MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Melissococcus plutonius DAT561 plasmid 1

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018265	ATATAA	2	12	490	501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018265	AAGGGC	2	12	8866	8877	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018265	TATAGG	2	12	9437	9448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018265	TTTTTG	2	12	18726	18737	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018265	TTTTAA	2	12	20220	20231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018265	TATTTT	2	12	22136	22147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018265	TTTATC	2	12	23736	23747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018265	AAATTT	2	12	35720	35731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018265	TTTATT	2	12	37076	37087	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018265	TAATTG	2	12	44179	44190	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018265	AAAATT	2	12	45688	45699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018265	ATATTG	2	12	54244	54255	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018265	ATAAAT	2	12	66191	66202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018265	TAAAAA	2	12	75168	75179	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018265	GTTAAA	2	12	78337	78348	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018265	TATTTT	2	12	101647	101658	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018265	AATTTT	2	12	115632	115643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018265	GTTAAC	2	12	115852	115863	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018265	AATTTA	2	12	115864	115875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018265	AATAAA	2	12	119243	119254	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018265	TAAAAA	2	12	119279	119290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018265	ATATTT	2	12	119415	119426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018265	TTATAT	2	12	124277	124288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018265	TATAAA	2	12	130090	130101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018265	ATTAAA	2	12	134011	134022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018265	TAATAT	2	12	135796	135807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018265	TTTTAA	2	12	138124	138135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018265	AAATAA	2	12	147004	147015	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018265	ATATAA	2	12	147859	147870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018265	TAATAT	2	12	147895	147906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018265	ATTAAA	2	12	173731	173742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018265	TAATTA	2	12	178103	178114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018265	TAAGTA	2	12	197105	197116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.