MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanoculleus bourgensis MS2

Total Repeats: 6883

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018227	TTCC	2	8	48	55	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018227	TGCA	2	8	176	183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018227	GCCC	2	8	583	590	0 %	0 %	25 %	75 %	397779167
4	NC_018227	GATA	2	8	739	746	50 %	25 %	25 %	0 %	397779167
5	NC_018227	CCGA	2	8	845	852	25 %	0 %	25 %	50 %	397779167
6	NC_018227	TCCC	2	8	1095	1102	0 %	25 %	0 %	75 %	397779167
7	NC_018227	CAAG	2	8	1614	1621	50 %	0 %	25 %	25 %	397779167
8	NC_018227	GGCA	2	8	1889	1896	25 %	0 %	50 %	25 %	397779168
9	NC_018227	GCAT	2	8	2053	2060	25 %	25 %	25 %	25 %	397779168
10	NC_018227	TCGC	2	8	2609	2616	0 %	25 %	25 %	50 %	397779169
11	NC_018227	AAAC	2	8	3130	3137	75 %	0 %	0 %	25 %	397779169
12	NC_018227	TTGC	2	8	3790	3797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018227	CGGT	2	8	3839	3846	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018227	TTTG	2	8	4527	4534	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018227	GGCC	2	8	4787	4794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018227	CCAT	2	8	5219	5226	25 %	25 %	0 %	50 %	397779170
17	NC_018227	GGCA	2	8	5556	5563	25 %	0 %	50 %	25 %	397779170
18	NC_018227	GCGG	2	8	6638	6645	0 %	0 %	75 %	25 %	397779173
19	NC_018227	CCGG	2	8	6971	6978	0 %	0 %	50 %	50 %	397779174
20	NC_018227	CGGT	2	8	7349	7356	0 %	25 %	50 %	25 %	397779174
21	NC_018227	GCAG	2	8	7863	7870	25 %	0 %	50 %	25 %	397779175
22	NC_018227	TGGG	2	8	8279	8286	0 %	25 %	75 %	0 %	397779175
23	NC_018227	CGGC	2	8	8408	8415	0 %	0 %	50 %	50 %	397779175
24	NC_018227	CGGG	2	8	8652	8659	0 %	0 %	75 %	25 %	397779175
25	NC_018227	GCCC	2	8	8749	8756	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_018227	GCCT	2	8	9424	9431	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018227	CGTC	2	8	9456	9463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018227	CCTG	2	8	9653	9660	0 %	25 %	25 %	50 %	397779177
29	NC_018227	AAGA	2	8	9703	9710	75 %	0 %	25 %	0 %	397779177
30	NC_018227	TCGC	2	8	10372	10379	0 %	25 %	25 %	50 %	397779177
31	NC_018227	CGCC	2	8	11088	11095	0 %	0 %	25 %	75 %	397779179
32	NC_018227	CCGG	2	8	11124	11131	0 %	0 %	50 %	50 %	397779179
33	NC_018227	GAAG	2	8	11548	11555	50 %	0 %	50 %	0 %	397779181
34	NC_018227	AGAA	2	8	11609	11616	75 %	0 %	25 %	0 %	397779181
35	NC_018227	CCGC	2	8	12309	12316	0 %	0 %	25 %	75 %	397779182
36	NC_018227	GAGG	2	8	12516	12523	25 %	0 %	75 %	0 %	397779182
37	NC_018227	GAAG	2	8	12548	12555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018227	TCGG	2	8	12757	12764	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018227	CTTT	2	8	12853	12860	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018227	GTAT	2	8	12933	12940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018227	CGGA	2	8	13083	13090	25 %	0 %	50 %	25 %	397779183
42	NC_018227	ACCG	2	8	14515	14522	25 %	0 %	25 %	50 %	397779185
43	NC_018227	GGCT	2	8	15115	15122	0 %	25 %	50 %	25 %	397779186
44	NC_018227	GAAG	2	8	15169	15176	50 %	0 %	50 %	0 %	397779186
45	NC_018227	CAGT	2	8	15245	15252	25 %	25 %	25 %	25 %	397779186
46	NC_018227	GAAC	2	8	15648	15655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018227	TCGG	2	8	15888	15895	0 %	25 %	50 %	25 %	397779187
48	NC_018227	GGCC	2	8	16077	16084	0 %	0 %	50 %	50 %	397779187
49	NC_018227	GCAA	2	8	16641	16648	50 %	0 %	25 %	25 %	397779187
50	NC_018227	GGAG	2	8	16977	16984	25 %	0 %	75 %	0 %	397779188
51	NC_018227	CGGG	2	8	17205	17212	0 %	0 %	75 %	25 %	397779188
52	NC_018227	CGGG	2	8	17311	17318	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018227	TGCA	2	8	18036	18043	25 %	25 %	25 %	25 %	397779190
54	NC_018227	CCTG	2	8	18210	18217	0 %	25 %	25 %	50 %	397779190
55	NC_018227	GACC	2	8	18789	18796	25 %	0 %	25 %	50 %	397779190
56	NC_018227	CCGC	2	8	18873	18880	0 %	0 %	25 %	75 %	397779190
57	NC_018227	GCGA	2	8	19231	19238	25 %	0 %	50 %	25 %	397779191
58	NC_018227	GTCG	2	8	19371	19378	0 %	25 %	50 %	25 %	397779191
59	NC_018227	CCCG	2	8	19970	19977	0 %	0 %	25 %	75 %	397779192
60	NC_018227	GCGG	2	8	20075	20082	0 %	0 %	75 %	25 %	397779192
61	NC_018227	CGCC	2	8	20155	20162	0 %	0 %	25 %	75 %	397779192
62	NC_018227	GACG	2	8	20464	20471	25 %	0 %	50 %	25 %	397779192
63	NC_018227	TGCC	2	8	21515	21522	0 %	25 %	25 %	50 %	397779193
64	NC_018227	CGAT	2	8	21530	21537	25 %	25 %	25 %	25 %	397779193
65	NC_018227	CCGG	2	8	21568	21575	0 %	0 %	50 %	50 %	397779193
66	NC_018227	AGGC	2	8	21628	21635	25 %	0 %	50 %	25 %	397779193
67	NC_018227	CCGG	2	8	21689	21696	0 %	0 %	50 %	50 %	397779193
68	NC_018227	CGGT	2	8	22066	22073	0 %	25 %	50 %	25 %	397779193
69	NC_018227	CGCC	2	8	22076	22083	0 %	0 %	25 %	75 %	397779193
70	NC_018227	GGCC	2	8	22578	22585	0 %	0 %	50 %	50 %	397779193
71	NC_018227	GGAG	2	8	23912	23919	25 %	0 %	75 %	0 %	397779194
72	NC_018227	ACCC	2	8	24203	24210	25 %	0 %	0 %	75 %	397779195
73	NC_018227	GCAG	2	8	24456	24463	25 %	0 %	50 %	25 %	397779195
74	NC_018227	TTTC	2	8	25153	25160	0 %	75 %	0 %	25 %	397779195
75	NC_018227	ATTT	2	8	25207	25214	25 %	75 %	0 %	0 %	397779195
76	NC_018227	CCAG	2	8	25471	25478	25 %	0 %	25 %	50 %	397779195
77	NC_018227	TGCG	2	8	25492	25499	0 %	25 %	50 %	25 %	397779195
78	NC_018227	GGTC	2	8	25973	25980	0 %	25 %	50 %	25 %	397779196
79	NC_018227	TCGA	2	8	26077	26084	25 %	25 %	25 %	25 %	397779196
80	NC_018227	GAGC	2	8	26803	26810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018227	TGGC	2	8	26876	26883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018227	CGGG	2	8	27383	27390	0 %	0 %	75 %	25 %	397779197
83	NC_018227	GCCG	2	8	28424	28431	0 %	0 %	50 %	50 %	397779199
84	NC_018227	GGCC	2	8	28477	28484	0 %	0 %	50 %	50 %	397779199
85	NC_018227	AGGT	2	8	28503	28510	25 %	25 %	50 %	0 %	397779199
86	NC_018227	AGGC	2	8	28696	28703	25 %	0 %	50 %	25 %	397779199
87	NC_018227	GCCG	2	8	29049	29056	0 %	0 %	50 %	50 %	397779199
88	NC_018227	CCCG	2	8	29387	29394	0 %	0 %	25 %	75 %	397779199
89	NC_018227	TCGC	2	8	29404	29411	0 %	25 %	25 %	50 %	397779199
90	NC_018227	CGGC	2	8	29813	29820	0 %	0 %	50 %	50 %	397779200
91	NC_018227	GGCG	2	8	29852	29859	0 %	0 %	75 %	25 %	397779200
92	NC_018227	GCCC	2	8	30049	30056	0 %	0 %	25 %	75 %	397779200
93	NC_018227	CGCC	2	8	30373	30380	0 %	0 %	25 %	75 %	397779200
94	NC_018227	ACCG	2	8	30429	30436	25 %	0 %	25 %	50 %	397779200
95	NC_018227	GGCG	2	8	30719	30726	0 %	0 %	75 %	25 %	397779200
96	NC_018227	CGGG	2	8	30892	30899	0 %	0 %	75 %	25 %	397779200
97	NC_018227	CGCT	2	8	31315	31322	0 %	25 %	25 %	50 %	397779200
98	NC_018227	CCGA	2	8	31694	31701	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018227	ACGC	2	8	32371	32378	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018227	AGCA	2	8	32848	32855	50 %	0 %	25 %	25 %	397779201
101	NC_018227	GGAT	2	8	33347	33354	25 %	25 %	50 %	0 %	397779202
102	NC_018227	CCCT	2	8	34213	34220	0 %	25 %	0 %	75 %	397779203
103	NC_018227	GTGC	2	8	34682	34689	0 %	25 %	50 %	25 %	397779203
104	NC_018227	TTCC	2	8	34695	34702	0 %	50 %	0 %	50 %	397779203
105	NC_018227	GCTC	2	8	34778	34785	0 %	25 %	25 %	50 %	397779203
106	NC_018227	ACGA	2	8	35458	35465	50 %	0 %	25 %	25 %	397779203
107	NC_018227	CTTC	2	8	35869	35876	0 %	50 %	0 %	50 %	397779204
108	NC_018227	CTCG	2	8	35990	35997	0 %	25 %	25 %	50 %	397779204
109	NC_018227	TCGA	2	8	36910	36917	25 %	25 %	25 %	25 %	397779205
110	NC_018227	CCGG	2	8	37526	37533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018227	CTCC	2	8	37568	37575	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_018227	TGTT	2	8	38248	38255	0 %	75 %	25 %	0 %	397779207
113	NC_018227	CCTG	2	8	38435	38442	0 %	25 %	25 %	50 %	397779207
114	NC_018227	TGTT	2	8	38764	38771	0 %	75 %	25 %	0 %	397779207
115	NC_018227	TCCA	2	8	39534	39541	25 %	25 %	0 %	50 %	397779208
116	NC_018227	GGCA	2	8	39612	39619	25 %	0 %	50 %	25 %	397779208
117	NC_018227	ACGA	2	8	40692	40699	50 %	0 %	25 %	25 %	397779209
118	NC_018227	CTGT	2	8	41329	41336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018227	CCGG	2	8	41496	41503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018227	CTCC	2	8	41538	41545	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_018227	ACGA	2	8	42051	42058	50 %	0 %	25 %	25 %	397779210
122	NC_018227	ACCG	2	8	42637	42644	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018227	ACCG	2	8	43247	43254	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018227	ACTA	2	8	43287	43294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018227	CCGG	2	8	43974	43981	0 %	0 %	50 %	50 %	397779212
126	NC_018227	CGTC	2	8	44260	44267	0 %	25 %	25 %	50 %	397779212
127	NC_018227	GCCC	2	8	44845	44852	0 %	0 %	25 %	75 %	397779212
128	NC_018227	CCCG	2	8	45560	45567	0 %	0 %	25 %	75 %	397779212
129	NC_018227	GTGC	2	8	46136	46143	0 %	25 %	50 %	25 %	397779212
130	NC_018227	AAAC	2	8	47341	47348	75 %	0 %	0 %	25 %	397779215
131	NC_018227	GGCG	2	8	48403	48410	0 %	0 %	75 %	25 %	397779217
132	NC_018227	CCGG	2	8	48656	48663	0 %	0 %	50 %	50 %	397779216
133	NC_018227	GACG	2	8	48806	48813	25 %	0 %	50 %	25 %	397779216
134	NC_018227	ACCC	2	8	48833	48840	25 %	0 %	0 %	75 %	397779216
135	NC_018227	CGCT	2	8	49066	49073	0 %	25 %	25 %	50 %	397779216
136	NC_018227	GTCG	2	8	49383	49390	0 %	25 %	50 %	25 %	397779216
137	NC_018227	CCTT	2	8	50165	50172	0 %	50 %	0 %	50 %	397779219
138	NC_018227	CCGG	2	8	50267	50274	0 %	0 %	50 %	50 %	397779219
139	NC_018227	CCGG	2	8	50413	50420	0 %	0 %	50 %	50 %	397779219
140	NC_018227	GCTC	2	8	51826	51833	0 %	25 %	25 %	50 %	397779220
141	NC_018227	CGCT	2	8	51883	51890	0 %	25 %	25 %	50 %	397779220
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143	NC_018227	CGGG	2	8	52516	52523	0 %	0 %	75 %	25 %	397779221
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