MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanoculleus bourgensis MS2

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018227	GTCCGG	2	12	4579	4590	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018227	TGCTCC	2	12	17785	17796	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018227	TGGGGG	2	12	64779	64790	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018227	ACCCGG	2	12	64822	64833	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018227	CGTGCT	2	12	90167	90178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018227	AGGGGG	2	12	100410	100421	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018227	GTGCGA	2	12	100721	100732	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018227	TGGGGG	2	12	106686	106697	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018227	TTTCCC	2	12	113505	113516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018227	GCCCCC	2	12	131117	131128	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
11	NC_018227	TCGCAC	2	12	131343	131354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018227	TCCCCC	2	12	147753	147764	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
13	NC_018227	GCCCCC	2	12	231741	231752	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
14	NC_018227	AGTGCC	2	12	241065	241076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018227	CCCCGG	2	12	251708	251719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018227	CGGGGG	2	12	260414	260425	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018227	CGGGTT	2	12	260544	260555	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018227	CCCCCA	2	12	260586	260597	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
19	NC_018227	GCCCCC	2	12	260911	260922	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
20	NC_018227	ACAATC	2	12	294714	294725	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018227	TTTGGG	2	12	323659	323670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018227	GCCCCC	2	12	335918	335929	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
23	NC_018227	TGGGGG	2	12	358287	358298	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018227	AGCCGG	2	12	358330	358341	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018227	TGGGGG	2	12	365349	365360	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018227	GTTTGT	2	12	384192	384203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018227	CTGCCG	2	12	423779	423790	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018227	GGGTGT	2	12	497745	497756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018227	CCCCCA	2	12	549944	549955	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
30	NC_018227	TTGGCA	2	12	564988	564999	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018227	ACTATT	2	12	574403	574414	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018227	ACCGGG	2	12	610068	610079	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018227	CCCCTC	2	12	623738	623749	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
34	NC_018227	TCCGGC	2	12	630972	630983	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018227	GGGCCG	2	12	642185	642196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018227	GGCCGG	2	12	643700	643711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018227	GAGGGG	2	12	694410	694421	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018227	CGGCTC	2	12	699288	699299	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018227	GGGGAG	2	12	699304	699315	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018227	ACCCGG	2	12	701871	701882	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018227	CCCCCA	2	12	712252	712263	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
42	NC_018227	CGGGGG	2	12	712678	712689	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018227	ACCGGC	2	12	715157	715168	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018227	GCCCCC	2	12	742155	742166	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
45	NC_018227	GGTGCG	2	12	742366	742377	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018227	GGGGAG	2	12	769606	769617	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018227	CCCCCA	2	12	778759	778770	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
48	NC_018227	CCCTCT	2	12	787328	787339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_018227	TTTTGG	2	12	800010	800021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018227	CCGGGT	2	12	805562	805573	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018227	CCCCCA	2	12	805605	805616	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
52	NC_018227	GCCCCC	2	12	839773	839784	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
53	NC_018227	CCGGCG	2	12	861648	861659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018227	TGGGGG	2	12	879940	879951	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018227	GGGGGC	2	12	880042	880053	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018227	GATCCG	2	12	885508	885519	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018227	TGGGGG	2	12	887339	887350	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018227	CGCCCC	2	12	895180	895191	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
59	NC_018227	CGGGGG	2	12	908870	908881	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018227	GGGGGC	2	12	917234	917245	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018227	GGGGCA	2	12	918536	918547	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018227	ACCCCC	2	12	919596	919607	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
63	NC_018227	TCGCTT	2	12	919659	919670	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018227	AGGGGG	2	12	924465	924476	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018227	AATGGC	2	12	929180	929191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018227	GGAGCA	2	12	944093	944104	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018227	TTTTCT	2	12	968746	968757	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018227	CGATAT	2	12	978548	978559	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018227	GTGCCT	2	12	1021078	1021089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018227	GGGGAG	2	12	1027556	1027567	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018227	GGTGCG	2	12	1031330	1031341	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018227	TGGGGG	2	12	1034840	1034851	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018227	TCACCC	2	12	1039397	1039408	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_018227	CGGGAT	2	12	1044512	1044523	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018227	CGACCT	2	12	1064810	1064821	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018227	CAACCC	2	12	1067997	1068008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018227	ACGATA	2	12	1069641	1069652	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018227	CGACGG	2	12	1087176	1087187	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018227	GGGGGA	2	12	1149089	1149100	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018227	GGGGAG	2	12	1188939	1188950	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018227	CCGGGT	2	12	1207653	1207664	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018227	GCCGCG	2	12	1222648	1222659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018227	TCGTGT	2	12	1224542	1224553	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018227	GGGCGG	2	12	1243978	1243989	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018227	GGGGAG	2	12	1252335	1252346	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018227	GCCCCC	2	12	1289941	1289952	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
87	NC_018227	GGGGGC	2	12	1313760	1313771	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018227	CGGTAT	2	12	1329817	1329828	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018227	GCCCCC	2	12	1336208	1336219	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
90	NC_018227	GTCCGG	2	12	1354443	1354454	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018227	AATATT	2	12	1355860	1355871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018227	CGCCGG	2	12	1389265	1389276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018227	CCCCGC	2	12	1407587	1407598	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
94	NC_018227	GGGGAG	2	12	1417725	1417736	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018227	GCCCCC	2	12	1417945	1417956	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
96	NC_018227	CCCCCG	2	12	1483066	1483077	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
97	NC_018227	TTTTTC	2	12	1488724	1488735	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018227	GCCCCC	2	12	1503992	1504003	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
99	NC_018227	GCCCCC	2	12	1524202	1524213	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
100	NC_018227	CGGGGG	2	12	1541560	1541571	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018227	CCCCCG	2	12	1560031	1560042	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
102	NC_018227	TTCAGG	2	12	1571595	1571606	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018227	GCCGGG	2	12	1588843	1588854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018227	TCTGCG	2	12	1595069	1595080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018227	GCCCCC	2	12	1595927	1595938	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
106	NC_018227	CGGTGG	2	12	1615599	1615610	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018227	GCCGGA	2	12	1618302	1618313	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018227	GAACCT	2	12	1618360	1618371	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018227	GGTATC	2	12	1636795	1636806	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018227	GGTTTT	2	12	1658366	1658377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018227	TGGGGT	2	12	1686503	1686514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018227	CAGGAA	2	12	1686936	1686947	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018227	GGTGCG	2	12	1708484	1708495	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_018227	CGCGGA	2	12	1711567	1711578	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018227	AGGTCG	2	12	1742613	1742624	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018227	ATCGGG	2	12	1742654	1742665	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018227	GACTGC	2	12	1750991	1751002	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018227	CAGGAT	2	12	1791951	1791962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018227	CGAGGG	2	12	1791971	1791982	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018227	ATTTTA	2	12	1825565	1825576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018227	GTTGCG	2	12	1843484	1843495	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018227	AACCCG	2	12	1886724	1886735	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018227	GTCCGG	2	12	1905634	1905645	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018227	TCTGGC	2	12	1915238	1915249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018227	GGGGAG	2	12	1935574	1935585	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018227	CAGCAA	2	12	1951637	1951648	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018227	AGCACG	2	12	1954619	1954630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018227	AGCACG	2	12	1964828	1964839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018227	CTCCCT	2	12	1977815	1977826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_018227	GGATTT	2	12	1989599	1989610	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018227	GCCCCC	2	12	2005725	2005736	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
132	NC_018227	AGCACG	2	12	2022433	2022444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018227	CAGGAG	2	12	2059651	2059662	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_018227	ATTGCT	2	12	2070562	2070573	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_018227	TGGGGG	2	12	2077532	2077543	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018227	GGGAGA	2	12	2088892	2088903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018227	CCGCCC	2	12	2089630	2089641	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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139	NC_018227	GCCGGG	2	12	2094814	2094825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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141	NC_018227	GCCCCC	2	12	2130488	2130499	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
142	NC_018227	GCCCCC	2	12	2144854	2144865	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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145	NC_018227	ATTAAT	2	12	2179147	2179158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018227	GCATGT	2	12	2194215	2194226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_018227	TGGGGG	2	12	2207228	2207239	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_018227	TTTTTC	2	12	2237930	2237941	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_018227	TACGAT	2	12	2238269	2238280	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_018227	TGGGGG	2	12	2249602	2249613	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018227	ACCCGG	2	12	2255121	2255132	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018227	CGGGGG	2	12	2259724	2259735	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_018227	CGGGGG	2	12	2263715	2263726	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
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157	NC_018227	CCGCCC	2	12	2269995	2270006	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
158	NC_018227	GCCCCC	2	12	2289672	2289683	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
159	NC_018227	GGGAGA	2	12	2351386	2351397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_018227	CGCGAG	2	12	2696537	2696548	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_018227	GTCGGC	2	12	2696762	2696773	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_018227	CCGTGG	2	12	2745622	2745633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_018227	GGAATT	2	12	2750359	2750370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_018227	ATCACC	2	12	2756041	2756052	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
183	NC_018227	GGGGTA	2	12	2774527	2774538	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.