MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Melissococcus plutonius DAT561 plasmid 1

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018265	AAAAGA	2	12	5076	5087	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	399140229
2	NC_018265	AAGAAA	2	12	16612	16623	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	399140244
3	NC_018265	ATATAG	2	12	16912	16923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	399140244
4	NC_018265	TTTATT	2	12	25166	25177	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	399140249
5	NC_018265	TTTTAG	2	12	25903	25914	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	399140250
6	NC_018265	TTATAT	2	12	28357	28368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399140252
7	NC_018265	AATTGA	2	12	28537	28548	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	399140252
8	NC_018265	AAATTT	2	12	30835	30846	50 %	50 %	0 %	0 %	399140254
9	NC_018265	TTTTTG	2	12	30978	30989	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	399140254
10	NC_018265	TAAAAC	2	12	31602	31613	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	399140255
11	NC_018265	TTTTTG	2	12	33524	33535	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	399140257
12	NC_018265	TTTTAG	2	12	40047	40058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	399140260
13	NC_018265	TACAAT	2	12	41152	41163	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	399140262
14	NC_018265	ACGAAA	2	12	41966	41977	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	399140263
15	NC_018265	CTCCTT	2	12	42511	42522	0 %	50 %	0 %	50 %	399140264
16	NC_018265	AGGACT	2	12	43419	43430	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399140264
17	NC_018265	TTATGC	2	12	47385	47396	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	399140267
18	NC_018265	ACCAAG	2	12	52475	52486	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	399140272
19	NC_018265	TGATTT	2	12	57979	57990	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	399140275
20	NC_018265	CTAATG	2	12	64940	64951	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	399140280
21	NC_018265	TATCAA	2	12	65612	65623	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	399140280
22	NC_018265	TGAAAA	2	12	66574	66585	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	399140281
23	NC_018265	TGATTT	2	12	66709	66720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	399140281
24	NC_018265	ATTTGA	2	12	70744	70755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	399140285
25	NC_018265	GGAAAA	2	12	72707	72718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399140287
26	NC_018265	AATTTT	2	12	75708	75719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399140289
27	NC_018265	CTTTTT	2	12	78752	78763	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	399140291
28	NC_018265	ACAAAT	2	12	87886	87897	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	399140295
29	NC_018265	TAAATG	2	12	88116	88127	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	399140295
30	NC_018265	GATTGG	2	12	89216	89227	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	399140296
31	NC_018265	AAAAAT	2	12	91815	91826	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	399140299
32	NC_018265	AAAATA	2	12	92615	92626	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	399140300
33	NC_018265	GTAAAA	2	12	93544	93555	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	399140300
34	NC_018265	GAAAAA	2	12	94010	94021	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	399140300
35	NC_018265	TCAAAA	2	12	95126	95137	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	399140301
36	NC_018265	ATTAGG	2	12	95398	95409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399140302
37	NC_018265	TTCTAT	2	12	95533	95544	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	399140302
38	NC_018265	GTCCAA	2	12	97245	97256	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	399140303
39	NC_018265	AATTAC	2	12	98759	98770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	399140304
40	NC_018265	ATTTTT	2	12	104967	104978	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	399140308
41	NC_018265	ATTTTT	2	12	106658	106669	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	399140309
42	NC_018265	TCATTT	2	12	108526	108537	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	399140312
43	NC_018265	ATTTAT	2	12	111224	111235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399140314
44	NC_018265	GATTAT	2	12	113833	113844	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	399140315
45	NC_018265	GAAATA	2	12	117015	117026	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	399140316
46	NC_018265	ATATTT	2	12	118492	118503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399140317
47	NC_018265	CAATTG	2	12	123101	123112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	399140321
48	NC_018265	ATCAGG	2	12	125573	125584	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399140323
49	NC_018265	AGATCC	2	12	125621	125632	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	399140323
50	NC_018265	GGAGCA	2	12	125973	125984	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	399140323
51	NC_018265	TTTAAT	2	12	128116	128127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399140325
52	NC_018265	ATATTA	2	12	128675	128686	50 %	50 %	0 %	0 %	399140325
53	NC_018265	ACAGAA	2	12	130773	130784	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	399140327
54	NC_018265	CATCTT	2	12	135071	135082	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	399140331
55	NC_018265	AAGATG	2	12	137065	137076	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	399140332
56	NC_018265	ACTGTT	2	12	141292	141303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	399140336
57	NC_018265	TTTCTG	2	12	141362	141373	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	399140336
58	NC_018265	TGATAA	2	12	142645	142656	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	399140338
59	NC_018265	ATTAAT	2	12	143459	143470	50 %	50 %	0 %	0 %	399140338
60	NC_018265	ATTAAA	2	12	144020	144031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399140338
61	NC_018265	ATCTTT	2	12	144991	145002	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	399140339
62	NC_018265	ATAAAA	2	12	145076	145087	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	399140339
63	NC_018265	TTTTCT	2	12	146128	146139	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	399140340
64	NC_018265	TGCTCC	2	12	146163	146174	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	399140340
65	NC_018265	TGGATC	2	12	146514	146525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	399140340
66	NC_018265	CCTGAT	2	12	146563	146574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399140340
67	NC_018265	GCAATT	2	12	149034	149045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	399140342
68	NC_018265	AATTTA	2	12	156246	156257	50 %	50 %	0 %	0 %	399140349
69	NC_018265	CACAAT	2	12	157803	157814	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	399140350
70	NC_018265	AAATAA	2	12	158304	158315	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	399140350
71	NC_018265	GTAAAG	2	12	159079	159090	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	399140350
72	NC_018265	ACATTG	2	12	167724	167735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	399140357
73	NC_018265	TTGCAT	2	12	168334	168345	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	399140357
74	NC_018265	CTTTTG	2	12	168992	169003	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	399140358
75	NC_018265	CTGTTT	2	12	169472	169483	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	399140358
76	NC_018265	AATACA	2	12	170545	170556	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	399140360
77	NC_018265	CTACAC	2	12	171439	171450	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	399140361
78	NC_018265	ATAAAA	2	12	172030	172041	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	399140361
79	NC_018265	TTTTTG	2	12	177643	177654	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	399140366
80	NC_018265	AAAGAC	2	12	178312	178323	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	399140367
81	NC_018265	AAACTA	2	12	179958	179969	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	399140368
82	NC_018265	ATTAAA	2	12	180705	180716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399140369
83	NC_018265	ACATAA	2	12	187963	187974	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	399140376
84	NC_018265	TATTGA	2	12	188689	188700	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	399140376
85	NC_018265	TCATTA	2	12	189130	189141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	399140376
86	NC_018265	AATACT	2	12	193632	193643	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	399140379
87	NC_018265	TAATTT	2	12	196255	196266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399140380
88	NC_018265	AACCAA	2	12	196316	196327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399140380
89	NC_018265	GCTTCA	2	12	198166	198177	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399140381

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.