MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Melissococcus plutonius DAT561 plasmid 1

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018265	AAAGA	2	10	3578	3587	80 %	0 %	20 %	0 %	399140228
2	NC_018265	AAAAG	2	10	3643	3652	80 %	0 %	20 %	0 %	399140228
3	NC_018265	GAAAA	2	10	4456	4465	80 %	0 %	20 %	0 %	399140229
4	NC_018265	CATTA	2	10	4944	4953	40 %	40 %	0 %	20 %	399140229
5	NC_018265	CTTTT	2	10	5673	5682	0 %	80 %	0 %	20 %	399140230
6	NC_018265	CTTTT	2	10	6085	6094	0 %	80 %	0 %	20 %	399140230
7	NC_018265	CATCT	2	10	6299	6308	20 %	40 %	0 %	40 %	399140231
8	NC_018265	TTGGA	2	10	7711	7720	20 %	40 %	40 %	0 %	399140233
9	NC_018265	TTTTA	2	10	8414	8423	20 %	80 %	0 %	0 %	399140234
10	NC_018265	AATTA	2	10	9097	9106	60 %	40 %	0 %	0 %	399140236
11	NC_018265	TGGTA	2	10	10687	10696	20 %	40 %	40 %	0 %	399140238
12	NC_018265	AATTT	2	10	15134	15143	40 %	60 %	0 %	0 %	399140243
13	NC_018265	ACTTC	2	10	15533	15542	20 %	40 %	0 %	40 %	399140243
14	NC_018265	TCTAT	2	10	15927	15936	20 %	60 %	0 %	20 %	399140244
15	NC_018265	ATTTA	2	10	16373	16382	40 %	60 %	0 %	0 %	399140244
16	NC_018265	ATTAA	2	10	16872	16881	60 %	40 %	0 %	0 %	399140244
17	NC_018265	CAATC	2	10	17473	17482	40 %	20 %	0 %	40 %	399140245
18	NC_018265	TAATA	2	10	22650	22659	60 %	40 %	0 %	0 %	399140248
19	NC_018265	AAACA	2	10	25054	25063	80 %	0 %	0 %	20 %	399140249
20	NC_018265	TTATG	2	10	25520	25529	20 %	60 %	20 %	0 %	399140249
21	NC_018265	TTGGT	2	10	28998	29007	0 %	60 %	40 %	0 %	399140253
22	NC_018265	TTAAT	2	10	30565	30574	40 %	60 %	0 %	0 %	399140254
23	NC_018265	ATTTA	2	10	31377	31386	40 %	60 %	0 %	0 %	399140255
24	NC_018265	CTAAA	2	10	31481	31490	60 %	20 %	0 %	20 %	399140255
25	NC_018265	TAAAA	2	10	31917	31926	80 %	20 %	0 %	0 %	399140255
26	NC_018265	AAATA	2	10	32452	32461	80 %	20 %	0 %	0 %	399140256
27	NC_018265	CAAAT	2	10	33485	33494	60 %	20 %	0 %	20 %	399140257
28	NC_018265	CAAAT	2	10	33602	33611	60 %	20 %	0 %	20 %	399140257
29	NC_018265	CCAAT	2	10	38742	38751	40 %	20 %	0 %	40 %	399140259
30	NC_018265	ACAAT	2	10	42343	42352	60 %	20 %	0 %	20 %	399140263
31	NC_018265	AAAGA	2	10	42751	42760	80 %	0 %	20 %	0 %	399140264
32	NC_018265	TAAAT	2	10	43008	43017	60 %	40 %	0 %	0 %	399140264
33	NC_018265	AAAAT	2	10	43298	43307	80 %	20 %	0 %	0 %	399140264
34	NC_018265	CTTTT	2	10	44695	44704	0 %	80 %	0 %	20 %	399140266
35	NC_018265	TTTTG	2	10	44723	44732	0 %	80 %	20 %	0 %	399140266
36	NC_018265	AAAAC	2	10	46393	46402	80 %	0 %	0 %	20 %	399140267
37	NC_018265	AATTA	2	10	47171	47180	60 %	40 %	0 %	0 %	399140267
38	NC_018265	TTTTG	2	10	47271	47280	0 %	80 %	20 %	0 %	399140267
39	NC_018265	ATGGG	2	10	48464	48473	20 %	20 %	60 %	0 %	399140268
40	NC_018265	AAATC	2	10	49481	49490	60 %	20 %	0 %	20 %	399140269
41	NC_018265	CAAAA	2	10	50662	50671	80 %	0 %	0 %	20 %	399140269
42	NC_018265	ATTCT	2	10	55534	55543	20 %	60 %	0 %	20 %	399140274
43	NC_018265	AATTA	2	10	55999	56008	60 %	40 %	0 %	0 %	399140274
44	NC_018265	CAATT	2	10	56215	56224	40 %	40 %	0 %	20 %	399140274
45	NC_018265	GTGAT	2	10	56478	56487	20 %	40 %	40 %	0 %	399140274
46	NC_018265	TCCAG	2	10	56650	56659	20 %	20 %	20 %	40 %	399140274
47	NC_018265	TAAAG	2	10	59772	59781	60 %	20 %	20 %	0 %	399140277
48	NC_018265	AGGTA	2	10	61267	61276	40 %	20 %	40 %	0 %	399140278
49	NC_018265	ATTTA	2	10	61614	61623	40 %	60 %	0 %	0 %	399140279
50	NC_018265	AATCC	2	10	64584	64593	40 %	20 %	0 %	40 %	399140280
51	NC_018265	TTTGA	2	10	65526	65535	20 %	60 %	20 %	0 %	399140280
52	NC_018265	ACCAA	2	10	65736	65745	60 %	0 %	0 %	40 %	399140280
53	NC_018265	AAAGA	2	10	65793	65802	80 %	0 %	20 %	0 %	399140280
54	NC_018265	ACTTA	2	10	67170	67179	40 %	40 %	0 %	20 %	399140281
55	NC_018265	AGAAA	2	10	69787	69796	80 %	0 %	20 %	0 %	399140284
56	NC_018265	AAATG	2	10	70295	70304	60 %	20 %	20 %	0 %	399140284
57	NC_018265	TAAAT	2	10	70700	70709	60 %	40 %	0 %	0 %	399140285
58	NC_018265	TGATT	2	10	71783	71792	20 %	60 %	20 %	0 %	399140286
59	NC_018265	TGGAT	2	10	71861	71870	20 %	40 %	40 %	0 %	399140286
60	NC_018265	CAAAA	2	10	72410	72419	80 %	0 %	0 %	20 %	399140287
61	NC_018265	AATTA	2	10	72838	72847	60 %	40 %	0 %	0 %	399140287
62	NC_018265	GTTTT	2	10	72915	72924	0 %	80 %	20 %	0 %	399140287
63	NC_018265	TTTAT	2	10	73043	73052	20 %	80 %	0 %	0 %	399140287
64	NC_018265	GATGG	2	10	74898	74907	20 %	20 %	60 %	0 %	399140288
65	NC_018265	ACAGG	2	10	77965	77974	40 %	0 %	40 %	20 %	399140290
66	NC_018265	TAAAA	2	10	79511	79520	80 %	20 %	0 %	0 %	399140291
67	NC_018265	ATAAC	2	10	80644	80653	60 %	20 %	0 %	20 %	399140292
68	NC_018265	TTACC	2	10	88135	88144	20 %	40 %	0 %	40 %	399140295
69	NC_018265	TTTTG	2	10	88619	88628	0 %	80 %	20 %	0 %	399140296
70	NC_018265	TGCCA	2	10	90141	90150	20 %	20 %	20 %	40 %	399140298
71	NC_018265	TACAA	2	10	95345	95354	60 %	20 %	0 %	20 %	399140301
72	NC_018265	ATCTT	2	10	97235	97244	20 %	60 %	0 %	20 %	399140303
73	NC_018265	AAGAA	2	10	98873	98882	80 %	0 %	20 %	0 %	399140304
74	NC_018265	CCATT	2	10	99134	99143	20 %	40 %	0 %	40 %	399140304
75	NC_018265	TACCA	2	10	99633	99642	40 %	20 %	0 %	40 %	399140304
76	NC_018265	TGGAT	2	10	101718	101727	20 %	40 %	40 %	0 %	399140305
77	NC_018265	ACAAA	2	10	102490	102499	80 %	0 %	0 %	20 %	399140306
78	NC_018265	TATTT	2	10	105702	105711	20 %	80 %	0 %	0 %	399140309
79	NC_018265	TTTCA	2	10	106413	106422	20 %	60 %	0 %	20 %	399140309
80	NC_018265	TTAAT	2	10	107648	107657	40 %	60 %	0 %	0 %	399140310
81	NC_018265	TATAA	2	10	107682	107691	60 %	40 %	0 %	0 %	399140310
82	NC_018265	TTTTA	2	10	108791	108800	20 %	80 %	0 %	0 %	399140312
83	NC_018265	TATCT	2	10	109800	109809	20 %	60 %	0 %	20 %	399140314
84	NC_018265	TACTT	2	10	110825	110834	20 %	60 %	0 %	20 %	399140314
85	NC_018265	ATTTA	2	10	111737	111746	40 %	60 %	0 %	0 %	399140314
86	NC_018265	GAAAT	2	10	113936	113945	60 %	20 %	20 %	0 %	399140315
87	NC_018265	AATGA	2	10	122081	122090	60 %	20 %	20 %	0 %	399140320
88	NC_018265	ACATT	2	10	125677	125686	40 %	40 %	0 %	20 %	399140323
89	NC_018265	AATAA	2	10	126208	126217	80 %	20 %	0 %	0 %	399140324
90	NC_018265	TTAAA	2	10	126314	126323	60 %	40 %	0 %	0 %	399140324
91	NC_018265	ACCAA	2	10	126584	126593	60 %	0 %	0 %	40 %	399140324
92	NC_018265	TAAAA	2	10	130925	130934	80 %	20 %	0 %	0 %	399140327
93	NC_018265	GGTAG	2	10	131172	131181	20 %	20 %	60 %	0 %	399140328
94	NC_018265	ATTTT	2	10	131223	131232	20 %	80 %	0 %	0 %	399140328
95	NC_018265	GATAG	2	10	133253	133262	40 %	20 %	40 %	0 %	399140330
96	NC_018265	AATCA	2	10	133354	133363	60 %	20 %	0 %	20 %	399140330
97	NC_018265	TATAA	2	10	134930	134939	60 %	40 %	0 %	0 %	399140331
98	NC_018265	TTGAT	2	10	138783	138792	20 %	60 %	20 %	0 %	399140333
99	NC_018265	CTATC	2	10	138885	138894	20 %	40 %	0 %	40 %	399140333
100	NC_018265	ATTAA	2	10	140404	140413	60 %	40 %	0 %	0 %	399140335
101	NC_018265	CTACC	2	10	140966	140975	20 %	20 %	0 %	60 %	399140335
102	NC_018265	TTTTA	2	10	141213	141222	20 %	80 %	0 %	0 %	399140336
103	NC_018265	GTTTG	2	10	145552	145561	0 %	60 %	40 %	0 %	399140339
104	NC_018265	AATGT	2	10	146461	146470	40 %	40 %	20 %	0 %	399140340
105	NC_018265	TCATT	2	10	150057	150066	20 %	60 %	0 %	20 %	399140343
106	NC_018265	TTTGT	2	10	152872	152881	0 %	80 %	20 %	0 %	399140346
107	NC_018265	AGTTA	2	10	152982	152991	40 %	40 %	20 %	0 %	399140346
108	NC_018265	ATTTA	2	10	154496	154505	40 %	60 %	0 %	0 %	399140347
109	NC_018265	TTACC	2	10	156045	156054	20 %	40 %	0 %	40 %	399140349
110	NC_018265	TGTAA	2	10	157748	157757	40 %	40 %	20 %	0 %	399140350
111	NC_018265	AAGAT	2	10	157783	157792	60 %	20 %	20 %	0 %	399140350
112	NC_018265	GGGAT	2	10	160145	160154	20 %	20 %	60 %	0 %	399140351
113	NC_018265	ACAGG	2	10	161111	161120	40 %	0 %	40 %	20 %	399140351
114	NC_018265	ATTTT	2	10	163795	163804	20 %	80 %	0 %	0 %	399140354
115	NC_018265	TTGGT	2	10	163805	163814	0 %	60 %	40 %	0 %	399140354
116	NC_018265	ATTTT	2	10	164224	164233	20 %	80 %	0 %	0 %	399140354
117	NC_018265	AAAAG	2	10	164952	164961	80 %	0 %	20 %	0 %	399140354
118	NC_018265	CTTAT	2	10	165099	165108	20 %	60 %	0 %	20 %	399140354
119	NC_018265	TTTAT	2	10	165482	165491	20 %	80 %	0 %	0 %	399140354
120	NC_018265	GAAAA	2	10	168046	168055	80 %	0 %	20 %	0 %	399140357
121	NC_018265	GCTAA	2	10	170428	170437	40 %	20 %	20 %	20 %	399140360
122	NC_018265	TAAAG	2	10	170607	170616	60 %	20 %	20 %	0 %	399140360
123	NC_018265	GAATA	2	10	170687	170696	60 %	20 %	20 %	0 %	399140360
124	NC_018265	CAAAC	2	10	171619	171628	60 %	0 %	0 %	40 %	399140361
125	NC_018265	ATTGG	2	10	172809	172818	20 %	40 %	40 %	0 %	399140362
126	NC_018265	GTAAT	2	10	173029	173038	40 %	40 %	20 %	0 %	399140362
127	NC_018265	AAAAT	2	10	175592	175601	80 %	20 %	0 %	0 %	399140365
128	NC_018265	AATTA	2	10	181836	181845	60 %	40 %	0 %	0 %	399140370
129	NC_018265	AAAAT	2	10	184355	184364	80 %	20 %	0 %	0 %	399140374
130	NC_018265	AATAA	2	10	184497	184506	80 %	20 %	0 %	0 %	399140374
131	NC_018265	GTATT	2	10	185381	185390	20 %	60 %	20 %	0 %	399140374
132	NC_018265	ATGAA	2	10	185435	185444	60 %	20 %	20 %	0 %	399140375
133	NC_018265	ACAAT	2	10	189524	189533	60 %	20 %	0 %	20 %	399140376
134	NC_018265	CTTTT	2	10	189561	189570	0 %	80 %	0 %	20 %	399140376
135	NC_018265	AATCG	2	10	193017	193026	40 %	20 %	20 %	20 %	399140379
136	NC_018265	TGATT	2	10	193325	193334	20 %	60 %	20 %	0 %	399140379
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.