MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacterium phage THSA-485A

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018264	TCTATT	2	12	1799	1810	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397912609
2	NC_018264	CTATGT	2	12	2322	2333	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397912610
3	NC_018264	AATCTA	2	12	3195	3206	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397912612
4	NC_018264	TTTTCA	2	12	4001	4012	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397912613
5	NC_018264	AGTTGC	2	12	4399	4410	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397912614
6	NC_018264	CGGTTG	2	12	5851	5862	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397912616
7	NC_018264	TGTTAC	2	12	9425	9436	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397912622
8	NC_018264	TGCTTG	2	12	9584	9595	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	397912622
9	NC_018264	TGCATT	2	12	14318	14329	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397912626
10	NC_018264	ACTTTC	2	12	14905	14916	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397912626
11	NC_018264	TATTTT	2	12	16431	16442	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	397912628
12	NC_018264	GTATTT	2	12	32899	32910	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397912648
13	NC_018264	CTTTGC	2	12	34361	34372	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	397912650
14	NC_018264	TTCAAT	2	12	34911	34922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397912651
15	NC_018264	TATTGT	2	12	35033	35044	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397912651
16	NC_018264	CTATTG	2	12	35993	36004	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397912653
17	NC_018264	TTTTTG	2	12	36058	36069	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	397912653
18	NC_018264	GTTTTT	2	12	39196	39207	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	397912659
19	NC_018264	GCAAAA	2	12	41556	41567	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397912662

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.