MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018294	CG	3	6	2129	2134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018294	TC	3	6	3950	3955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018294	TG	3	6	5814	5819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018294	GC	3	6	6544	6549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018294	CT	3	6	7116	7121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018294	TC	3	6	12310	12315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018294	CG	3	6	13292	13297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018294	GC	3	6	23160	23165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018294	CG	3	6	24497	24502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018294	GT	3	6	30239	30244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018294	CG	3	6	30297	30302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018294	GC	3	6	32937	32942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018294	AG	3	6	37180	37185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018294	CG	4	8	38755	38762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018294	TG	3	6	38995	39000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018294	AT	3	6	48154	48159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018294	GC	3	6	51181	51186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018294	GA	3	6	51340	51345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018294	CG	3	6	52362	52367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018294	GC	3	6	52556	52561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018294	CG	3	6	53324	53329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018294	GA	3	6	56200	56205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018294	GA	3	6	56319	56324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018294	GC	3	6	56691	56696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018294	CG	3	6	61230	61235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018294	GC	3	6	71529	71534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018294	CG	3	6	71853	71858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018294	TC	3	6	82340	82345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018294	TA	3	6	83602	83607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018294	GC	3	6	83891	83896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018294	CG	3	6	88231	88236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018294	AC	3	6	88627	88632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018294	GT	3	6	88930	88935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018294	TG	3	6	89032	89037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018294	GT	3	6	89679	89684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018294	TG	3	6	90909	90914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018294	CG	3	6	94660	94665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018294	GT	3	6	95113	95118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018294	AG	3	6	97304	97309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018294	CT	3	6	97517	97522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018294	GA	4	8	97654	97661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018294	CT	3	6	99090	99095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018294	AT	3	6	105022	105027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018294	TA	3	6	105095	105100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018294	GC	3	6	105177	105182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018294	GC	3	6	105184	105189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018294	GC	3	6	112085	112090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018294	CT	3	6	116204	116209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018294	GC	3	6	116487	116492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018294	GC	3	6	117364	117369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018294	AG	3	6	117409	117414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018294	AG	3	6	117662	117667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018294	TG	3	6	121488	121493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018294	GC	3	6	123083	123088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018294	CG	3	6	124344	124349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018294	CG	3	6	126745	126750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018294	CG	3	6	126795	126800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018294	CA	3	6	129708	129713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018294	GC	3	6	129729	129734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018294	AT	3	6	130254	130259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018294	GA	3	6	134399	134404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018294	GC	3	6	134633	134638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018294	CT	3	6	134643	134648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018294	AC	3	6	139623	139628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018294	CA	3	6	140829	140834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018294	TC	3	6	142186	142191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018294	TC	3	6	142577	142582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018294	CA	3	6	144457	144462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018294	AG	3	6	145198	145203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018294	TC	3	6	145234	145239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018294	GC	3	6	148504	148509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018294	CG	3	6	148532	148537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018294	CT	3	6	148707	148712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018294	GC	3	6	149143	149148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018294	CT	3	6	150975	150980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018294	TC	3	6	151625	151630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018294	CG	3	6	152613	152618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018294	CG	3	6	168815	168820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018294	GT	3	6	168861	168866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018294	AC	3	6	170688	170693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018294	AG	3	6	174618	174623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018294	GC	3	6	176569	176574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018294	CG	4	8	178481	178488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018294	GC	3	6	179476	179481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018294	CA	3	6	179688	179693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018294	CG	3	6	180860	180865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018294	CG	3	6	181263	181268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018294	GC	3	6	187527	187532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018294	CG	3	6	187610	187615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018294	CG	3	6	188137	188142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018294	AG	3	6	190628	190633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018294	AG	3	6	191270	191275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018294	CG	3	6	193862	193867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018294	GC	3	6	194222	194227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018294	GT	3	6	194475	194480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018294	AG	3	6	194633	194638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018294	TC	3	6	195689	195694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018294	AG	3	6	200140	200145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018294	CG	3	6	200319	200324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018294	CG	3	6	200344	200349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018294	GC	3	6	200742	200747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018294	CT	3	6	200752	200757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018294	GC	3	6	207609	207614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018294	GC	4	8	207626	207633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018294	GC	3	6	208256	208261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018294	GC	4	8	208273	208280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018294	CT	3	6	215628	215633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018294	GC	3	6	217448	217453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018294	CT	4	8	218901	218908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018294	GC	3	6	219497	219502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018294	AT	3	6	219728	219733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018294	CT	3	6	227861	227866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018294	TG	3	6	227923	227928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018294	CT	3	6	228845	228850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018294	GC	3	6	238407	238412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018294	GC	3	6	238507	238512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018294	CG	4	8	238773	238780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018294	GC	3	6	238914	238919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018294	GC	3	6	238998	239003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018294	GC	3	6	239032	239037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018294	GC	3	6	239317	239322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018294	GC	3	6	241015	241020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018294	GC	3	6	243444	243449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018294	AG	3	6	245069	245074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018294	CG	3	6	245128	245133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018294	GC	3	6	248208	248213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018294	GC	3	6	248258	248263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018294	GC	3	6	248623	248628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018294	CG	3	6	248806	248811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018294	CG	3	6	251411	251416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018294	AT	3	6	252045	252050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018294	AG	3	6	252166	252171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018294	AG	3	6	252214	252219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018294	CA	3	6	255108	255113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018294	TC	3	6	255456	255461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018294	AC	3	6	260195	260200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018294	CG	3	6	265622	265627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018294	GC	3	6	265746	265751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018294	CT	3	6	265966	265971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018294	AT	3	6	266550	266555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018294	CT	3	6	266605	266610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018294	GC	3	6	268468	268473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018294	CG	3	6	268792	268797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018294	CG	3	6	273304	273309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.