MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanoculleus bourgensis MS2

Total Repeats: 1232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018227	TTCC	2	8	48	55	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018227	TGCA	2	8	176	183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018227	TTGC	2	8	3790	3797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018227	CGGT	2	8	3839	3846	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018227	TTTG	2	8	4527	4534	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018227	GGCC	2	8	4787	4794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018227	GCCC	2	8	8749	8756	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_018227	GCCT	2	8	9424	9431	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018227	CGTC	2	8	9456	9463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018227	GAAG	2	8	12548	12555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018227	TCGG	2	8	12757	12764	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018227	CTTT	2	8	12853	12860	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018227	GTAT	2	8	12933	12940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018227	GAAC	2	8	15648	15655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018227	CGGG	2	8	17311	17318	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018227	GAGC	2	8	26803	26810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018227	TGGC	2	8	26876	26883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018227	CCGA	2	8	31694	31701	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018227	ACGC	2	8	32371	32378	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018227	CCGG	2	8	37526	37533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018227	CTCC	2	8	37568	37575	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_018227	CTGT	2	8	41329	41336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018227	CCGG	2	8	41496	41503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018227	CTCC	2	8	41538	41545	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_018227	ACCG	2	8	42637	42644	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018227	ACCG	2	8	43247	43254	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018227	ACTA	2	8	43287	43294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018227	CCGG	2	8	56546	56553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018227	ATCT	2	8	57437	57444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018227	CGTG	2	8	60572	60579	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018227	GCGG	2	8	66793	66800	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018227	CGAT	2	8	73351	73358	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018227	TCGC	2	8	73594	73601	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018227	TCGC	2	8	73769	73776	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018227	TCGC	2	8	73944	73951	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018227	GCCT	2	8	80566	80573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018227	GACG	2	8	83202	83209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018227	CCGT	2	8	89863	89870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018227	CTGT	2	8	89897	89904	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018227	TCGC	2	8	90085	90092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018227	CAAA	2	8	92458	92465	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018227	GCGG	2	8	93467	93474	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018227	TTTA	2	8	102809	102816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018227	TGTC	2	8	105428	105435	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018227	CACG	2	8	105488	105495	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018227	CACC	2	8	105496	105503	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_018227	GGAT	2	8	105655	105662	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018227	CCCA	2	8	105792	105799	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_018227	ACGC	2	8	106324	106331	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018227	CACC	2	8	106609	106616	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_018227	TGCC	2	8	110750	110757	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018227	GGCC	2	8	114531	114538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018227	CGGC	2	8	114840	114847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018227	CGGG	2	8	115033	115040	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018227	TCCC	2	8	117779	117786	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_018227	CCGC	2	8	117832	117839	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_018227	GGGC	2	8	123944	123951	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018227	GGTG	2	8	134215	134222	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018227	GGAC	2	8	134365	134372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018227	TACA	2	8	144808	144815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018227	GTGA	2	8	148097	148104	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018227	ATTT	2	8	149713	149720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018227	GGCT	2	8	153693	153700	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018227	GCGA	2	8	164407	164414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018227	GAGG	2	8	164870	164877	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018227	CCGA	2	8	164989	164996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018227	TGAT	2	8	165067	165074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018227	CCCT	2	8	166292	166299	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_018227	ATTT	2	8	167385	167392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018227	TGGC	2	8	167487	167494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018227	TCGC	2	8	167563	167570	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018227	GGGA	2	8	167986	167993	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018227	ACTG	2	8	179235	179242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018227	CGAC	2	8	189220	189227	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018227	ACCG	2	8	189456	189463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018227	CTTC	2	8	189478	189485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018227	GGGT	2	8	193572	193579	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018227	GCGG	2	8	207052	207059	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018227	CTGC	2	8	212081	212088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018227	CGTC	2	8	212221	212228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018227	CTTC	2	8	212389	212396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018227	CGGC	2	8	213750	213757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018227	TAGA	2	8	218613	218620	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018227	GCTT	2	8	218629	218636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018227	GATG	2	8	231630	231637	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018227	CCAC	2	8	231960	231967	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_018227	CGGT	2	8	233573	233580	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018227	TTTG	2	8	236066	236073	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018227	CTGA	2	8	236152	236159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018227	CGTC	2	8	239270	239277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018227	AGGT	2	8	239326	239333	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018227	CCCG	2	8	241163	241170	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_018227	TTCC	2	8	242800	242807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018227	ATGG	2	8	242937	242944	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018227	GCGG	2	8	243783	243790	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018227	GGTT	2	8	243893	243900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018227	CTGC	2	8	247179	247186	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018227	CTGG	2	8	249112	249119	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018227	GGAG	2	8	249448	249455	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018227	CTGC	2	8	250929	250936	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018227	GAAA	2	8	250992	250999	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018227	CGAG	2	8	251117	251124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018227	TCCC	2	8	251736	251743	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_018227	CCCG	2	8	251924	251931	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_018227	TAAA	2	8	251957	251964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018227	CCGA	2	8	252939	252946	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018227	CAAT	2	8	253129	253136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018227	CCCG	2	8	253272	253279	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_018227	TCGT	2	8	253361	253368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018227	CGGG	2	8	253391	253398	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018227	CACT	2	8	259763	259770	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018227	CGGG	2	8	260948	260955	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018227	GGGA	2	8	261131	261138	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018227	CCAC	2	8	261188	261195	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_018227	CGCT	2	8	261230	261237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018227	TCGC	2	8	261448	261455	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018227	GAAA	2	8	261759	261766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018227	CTCC	2	8	280066	280073	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_018227	GGTG	2	8	282280	282287	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018227	CTTC	2	8	290620	290627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018227	CCCG	2	8	291520	291527	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_018227	GGGC	2	8	293244	293251	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018227	GAGT	2	8	299706	299713	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018227	ATCT	2	8	311046	311053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018227	CTGC	2	8	323189	323196	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018227	GGAG	2	8	325508	325515	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018227	GTCA	2	8	327140	327147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018227	AATA	2	8	329398	329405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018227	TATC	2	8	331936	331943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018227	CGGG	2	8	335958	335965	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018227	CGGG	2	8	339516	339523	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018227	TGCG	2	8	348900	348907	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_018227	GGCA	2	8	348952	348959	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018227	GCGA	2	8	358460	358467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018227	GGGC	2	8	364814	364821	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018227	TGCG	2	8	364833	364840	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018227	TCGC	2	8	364971	364978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018227	AGGG	2	8	365363	365370	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018227	GCGA	2	8	371430	371437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018227	GCCC	2	8	373069	373076	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_018227	GCCA	2	8	377109	377116	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018227	TCGC	2	8	380802	380809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018227	AGGC	2	8	380994	381001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018227	AGGA	2	8	381100	381107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018227	AGGA	2	8	384169	384176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018227	GGAG	2	8	384227	384234	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018227	CCCT	2	8	396537	396544	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_018227	CCGG	2	8	396547	396554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018227	CCGC	2	8	400129	400136	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_018227	CAGA	2	8	400165	400172	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018227	CCGC	2	8	400298	400305	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
152	NC_018227	CGTG	2	8	404574	404581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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488	NC_018227	CGAG	2	8	1139876	1139883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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495	NC_018227	TCGC	2	8	1151976	1151983	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
496	NC_018227	GGGA	2	8	1155599	1155606	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
497	NC_018227	GTAG	2	8	1160521	1160528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_018227	ACCG	2	8	1172605	1172612	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_018227	CGGC	2	8	1172729	1172736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
500	NC_018227	GGCT	2	8	1176380	1176387	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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