MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacterium phage THSA-485A

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018264	TCATA	2	10	1214	1223	40 %	40 %	0 %	20 %	397912608
2	NC_018264	TGGTT	2	10	1669	1678	0 %	60 %	40 %	0 %	397912609
3	NC_018264	TAAAT	2	10	2834	2843	60 %	40 %	0 %	0 %	397912611
4	NC_018264	TTCTT	2	10	7195	7204	0 %	80 %	0 %	20 %	397912617
5	NC_018264	TTCTT	2	10	7708	7717	0 %	80 %	0 %	20 %	397912619
6	NC_018264	CCTGC	2	10	12717	12726	0 %	20 %	20 %	60 %	397912625
7	NC_018264	TTTGT	2	10	13683	13692	0 %	80 %	20 %	0 %	397912626
8	NC_018264	GTTTT	2	10	16290	16299	0 %	80 %	20 %	0 %	397912628
9	NC_018264	TAATT	2	10	16389	16398	40 %	60 %	0 %	0 %	397912628
10	NC_018264	TTGCT	2	10	17998	18007	0 %	60 %	20 %	20 %	397912630
11	NC_018264	ACTAA	2	10	23290	23299	60 %	20 %	0 %	20 %	397912637
12	NC_018264	CTTTC	2	10	23364	23373	0 %	60 %	0 %	40 %	397912637
13	NC_018264	GGAAT	2	10	23696	23705	40 %	20 %	40 %	0 %	397912637
14	NC_018264	CATAA	2	10	24100	24109	60 %	20 %	0 %	20 %	397912638
15	NC_018264	TCTGG	2	10	25347	25356	0 %	40 %	40 %	20 %	397912638
16	NC_018264	CATAC	2	10	25555	25564	40 %	20 %	0 %	40 %	397912638
17	NC_018264	CAATC	2	10	26321	26330	40 %	20 %	0 %	40 %	397912639
18	NC_018264	AAAGA	2	10	27301	27310	80 %	0 %	20 %	0 %	397912639
19	NC_018264	TTTCT	2	10	29044	29053	0 %	80 %	0 %	20 %	397912643
20	NC_018264	TTTTG	2	10	35010	35019	0 %	80 %	20 %	0 %	397912651
21	NC_018264	CATTC	2	10	35405	35414	20 %	40 %	0 %	40 %	397912651
22	NC_018264	TTGTT	2	10	35954	35963	0 %	80 %	20 %	0 %	397912653
23	NC_018264	AATTT	2	10	37866	37875	40 %	60 %	0 %	0 %	397912655
24	NC_018264	TGTGT	2	10	38465	38474	0 %	60 %	40 %	0 %	397912657
25	NC_018264	AAAAG	2	10	41832	41841	80 %	0 %	20 %	0 %	397912662

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.