MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus phage YMC-2011

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018285	CTAT	2	8	749	756	25 %	50 %	0 %	25 %	399498679
2	NC_018285	CAAC	2	8	1328	1335	50 %	0 %	0 %	50 %	399498679
3	NC_018285	GACG	2	8	1754	1761	25 %	0 %	50 %	25 %	399498679
4	NC_018285	TTGA	2	8	3097	3104	25 %	50 %	25 %	0 %	399498680
5	NC_018285	GTGC	2	8	3154	3161	0 %	25 %	50 %	25 %	399498680
6	NC_018285	CCGA	2	8	4177	4184	25 %	0 %	25 %	50 %	399498680
7	NC_018285	GATT	2	8	4262	4269	25 %	50 %	25 %	0 %	399498680
8	NC_018285	ACCA	2	8	4564	4571	50 %	0 %	0 %	50 %	399498680
9	NC_018285	AAAG	2	8	4911	4918	75 %	0 %	25 %	0 %	399498680
10	NC_018285	GCAA	2	8	5094	5101	50 %	0 %	25 %	25 %	399498681
11	NC_018285	GGTT	2	8	6278	6285	0 %	50 %	50 %	0 %	399498684
12	NC_018285	TAGC	2	8	7749	7756	25 %	25 %	25 %	25 %	399498686
13	NC_018285	TGCT	2	8	8100	8107	0 %	50 %	25 %	25 %	399498686
14	NC_018285	TTCC	2	8	9114	9121	0 %	50 %	0 %	50 %	399498687
15	NC_018285	GTAA	2	8	9291	9298	50 %	25 %	25 %	0 %	399498688
16	NC_018285	TGAC	2	8	10898	10905	25 %	25 %	25 %	25 %	399498692
17	NC_018285	GACA	2	8	10953	10960	50 %	0 %	25 %	25 %	399498692
18	NC_018285	ACTT	2	8	10978	10985	25 %	50 %	0 %	25 %	399498692
19	NC_018285	TTGA	2	8	11092	11099	25 %	50 %	25 %	0 %	399498692
20	NC_018285	AACG	2	8	12085	12092	50 %	0 %	25 %	25 %	399498695
21	NC_018285	GAAA	2	8	14093	14100	75 %	0 %	25 %	0 %	399498697
22	NC_018285	GGAC	2	8	15365	15372	25 %	0 %	50 %	25 %	399498699
23	NC_018285	TCAA	2	8	16088	16095	50 %	25 %	0 %	25 %	399498700
24	NC_018285	CAAT	2	8	16141	16148	50 %	25 %	0 %	25 %	399498700
25	NC_018285	GCAA	2	8	16224	16231	50 %	0 %	25 %	25 %	399498700
26	NC_018285	CAAA	2	8	16957	16964	75 %	0 %	0 %	25 %	399498700
27	NC_018285	CTAG	2	8	18096	18103	25 %	25 %	25 %	25 %	399498702
28	NC_018285	AAGA	2	8	18763	18770	75 %	0 %	25 %	0 %	399498703
29	NC_018285	TCAA	2	8	19073	19080	50 %	25 %	0 %	25 %	399498703
30	NC_018285	AACG	2	8	19299	19306	50 %	0 %	25 %	25 %	399498703
31	NC_018285	CCAG	2	8	20502	20509	25 %	0 %	25 %	50 %	399498705
32	NC_018285	GGAT	2	8	20652	20659	25 %	25 %	50 %	0 %	399498706
33	NC_018285	AAAG	2	8	20754	20761	75 %	0 %	25 %	0 %	399498706
34	NC_018285	GAAA	2	8	20828	20835	75 %	0 %	25 %	0 %	399498707
35	NC_018285	GATT	2	8	20957	20964	25 %	50 %	25 %	0 %	399498707
36	NC_018285	GACT	2	8	21925	21932	25 %	25 %	25 %	25 %	399498710
37	NC_018285	AGCA	2	8	22221	22228	50 %	0 %	25 %	25 %	399498711
38	NC_018285	AAGA	2	8	22577	22584	75 %	0 %	25 %	0 %	399498711
39	NC_018285	CTAT	2	8	23959	23966	25 %	50 %	0 %	25 %	399498713
40	NC_018285	ACTA	2	8	24583	24590	50 %	25 %	0 %	25 %	399498714
41	NC_018285	ATTT	2	8	24892	24899	25 %	75 %	0 %	0 %	399498715
42	NC_018285	TAAA	2	8	25573	25580	75 %	25 %	0 %	0 %	399498716
43	NC_018285	TTGA	2	8	26098	26105	25 %	50 %	25 %	0 %	399498717
44	NC_018285	CGAC	2	8	26124	26131	25 %	0 %	25 %	50 %	399498717
45	NC_018285	CTTG	2	8	26467	26474	0 %	50 %	25 %	25 %	399498718
46	NC_018285	TGGC	2	8	26646	26653	0 %	25 %	50 %	25 %	399498718
47	NC_018285	TCAA	2	8	26800	26807	50 %	25 %	0 %	25 %	399498718
48	NC_018285	TATC	2	8	26906	26913	25 %	50 %	0 %	25 %	399498718
49	NC_018285	CCAC	2	8	27692	27699	25 %	0 %	0 %	75 %	399498719
50	NC_018285	TTAT	2	8	27903	27910	25 %	75 %	0 %	0 %	399498719
51	NC_018285	AGTG	2	8	28487	28494	25 %	25 %	50 %	0 %	399498721
52	NC_018285	AAGC	2	8	29156	29163	50 %	0 %	25 %	25 %	399498721
53	NC_018285	TGGC	2	8	29794	29801	0 %	25 %	50 %	25 %	399498722
54	NC_018285	ATCA	2	8	29887	29894	50 %	25 %	0 %	25 %	399498722
55	NC_018285	AACG	2	8	30341	30348	50 %	0 %	25 %	25 %	399498723
56	NC_018285	CTTG	2	8	30523	30530	0 %	50 %	25 %	25 %	399498723
57	NC_018285	TAAC	2	8	30810	30817	50 %	25 %	0 %	25 %	399498723
58	NC_018285	GCTT	2	8	30819	30826	0 %	50 %	25 %	25 %	399498723
59	NC_018285	CAAA	2	8	30997	31004	75 %	0 %	0 %	25 %	399498723
60	NC_018285	TCAA	2	8	31880	31887	50 %	25 %	0 %	25 %	399498725
61	NC_018285	AAGA	2	8	32244	32251	75 %	0 %	25 %	0 %	399498726
62	NC_018285	AGAA	2	8	32310	32317	75 %	0 %	25 %	0 %	399498726
63	NC_018285	AAAG	2	8	32444	32451	75 %	0 %	25 %	0 %	399498726
64	NC_018285	ATCC	2	8	32651	32658	25 %	25 %	0 %	50 %	399498727
65	NC_018285	CAAA	2	8	33165	33172	75 %	0 %	0 %	25 %	399498728
66	NC_018285	TTGA	2	8	33244	33251	25 %	50 %	25 %	0 %	399498728
67	NC_018285	AGCA	2	8	33738	33745	50 %	0 %	25 %	25 %	399498729
68	NC_018285	CAAG	2	8	33746	33753	50 %	0 %	25 %	25 %	399498729
69	NC_018285	GCAA	2	8	34765	34772	50 %	0 %	25 %	25 %	399498731
70	NC_018285	CTCA	2	8	34868	34875	25 %	25 %	0 %	50 %	399498731
71	NC_018285	ACCA	2	8	35145	35152	50 %	0 %	0 %	50 %	399498731
72	NC_018285	CGGT	2	8	36094	36101	0 %	25 %	50 %	25 %	399498731
73	NC_018285	TTTG	2	8	36104	36111	0 %	75 %	25 %	0 %	399498731
74	NC_018285	TATT	2	8	36445	36452	25 %	75 %	0 %	0 %	399498731
75	NC_018285	CCTT	2	8	38231	38238	0 %	50 %	0 %	50 %	399498732
76	NC_018285	TGCT	2	8	38675	38682	0 %	50 %	25 %	25 %	399498732
77	NC_018285	AGTA	2	8	39569	39576	50 %	25 %	25 %	0 %	399498733
78	NC_018285	CTAT	2	8	40024	40031	25 %	50 %	0 %	25 %	399498733
79	NC_018285	GCAA	2	8	40185	40192	50 %	0 %	25 %	25 %	399498733
80	NC_018285	TAGA	2	8	40216	40223	50 %	25 %	25 %	0 %	399498733
81	NC_018285	TTAT	2	8	40580	40587	25 %	75 %	0 %	0 %	399498733

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.