MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus phage YMC-2011

Total Repeats: 410

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018285	ACG	2	6	102	107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399498679
2	NC_018285	ATG	2	6	123	128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399498679
3	NC_018285	TAC	2	6	146	151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498679
4	NC_018285	TTG	2	6	186	191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399498679
5	NC_018285	GAT	2	6	197	202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399498679
6	NC_018285	AAC	2	6	221	226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498679
7	NC_018285	AAG	2	6	370	375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498679
8	NC_018285	GAA	2	6	487	492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498679
9	NC_018285	CAA	2	6	512	517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498679
10	NC_018285	ATC	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498679
11	NC_018285	GAG	2	6	552	557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399498679
12	NC_018285	TGT	2	6	559	564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399498679
13	NC_018285	CTA	2	6	568	573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498679
14	NC_018285	AAC	3	9	974	982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498679
15	NC_018285	AAT	2	6	1049	1054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399498679
16	NC_018285	ACA	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498679
17	NC_018285	CAA	2	6	1109	1114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498679
18	NC_018285	TGA	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399498679
19	NC_018285	ATA	2	6	1362	1367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399498679
20	NC_018285	AAG	2	6	1368	1373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498679
21	NC_018285	CAG	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399498679
22	NC_018285	CTG	2	6	1914	1919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399498679
23	NC_018285	GGT	2	6	1934	1939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399498679
24	NC_018285	ATC	2	6	2235	2240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498679
25	NC_018285	CAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498679
26	NC_018285	TCA	2	6	2627	2632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498679
27	NC_018285	TGT	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399498679
28	NC_018285	TCT	2	6	2769	2774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399498679
29	NC_018285	TCA	2	6	2817	2822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498679
30	NC_018285	AAT	2	6	2884	2889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399498680
31	NC_018285	ACT	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498680
32	NC_018285	CAA	2	6	3434	3439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498680
33	NC_018285	CAA	2	6	3500	3505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498680
34	NC_018285	GTT	2	6	3520	3525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399498680
35	NC_018285	ACA	2	6	3530	3535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498680
36	NC_018285	TAC	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498680
37	NC_018285	ACA	3	9	3988	3996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498680
38	NC_018285	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399498680
39	NC_018285	AGA	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498680
40	NC_018285	CAA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498680
41	NC_018285	CAC	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399498680
42	NC_018285	GTG	2	6	4316	4321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399498680
43	NC_018285	AAT	2	6	4326	4331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399498680
44	NC_018285	AAC	2	6	4339	4344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498680
45	NC_018285	CTT	2	6	4374	4379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399498680
46	NC_018285	GAT	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399498680
47	NC_018285	GAA	2	6	4398	4403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498680
48	NC_018285	TCA	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498680
49	NC_018285	ACA	2	6	4489	4494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498680
50	NC_018285	TGT	2	6	4575	4580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399498680
51	NC_018285	GTC	2	6	4675	4680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399498680
52	NC_018285	CAA	2	6	4755	4760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498680
53	NC_018285	GAA	2	6	4903	4908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498680
54	NC_018285	AAC	2	6	4950	4955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498681
55	NC_018285	CGT	2	6	4978	4983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399498681
56	NC_018285	AGA	2	6	4984	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498681
57	NC_018285	CGA	2	6	5258	5263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399498682
58	NC_018285	GCT	2	6	5334	5339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399498682
59	NC_018285	AGA	2	6	5588	5593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498682
60	NC_018285	ACA	2	6	5685	5690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498683
61	NC_018285	AGG	2	6	5840	5845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399498683
62	NC_018285	CTA	2	6	5847	5852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498683
63	NC_018285	CAT	2	6	5872	5877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498684
64	NC_018285	CTT	2	6	5977	5982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399498684
65	NC_018285	GTC	2	6	6078	6083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399498684
66	NC_018285	CGT	2	6	6086	6091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399498684
67	NC_018285	TAC	2	6	6112	6117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498684
68	NC_018285	TGG	2	6	6232	6237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399498684
69	NC_018285	ATG	2	6	6471	6476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399498684
70	NC_018285	TCG	2	6	6532	6537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399498684
71	NC_018285	TTG	2	6	7041	7046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399498685
72	NC_018285	TAC	2	6	7061	7066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498685
73	NC_018285	GAA	3	9	7073	7081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498685
74	NC_018285	GAA	2	6	7088	7093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498685
75	NC_018285	GAA	2	6	7166	7171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498685
76	NC_018285	GAT	2	6	7188	7193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399498685
77	NC_018285	TCG	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399498686
78	NC_018285	TGG	2	6	7659	7664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399498686
79	NC_018285	TTG	2	6	7827	7832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399498686
80	NC_018285	GTA	2	6	7843	7848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399498686
81	NC_018285	CAT	2	6	7855	7860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498686
82	NC_018285	GGT	2	6	7866	7871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399498686
83	NC_018285	ATC	2	6	8012	8017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498686
84	NC_018285	GCA	2	6	8076	8081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399498686
85	NC_018285	AAG	2	6	8083	8088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498686
86	NC_018285	AAT	2	6	8367	8372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399498686
87	NC_018285	CAC	2	6	8445	8450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399498686
88	NC_018285	TCA	2	6	8481	8486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498686
89	NC_018285	GCT	2	6	8526	8531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399498686
90	NC_018285	ACC	2	6	8558	8563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399498686
91	NC_018285	ATG	2	6	8641	8646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399498686
92	NC_018285	TTG	2	6	8766	8771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399498687
93	NC_018285	TTG	2	6	8814	8819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399498687
94	NC_018285	CCA	2	6	8863	8868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399498687
95	NC_018285	GTT	2	6	8990	8995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399498687
96	NC_018285	GAA	3	9	9037	9045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498687
97	NC_018285	AAT	2	6	9162	9167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399498687
98	NC_018285	TCA	2	6	9216	9221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498688
99	NC_018285	TCA	2	6	9251	9256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498688
100	NC_018285	GTG	2	6	9263	9268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399498688
101	NC_018285	ATC	2	6	9304	9309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498688
102	NC_018285	CAA	2	6	9325	9330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498688
103	NC_018285	TCA	2	6	9638	9643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498689
104	NC_018285	CAT	2	6	9667	9672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498689
105	NC_018285	GAT	2	6	9682	9687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399498689
106	NC_018285	GTT	3	9	9711	9719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399498689
107	NC_018285	AGT	2	6	9835	9840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399498689
108	NC_018285	GAA	2	6	10091	10096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498690
109	NC_018285	TAG	2	6	10122	10127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399498690
110	NC_018285	GTA	2	6	10167	10172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399498690
111	NC_018285	CAA	2	6	10512	10517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498691
112	NC_018285	CAA	2	6	10545	10550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498691
113	NC_018285	ATC	2	6	10621	10626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498691
114	NC_018285	TCA	2	6	10910	10915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498692
115	NC_018285	GAA	2	6	11104	11109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498692
116	NC_018285	ACA	2	6	11353	11358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498692
117	NC_018285	GAC	2	6	11375	11380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399498692
118	NC_018285	GAA	2	6	11502	11507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498693
119	NC_018285	ACA	2	6	12033	12038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498695
120	NC_018285	CTT	2	6	12051	12056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399498695
121	NC_018285	ACA	2	6	12478	12483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498696
122	NC_018285	AGT	2	6	12489	12494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399498696
123	NC_018285	CAA	3	9	12638	12646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498696
124	NC_018285	CAG	2	6	12677	12682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399498696
125	NC_018285	CTA	2	6	12686	12691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399498696
126	NC_018285	AGT	2	6	12840	12845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399498696
127	NC_018285	ACA	2	6	12899	12904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399498696
128	NC_018285	TAA	2	6	12966	12971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399498696
129	NC_018285	TAA	2	6	12993	12998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399498696
130	NC_018285	GAA	2	6	13102	13107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498696
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379	NC_018285	GAA	2	6	37795	37800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498732
380	NC_018285	TGG	2	6	37810	37815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399498732
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382	NC_018285	TGG	2	6	38094	38099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399498732
383	NC_018285	GAA	2	6	38161	38166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399498732
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.