MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacterium phage THSA-485A

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018264	GGAG	2	8	750	757	25 %	0 %	75 %	0 %	397912607
2	NC_018264	CTAT	2	8	780	787	25 %	50 %	0 %	25 %	397912607
3	NC_018264	CATA	2	8	1131	1138	50 %	25 %	0 %	25 %	397912608
4	NC_018264	CTTC	2	8	2135	2142	0 %	50 %	0 %	50 %	397912610
5	NC_018264	TTTA	2	8	2400	2407	25 %	75 %	0 %	0 %	397912611
6	NC_018264	CTAA	2	8	3613	3620	50 %	25 %	0 %	25 %	397912613
7	NC_018264	TCTT	2	8	3787	3794	0 %	75 %	0 %	25 %	397912613
8	NC_018264	TGAC	2	8	3884	3891	25 %	25 %	25 %	25 %	397912613
9	NC_018264	GCTG	2	8	4472	4479	0 %	25 %	50 %	25 %	397912614
10	NC_018264	TCCT	2	8	4660	4667	0 %	50 %	0 %	50 %	397912614
11	NC_018264	ATTT	2	8	4915	4922	25 %	75 %	0 %	0 %	397912615
12	NC_018264	TTTA	2	8	4960	4967	25 %	75 %	0 %	0 %	397912615
13	NC_018264	TAAG	2	8	5321	5328	50 %	25 %	25 %	0 %	397912615
14	NC_018264	TAAG	2	8	5390	5397	50 %	25 %	25 %	0 %	397912615
15	NC_018264	ACTG	2	8	5595	5602	25 %	25 %	25 %	25 %	397912615
16	NC_018264	CTGT	2	8	6813	6820	0 %	50 %	25 %	25 %	397912617
17	NC_018264	GTTT	2	8	6993	7000	0 %	75 %	25 %	0 %	397912617
18	NC_018264	CTTT	2	8	7166	7173	0 %	75 %	0 %	25 %	397912617
19	NC_018264	TTTG	2	8	7762	7769	0 %	75 %	25 %	0 %	397912619
20	NC_018264	TTTC	2	8	7770	7777	0 %	75 %	0 %	25 %	397912619
21	NC_018264	CTTC	2	8	7803	7810	0 %	50 %	0 %	50 %	397912619
22	NC_018264	ATTT	2	8	8267	8274	25 %	75 %	0 %	0 %	397912621
23	NC_018264	AATA	2	8	8415	8422	75 %	25 %	0 %	0 %	397912621
24	NC_018264	TCGC	2	8	9657	9664	0 %	25 %	25 %	50 %	397912622
25	NC_018264	ACAA	2	8	9753	9760	75 %	0 %	0 %	25 %	397912623
26	NC_018264	TACA	2	8	9881	9888	50 %	25 %	0 %	25 %	397912623
27	NC_018264	TGTT	2	8	10489	10496	0 %	75 %	25 %	0 %	397912624
28	NC_018264	CTGT	2	8	10767	10774	0 %	50 %	25 %	25 %	397912624
29	NC_018264	TCCT	2	8	11249	11256	0 %	50 %	0 %	50 %	397912624
30	NC_018264	GTCC	2	8	11691	11698	0 %	25 %	25 %	50 %	397912625
31	NC_018264	AATC	2	8	12378	12385	50 %	25 %	0 %	25 %	397912625
32	NC_018264	TAAC	2	8	12576	12583	50 %	25 %	0 %	25 %	397912625
33	NC_018264	TCCT	2	8	14488	14495	0 %	50 %	0 %	50 %	397912626
34	NC_018264	GCCT	2	8	14630	14637	0 %	25 %	25 %	50 %	397912626
35	NC_018264	TTTA	2	8	16752	16759	25 %	75 %	0 %	0 %	397912628
36	NC_018264	TAGT	2	8	17201	17208	25 %	50 %	25 %	0 %	397912629
37	NC_018264	TGCC	2	8	18578	18585	0 %	25 %	25 %	50 %	397912631
38	NC_018264	GCAT	2	8	19410	19417	25 %	25 %	25 %	25 %	397912633
39	NC_018264	GAAG	2	8	19466	19473	50 %	0 %	50 %	0 %	397912633
40	NC_018264	ACAT	2	8	19681	19688	50 %	25 %	0 %	25 %	397912633
41	NC_018264	ATTT	2	8	20342	20349	25 %	75 %	0 %	0 %	397912636
42	NC_018264	ATTT	2	8	20581	20588	25 %	75 %	0 %	0 %	397912636
43	NC_018264	TACA	2	8	20734	20741	50 %	25 %	0 %	25 %	397912636
44	NC_018264	AAAT	2	8	20857	20864	75 %	25 %	0 %	0 %	397912636
45	NC_018264	TAAC	2	8	22040	22047	50 %	25 %	0 %	25 %	397912637
46	NC_018264	TGTC	2	8	22436	22443	0 %	50 %	25 %	25 %	397912637
47	NC_018264	CTGC	2	8	22541	22548	0 %	25 %	25 %	50 %	397912637
48	NC_018264	TCTT	2	8	22933	22940	0 %	75 %	0 %	25 %	397912637
49	NC_018264	TCAA	2	8	23197	23204	50 %	25 %	0 %	25 %	397912637
50	NC_018264	TCAA	2	8	24059	24066	50 %	25 %	0 %	25 %	397912638
51	NC_018264	TATT	2	8	24426	24433	25 %	75 %	0 %	0 %	397912638
52	NC_018264	TTTC	2	8	25082	25089	0 %	75 %	0 %	25 %	397912638
53	NC_018264	CAAA	2	8	25182	25189	75 %	0 %	0 %	25 %	397912638
54	NC_018264	GTAA	2	8	25616	25623	50 %	25 %	25 %	0 %	397912638
55	NC_018264	TGCC	2	8	26194	26201	0 %	25 %	25 %	50 %	397912638
56	NC_018264	CTCC	2	8	26277	26284	0 %	25 %	0 %	75 %	397912638
57	NC_018264	TGAA	2	8	26484	26491	50 %	25 %	25 %	0 %	397912639
58	NC_018264	CTGG	2	8	26596	26603	0 %	25 %	50 %	25 %	397912639
59	NC_018264	TATT	2	8	27981	27988	25 %	75 %	0 %	0 %	397912641
60	NC_018264	ATCC	2	8	29165	29172	25 %	25 %	0 %	50 %	397912643
61	NC_018264	GCCT	2	8	29794	29801	0 %	25 %	25 %	50 %	397912645
62	NC_018264	AAAC	2	8	29875	29882	75 %	0 %	0 %	25 %	397912645
63	NC_018264	CCAA	2	8	30289	30296	50 %	0 %	0 %	50 %	397912646
64	NC_018264	AATT	2	8	30428	30435	50 %	50 %	0 %	0 %	397912647
65	NC_018264	ATTC	2	8	30455	30462	25 %	50 %	0 %	25 %	397912647
66	NC_018264	TCAT	2	8	30796	30803	25 %	50 %	0 %	25 %	397912647
67	NC_018264	AATC	2	8	31292	31299	50 %	25 %	0 %	25 %	397912648
68	NC_018264	TTAA	2	8	31710	31717	50 %	50 %	0 %	0 %	397912648
69	NC_018264	AAAT	2	8	32236	32243	75 %	25 %	0 %	0 %	397912648
70	NC_018264	TCTA	2	8	32339	32346	25 %	50 %	0 %	25 %	397912648
71	NC_018264	AATG	2	8	32369	32376	50 %	25 %	25 %	0 %	397912648
72	NC_018264	CCAG	2	8	32729	32736	25 %	0 %	25 %	50 %	397912648
73	NC_018264	CTGG	2	8	32876	32883	0 %	25 %	50 %	25 %	397912648
74	NC_018264	CTTT	2	8	33376	33383	0 %	75 %	0 %	25 %	397912648
75	NC_018264	TCTT	2	8	34189	34196	0 %	75 %	0 %	25 %	397912650
76	NC_018264	GTAA	2	8	34297	34304	50 %	25 %	25 %	0 %	397912650
77	NC_018264	TTCA	2	8	34947	34954	25 %	50 %	0 %	25 %	397912651
78	NC_018264	CTAT	2	8	35110	35117	25 %	50 %	0 %	25 %	397912651
79	NC_018264	TGCT	2	8	35725	35732	0 %	50 %	25 %	25 %	397912652
80	NC_018264	ATTT	2	8	35873	35880	25 %	75 %	0 %	0 %	397912653
81	NC_018264	CTTT	2	8	36508	36515	0 %	75 %	0 %	25 %	397912655
82	NC_018264	CTTG	2	8	36612	36619	0 %	50 %	25 %	25 %	397912655
83	NC_018264	GACA	2	8	38404	38411	50 %	0 %	25 %	25 %	397912656
84	NC_018264	ATTT	2	8	38427	38434	25 %	75 %	0 %	0 %	397912656
85	NC_018264	TTGC	2	8	38509	38516	0 %	50 %	25 %	25 %	397912657
86	NC_018264	GATT	2	8	38558	38565	25 %	50 %	25 %	0 %	397912657
87	NC_018264	TTTC	2	8	38610	38617	0 %	75 %	0 %	25 %	397912657
88	NC_018264	TTTA	2	8	38714	38721	25 %	75 %	0 %	0 %	397912657
89	NC_018264	TGCT	2	8	38901	38908	0 %	50 %	25 %	25 %	397912658
90	NC_018264	TGTT	2	8	39166	39173	0 %	75 %	25 %	0 %	397912659
91	NC_018264	GTAT	2	8	40381	40388	25 %	50 %	25 %	0 %	397912662
92	NC_018264	ATGT	2	8	40951	40958	25 %	50 %	25 %	0 %	397912662
93	NC_018264	CGAA	2	8	40988	40995	50 %	0 %	25 %	25 %	397912662

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.