MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018293	GGC	2	6	665	670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399994763
2	NC_018293	ACG	2	6	734	739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399994763
3	NC_018293	GCC	3	9	841	849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399994763
4	NC_018293	AGG	2	6	959	964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399994763
5	NC_018293	CAT	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399994763
6	NC_018293	GTC	2	6	1077	1082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399994763
7	NC_018293	CGG	2	6	1101	1106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399994763
8	NC_018293	TTC	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399994763
9	NC_018293	AAG	2	6	1345	1350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399994763
10	NC_018293	ATC	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399994764
11	NC_018293	GCG	2	6	1789	1794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399994765
12	NC_018293	CGA	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399994765
13	NC_018293	GCC	3	9	2058	2066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399994765
14	NC_018293	ATC	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399994765
15	NC_018293	GCC	2	6	2139	2144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399994765
16	NC_018293	TCA	2	6	2209	2214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399994765
17	NC_018293	TCA	2	6	2404	2409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399994766
18	NC_018293	CGG	2	6	2457	2462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399994766
19	NC_018293	GAT	2	6	2478	2483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399994766
20	NC_018293	TTG	2	6	2845	2850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399994766
21	NC_018293	TCT	2	6	2994	2999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399994766
22	NC_018293	GTC	2	6	3115	3120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399994766
23	NC_018293	CCT	2	6	3248	3253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399994766
24	NC_018293	AGA	2	6	3331	3336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399994766
25	NC_018293	GAT	2	6	3399	3404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399994766
26	NC_018293	GGA	2	6	3417	3422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399994766
27	NC_018293	CTC	2	6	3492	3497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399994766
28	NC_018293	TCG	2	6	3511	3516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399994766
29	NC_018293	CAA	2	6	3654	3659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399994766
30	NC_018293	GAT	2	6	3729	3734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399994766
31	NC_018293	CTC	3	9	3735	3743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399994766
32	NC_018293	ACG	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399994766
33	NC_018293	CGT	2	6	3992	3997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399994766
34	NC_018293	GAC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399994766
35	NC_018293	CGG	2	6	4161	4166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399994766
36	NC_018293	CAT	2	6	4463	4468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399994767
37	NC_018293	TTC	2	6	4495	4500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399994767
38	NC_018293	CGG	2	6	4546	4551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399994767
39	NC_018293	GCG	2	6	4702	4707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399994767
40	NC_018293	TGA	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399994768
41	NC_018293	CGA	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399994768
42	NC_018293	CGT	2	6	4860	4865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399994768
43	NC_018293	AGC	2	6	5069	5074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399994768
44	NC_018293	GAT	2	6	5194	5199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399994768
45	NC_018293	AGC	2	6	5534	5539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399994768
46	NC_018293	GAT	2	6	5680	5685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399994768

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.