG	2	6	1405	1410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
29	NC_018294	CCA	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995011
30	NC_018294	GCG	2	6	1458	1463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
31	NC_018294	CAG	2	6	1603	1608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995011
32	NC_018294	GAT	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995011
33	NC_018294	GCG	2	6	1638	1643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
34	NC_018294	TGA	2	6	1656	1661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995011
35	NC_018294	CTG	2	6	1820	1825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018294	TCA	2	6	2039	2044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995012
37	NC_018294	GCC	3	9	2173	2181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018294	CGC	3	9	2214	2222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018294	GGC	2	6	2235	2240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018294	CCG	2	6	2321	2326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
41	NC_018294	CAT	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
42	NC_018294	GGC	2	6	2454	2459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
43	NC_018294	ATC	2	6	2605	2610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
44	NC_018294	TCC	2	6	2710	2715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995013
45	NC_018294	TCA	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
46	NC_018294	GCG	2	6	2760	2765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
47	NC_018294	GCA	2	6	2819	2824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
48	NC_018294	TCG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
49	NC_018294	TTG	2	6	2902	2907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
50	NC_018294	TTC	2	6	2920	2925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995013
51	NC_018294	TGA	2	6	2948	2953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995013
52	NC_018294	TGC	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
53	NC_018294	GTT	2	6	2979	2984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
54	NC_018294	CCA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995013
55	NC_018294	TCG	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
56	NC_018294	ACG	3	9	3241	3249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
57	NC_018294	GCG	2	6	3265	3270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
58	NC_018294	CCT	2	6	3281	3286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995013
59	NC_018294	CCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
60	NC_018294	CGC	2	6	3452	3457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
61	NC_018294	CGG	2	6	3494	3499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
62	NC_018294	CGA	2	6	3514	3519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
63	NC_018294	GCC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
64	NC_018294	CAG	2	6	3597	3602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
65	NC_018294	GTG	2	6	3622	3627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995013
66	NC_018294	CGG	2	6	3629	3634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
67	NC_018294	ATC	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
68	NC_018294	GCC	2	6	3694	3699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
69	NC_018294	CAG	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
70	NC_018294	GGT	2	6	3771	3776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995013
71	NC_018294	ACC	2	6	3832	3837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995013
72	NC_018294	TTG	2	6	3856	3861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
73	NC_018294	CAG	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
74	NC_018294	CTT	2	6	4012	4017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018294	CAG	2	6	4158	4163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018294	CGC	3	9	4183	4191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018294	GGC	2	6	4195	4200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018294	CGT	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995014
79	NC_018294	CGT	2	6	4295	4300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995014
80	NC_018294	CGC	2	6	4338	4343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995014
81	NC_018294	AGG	2	6	4358	4363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995014
82	NC_018294	GTC	2	6	4575	4580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
83	NC_018294	CTG	2	6	4607	4612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
84	NC_018294	TCA	2	6	4615	4620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995015
85	NC_018294	CTG	2	6	4629	4634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
86	NC_018294	TGC	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
87	NC_018294	TCG	2	6	4711	4716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
88	NC_018294	CGC	2	6	4826	4831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995015
89	NC_018294	TGA	2	6	4840	4845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995015
90	NC_018294	CTG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
91	NC_018294	GGC	2	6	4865	4870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995015
92	NC_018294	GAC	2	6	4892	4897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995015
93	NC_018294	CAA	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995015
94	NC_018294	TGA	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995015
95	NC_018294	CGG	3	9	4987	4995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995015
96	NC_018294	AAG	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995015
97	NC_018294	CTG	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
98	NC_018294	TCG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
99	NC_018294	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995016
100	NC_018294	GGC	2	6	5151	5156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
101	NC_018294	GGC	2	6	5188	5193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
102	NC_018294	CGG	2	6	5197	5202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
103	NC_018294	TCT	2	6	5260	5265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995016
104	NC_018294	GCA	3	9	5278	5286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995016
105	NC_018294	CGA	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995016
106	NC_018294	CCA	2	6	5386	5391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995016
107	NC_018294	TCG	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
108	NC_018294	CGT	2	6	5578	5583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
109	NC_018294	CTG	2	6	5732	5737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
110	NC_018294	GCC	2	6	5741	5746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995016
111	NC_018294	ATC	2	6	5794	5799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018294	GCT	2	6	5808	5813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018294	ACG	3	9	5879	5887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018294	GCC	2	6	6151	6156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995017
115	NC_018294	TGC	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995017
116	NC_018294	ATC	2	6	6306	6311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018294	GGC	2	6	6495	6500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018294	GAC	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995018
119	NC_018294	TCA	2	6	6619	6624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995018
120	NC_018294	CTT	2	6	6697	6702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995018
121	NC_018294	AAT	2	6	6852	6857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995018
122	NC_018294	CTT	2	6	6899	6904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995018
123	NC_018294	AGC	2	6	7099	7104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018294	CTG	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018294	GAG	2	6	7594	7599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018294	GCC	2	6	7622	7627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_018294	ATG	2	6	7707	7712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995020
128	NC_018294	GGC	2	6	7739	7744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995020
129	NC_018294	GGC	2	6	7912	7917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995020
130	NC_018294	GGT	2	6	7944	7949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995020
131	NC_018294	TTG	2	6	8008	8013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995020
132	NC_018294	CGC	2	6	8030	8035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995020
133	NC_018294	CGT	2	6	8084	8089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995020
134	NC_018294	TTC	2	6	8118	8123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995021
135	NC_018294	CCA	2	6	8150	8155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995021
136	NC_018294	TCA	2	6	8159	8164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995021
137	NC_018294	GCC	2	6	8431	8436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995021
138	NC_018294	GCC	2	6	8443	8448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995021
139	NC_018294	GAC	2	6	8550	8555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995021
140	NC_018294	CGT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995021
141	NC_018294	GAG	2	6	8580	8585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995021
142	NC_018294	GTC	2	6	8596	8601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995021
143	NC_018294	GCG	2	6	8730	8735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995021
144	NC_018294	GGC	2	6	8765	8770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995022
145	NC_018294	CGT	2	6	8904	8909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995022
146	NC_018294	ATT	2	6	8939	8944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995022
147	NC_018294	GGC	2	6	8993	8998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995022
148	NC_018294	GTG	2	6	9034	9039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995022
149	NC_018294	GCC	2	6	9081	9086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995022
150	NC_018294	CGG	2	6	9096	9101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995022
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152	NC_018294	CCA	2	6	9178	9183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995022
153	NC_018294	TCG	2	6	9189	9194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995022
154	NC_018294	GAT	2	6	9299	9304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995022
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156	NC_018294	GGC	2	6	9765	9770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995023
157	NC_018294	ACG	2	6	9818	9823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995023
158	NC_018294	GCT	2	6	9877	9882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995023
159	NC_018294	GAT	2	6	9941	9946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995023
160	NC_018294	CAA	2	6	9980	9985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995024
161	NC_018294	CGA	3	9	9997	10005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995024
162	NC_018294	GAT	2	6	10094	10099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995024
163	NC_018294	CCT	2	6	10321	10326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995024
164	NC_018294	CTT	2	6	10405	10410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995024
165	NC_018294	CAT	2	6	10546	10551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995025
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168	NC_018294	CAG	2	6	10777	10782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995025
169	NC_018294	CGT	2	6	10833	10838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_018294	GAG	2	6	10843	10848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_018294	CGA	2	6	10935	10940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995026
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178	NC_018294	CCG	2	6	11335	11340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
179	NC_018294	TTC	2	6	11351	11356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_018294	TCG	2	6	11372	11377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995027
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194	NC_018294	CCA	2	6	12031	12036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
195	NC_018294	GGC	2	6	12058	12063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
196	NC_018294	CAG	2	6	12091	12096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_018294	ACC	2	6	12131	12136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
198	NC_018294	CAC	2	6	12157	12162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
199	NC_018294	TCG	2	6	12360	12365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
200	NC_018294	GAC	2	6	12381	12386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
201	NC_018294	GAA	2	6	12391	12396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995028
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235	NC_018294	TGA	2	6	15305	15310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995032
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239	NC_018294	CGG	2	6	15518	15523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995032
240	NC_018294	TCG	2	6	15568	15573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995032
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245	NC_018294	CGA	2	6	15844	15849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995032
246	NC_018294	AGA	2	6	15864	15869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
247	NC_018294	CGG	2	6	15881	15886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_018294	GCA	3	9	16021	16029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995033
249	NC_018294	ACA	2	6	16128	16133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995033
250	NC_018294	GCC	2	6	16150	16155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995033
251	NC_018294	ACG	2	6	16239	16244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995033
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253	NC_018294	TGC	2	6	16259	16264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995033
254	NC_018294	TCG	2	6	16281	16286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995033
255	NC_018294	TAT	2	6	16357	16362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_018294	TGA	2	6	16363	16368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_018294	CAG	2	6	16533	16538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995034
258	NC_018294	CAG	2	6	16652	16657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995034
259	NC_018294	AGC	2	6	16715	16720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995034
260	NC_018294	TTA	2	6	16833	16838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995035
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380	NC_018294	TCC	2	6	25717	25722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
381	NC_018294	AGC	2	6	25883	25888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995048
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384	NC_018294	AAG	2	6	26058	26063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995048
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500	NC_018294	GCG	2	6	35297	35302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995056

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