MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus phage YMC-2011

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018285	ATTCT	2	10	709	718	20 %	60 %	0 %	20 %	399498679
2	NC_018285	TCTAT	2	10	3846	3855	20 %	60 %	0 %	20 %	399498680
3	NC_018285	CTATC	2	10	4404	4413	20 %	40 %	0 %	40 %	399498680
4	NC_018285	CAAAA	2	10	5635	5644	80 %	0 %	0 %	20 %	399498683
5	NC_018285	CTGGT	2	10	6147	6156	0 %	40 %	40 %	20 %	399498684
6	NC_018285	CTGGT	2	10	6520	6529	0 %	40 %	40 %	20 %	399498684
7	NC_018285	CTTTT	2	10	8564	8573	0 %	80 %	0 %	20 %	399498686
8	NC_018285	TGTTT	2	10	9097	9106	0 %	80 %	20 %	0 %	399498687
9	NC_018285	GATTT	2	10	11134	11143	20 %	60 %	20 %	0 %	399498692
10	NC_018285	CATTT	2	10	11481	11490	20 %	60 %	0 %	20 %	399498693
11	NC_018285	TAACA	2	10	14409	14418	60 %	20 %	0 %	20 %	399498697
12	NC_018285	ATCTA	2	10	15216	15225	40 %	40 %	0 %	20 %	399498699
13	NC_018285	TGCCA	2	10	15396	15405	20 %	20 %	20 %	40 %	399498699
14	NC_018285	GGAAT	2	10	16787	16796	40 %	20 %	40 %	0 %	399498700
15	NC_018285	CAACC	2	10	18412	18421	40 %	0 %	0 %	60 %	399498703
16	NC_018285	CAGTG	2	10	22268	22277	20 %	20 %	40 %	20 %	399498711
17	NC_018285	TTTAG	2	10	24979	24988	20 %	60 %	20 %	0 %	399498715
18	NC_018285	GATAT	2	10	25390	25399	40 %	40 %	20 %	0 %	399498716
19	NC_018285	CAAAG	2	10	25563	25572	60 %	0 %	20 %	20 %	399498716
20	NC_018285	TGATG	2	10	26424	26433	20 %	40 %	40 %	0 %	399498718
21	NC_018285	ATTTA	2	10	28399	28408	40 %	60 %	0 %	0 %	399498721
22	NC_018285	ATGAA	2	10	29935	29944	60 %	20 %	20 %	0 %	399498722

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.