MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Melissococcus plutonius DAT561 plasmid 1

Total Repeats: 231

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018265	TAAAA	2	10	408	417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018265	TTTAA	2	10	2018	2027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018265	TTAAA	2	10	2043	2052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018265	ATTTT	2	10	2515	2524	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018265	TATAA	2	10	3008	3017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018265	AAAGA	2	10	3578	3587	80 %	0 %	20 %	0 %	399140228
7	NC_018265	AAAAG	2	10	3643	3652	80 %	0 %	20 %	0 %	399140228
8	NC_018265	GAAAA	2	10	4456	4465	80 %	0 %	20 %	0 %	399140229
9	NC_018265	CATTA	2	10	4944	4953	40 %	40 %	0 %	20 %	399140229
10	NC_018265	CTTTT	2	10	5673	5682	0 %	80 %	0 %	20 %	399140230
11	NC_018265	CTTTT	2	10	6085	6094	0 %	80 %	0 %	20 %	399140230
12	NC_018265	CATCT	2	10	6299	6308	20 %	40 %	0 %	40 %	399140231
13	NC_018265	TTGGA	2	10	7711	7720	20 %	40 %	40 %	0 %	399140233
14	NC_018265	TTTTA	2	10	8414	8423	20 %	80 %	0 %	0 %	399140234
15	NC_018265	AATTA	2	10	9097	9106	60 %	40 %	0 %	0 %	399140236
16	NC_018265	CTATA	2	10	9419	9428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018265	CTTAA	2	10	9538	9547	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018265	TGGTA	2	10	10687	10696	20 %	40 %	40 %	0 %	399140238
19	NC_018265	ATAAA	2	10	13385	13394	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018265	AAAAG	2	10	13550	13559	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018265	TTTAT	2	10	13641	13650	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018265	TATAA	2	10	14816	14825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018265	AATTT	2	10	15134	15143	40 %	60 %	0 %	0 %	399140243
24	NC_018265	ACTTC	2	10	15533	15542	20 %	40 %	0 %	40 %	399140243
25	NC_018265	TCTAT	2	10	15927	15936	20 %	60 %	0 %	20 %	399140244
26	NC_018265	ATTTA	2	10	16373	16382	40 %	60 %	0 %	0 %	399140244
27	NC_018265	ATTAA	2	10	16872	16881	60 %	40 %	0 %	0 %	399140244
28	NC_018265	CAATC	2	10	17473	17482	40 %	20 %	0 %	40 %	399140245
29	NC_018265	TATAG	2	10	17670	17679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018265	TGAAT	2	10	18151	18160	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018265	ACTTC	2	10	19362	19371	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_018265	TTGGT	2	10	19459	19468	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018265	TAATT	2	10	19865	19874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018265	TTACT	2	10	20276	20285	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018265	AAAAC	2	10	21967	21976	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018265	CAAGC	2	10	22016	22025	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_018265	TAATA	2	10	22650	22659	60 %	40 %	0 %	0 %	399140248
38	NC_018265	GTATA	2	10	23501	23510	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018265	AAATG	2	10	23766	23775	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018265	TACTA	2	10	23922	23931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018265	ACTTA	2	10	23945	23954	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018265	TGTTT	2	10	23977	23986	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018265	TTTTA	2	10	23987	23996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018265	AAGTT	2	10	24005	24014	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018265	AAACA	2	10	25054	25063	80 %	0 %	0 %	20 %	399140249
46	NC_018265	TTATG	2	10	25520	25529	20 %	60 %	20 %	0 %	399140249
47	NC_018265	AAATT	2	10	26477	26486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018265	TTGGT	2	10	28998	29007	0 %	60 %	40 %	0 %	399140253
49	NC_018265	TAGCA	2	10	29166	29175	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018265	ATTTT	2	10	29880	29889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018265	TTAAT	2	10	30565	30574	40 %	60 %	0 %	0 %	399140254
52	NC_018265	TATAT	2	10	31319	31328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018265	ATTTA	2	10	31377	31386	40 %	60 %	0 %	0 %	399140255
54	NC_018265	CTAAA	2	10	31481	31490	60 %	20 %	0 %	20 %	399140255
55	NC_018265	TAAAA	2	10	31917	31926	80 %	20 %	0 %	0 %	399140255
56	NC_018265	AAATA	2	10	32452	32461	80 %	20 %	0 %	0 %	399140256
57	NC_018265	CAAAT	2	10	33485	33494	60 %	20 %	0 %	20 %	399140257
58	NC_018265	CAAAT	2	10	33602	33611	60 %	20 %	0 %	20 %	399140257
59	NC_018265	TTATT	2	10	34900	34909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018265	ATTCA	2	10	37879	37888	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018265	CCAAT	2	10	38742	38751	40 %	20 %	0 %	40 %	399140259
62	NC_018265	TATTT	2	10	39259	39268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018265	ACAAT	2	10	42343	42352	60 %	20 %	0 %	20 %	399140263
64	NC_018265	AAAGA	2	10	42751	42760	80 %	0 %	20 %	0 %	399140264
65	NC_018265	TAAAT	2	10	43008	43017	60 %	40 %	0 %	0 %	399140264
66	NC_018265	AAAAT	2	10	43298	43307	80 %	20 %	0 %	0 %	399140264
67	NC_018265	ATTTA	2	10	43532	43541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018265	AAATA	2	10	43987	43996	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018265	TATAA	2	10	44274	44283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018265	CTTTT	2	10	44695	44704	0 %	80 %	0 %	20 %	399140266
71	NC_018265	TTTTG	2	10	44723	44732	0 %	80 %	20 %	0 %	399140266
72	NC_018265	TATCT	2	10	45223	45232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018265	AAATT	2	10	45870	45879	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018265	TTATT	2	10	45921	45930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018265	TTGAA	2	10	46001	46010	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018265	AAAAC	2	10	46393	46402	80 %	0 %	0 %	20 %	399140267
77	NC_018265	AATTA	2	10	47171	47180	60 %	40 %	0 %	0 %	399140267
78	NC_018265	TTTTG	2	10	47271	47280	0 %	80 %	20 %	0 %	399140267
79	NC_018265	ATGGG	2	10	48464	48473	20 %	20 %	60 %	0 %	399140268
80	NC_018265	TATCT	2	10	49343	49352	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018265	AAATC	2	10	49481	49490	60 %	20 %	0 %	20 %	399140269
82	NC_018265	CAAAA	2	10	50662	50671	80 %	0 %	0 %	20 %	399140269
83	NC_018265	AATAA	2	10	54323	54332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018265	TTATT	2	10	54434	54443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018265	ATTCT	2	10	55534	55543	20 %	60 %	0 %	20 %	399140274
86	NC_018265	AATTA	2	10	55999	56008	60 %	40 %	0 %	0 %	399140274
87	NC_018265	CAATT	2	10	56215	56224	40 %	40 %	0 %	20 %	399140274
88	NC_018265	GTGAT	2	10	56478	56487	20 %	40 %	40 %	0 %	399140274
89	NC_018265	TCCAG	2	10	56650	56659	20 %	20 %	20 %	40 %	399140274
90	NC_018265	ATTTA	2	10	57529	57538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018265	TAAAG	2	10	59772	59781	60 %	20 %	20 %	0 %	399140277
92	NC_018265	ATAAA	2	10	60772	60781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018265	AGGTA	2	10	61267	61276	40 %	20 %	40 %	0 %	399140278
94	NC_018265	ATTTA	2	10	61614	61623	40 %	60 %	0 %	0 %	399140279
95	NC_018265	AATCC	2	10	64584	64593	40 %	20 %	0 %	40 %	399140280
96	NC_018265	TTTGA	2	10	65526	65535	20 %	60 %	20 %	0 %	399140280
97	NC_018265	ACCAA	2	10	65736	65745	60 %	0 %	0 %	40 %	399140280
98	NC_018265	AAAGA	2	10	65793	65802	80 %	0 %	20 %	0 %	399140280
99	NC_018265	ACTTA	2	10	67170	67179	40 %	40 %	0 %	20 %	399140281
100	NC_018265	ATATT	2	10	69082	69091	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018265	AGAAA	2	10	69787	69796	80 %	0 %	20 %	0 %	399140284
102	NC_018265	AAATG	2	10	70295	70304	60 %	20 %	20 %	0 %	399140284
103	NC_018265	TAAAT	2	10	70700	70709	60 %	40 %	0 %	0 %	399140285
104	NC_018265	TGATT	2	10	71783	71792	20 %	60 %	20 %	0 %	399140286
105	NC_018265	TGGAT	2	10	71861	71870	20 %	40 %	40 %	0 %	399140286
106	NC_018265	ATAAA	2	10	72302	72311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018265	CAAAA	2	10	72410	72419	80 %	0 %	0 %	20 %	399140287
108	NC_018265	AATTA	2	10	72838	72847	60 %	40 %	0 %	0 %	399140287
109	NC_018265	GTTTT	2	10	72915	72924	0 %	80 %	20 %	0 %	399140287
110	NC_018265	TTTAT	2	10	73043	73052	20 %	80 %	0 %	0 %	399140287
111	NC_018265	GATGG	2	10	74898	74907	20 %	20 %	60 %	0 %	399140288
112	NC_018265	ATAAA	2	10	75515	75524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018265	ACAGG	2	10	77965	77974	40 %	0 %	40 %	20 %	399140290
114	NC_018265	TAAAA	2	10	79511	79520	80 %	20 %	0 %	0 %	399140291
115	NC_018265	TAAGC	2	10	79592	79601	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018265	ATAAC	2	10	80644	80653	60 %	20 %	0 %	20 %	399140292
117	NC_018265	ATTTT	2	10	81449	81458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018265	TTTAA	2	10	81484	81493	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018265	TTAAT	2	10	81633	81642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018265	GTAAA	2	10	82133	82142	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018265	AAGGA	2	10	82215	82224	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018265	AAATT	2	10	82378	82387	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018265	TTATT	2	10	86679	86688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018265	TTACC	2	10	88135	88144	20 %	40 %	0 %	40 %	399140295
125	NC_018265	AGGAA	2	10	88175	88184	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018265	TTTTG	2	10	88619	88628	0 %	80 %	20 %	0 %	399140296
127	NC_018265	TTCAA	2	10	89671	89680	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018265	TGCCA	2	10	90141	90150	20 %	20 %	20 %	40 %	399140298
129	NC_018265	TACAA	2	10	95345	95354	60 %	20 %	0 %	20 %	399140301
130	NC_018265	TTCTT	2	10	96042	96051	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_018265	ATCTT	2	10	97235	97244	20 %	60 %	0 %	20 %	399140303
132	NC_018265	TTAAA	2	10	97603	97612	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018265	AAGAA	2	10	98873	98882	80 %	0 %	20 %	0 %	399140304
134	NC_018265	CCATT	2	10	99134	99143	20 %	40 %	0 %	40 %	399140304
135	NC_018265	TACCA	2	10	99633	99642	40 %	20 %	0 %	40 %	399140304
136	NC_018265	TTTAT	2	10	101065	101074	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018265	TTAAA	2	10	101261	101270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018265	TGGAT	2	10	101718	101727	20 %	40 %	40 %	0 %	399140305
139	NC_018265	ACAAA	2	10	102490	102499	80 %	0 %	0 %	20 %	399140306
140	NC_018265	TATTT	2	10	105702	105711	20 %	80 %	0 %	0 %	399140309
141	NC_018265	TTTCA	2	10	106413	106422	20 %	60 %	0 %	20 %	399140309
142	NC_018265	TTAAT	2	10	107648	107657	40 %	60 %	0 %	0 %	399140310
143	NC_018265	TATAA	2	10	107682	107691	60 %	40 %	0 %	0 %	399140310
144	NC_018265	TTTTA	2	10	108791	108800	20 %	80 %	0 %	0 %	399140312
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.