MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Natrinema sp. J7-2 plasmid pJ7-1

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018225	CGTCGA	2	12	327	338	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397771727
2	NC_018225	TCGTCC	2	12	1340	1351	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397771727
3	NC_018225	CCTTCT	2	12	1754	1765	0 %	50 %	0 %	50 %	397771727
4	NC_018225	CGGAAC	2	12	2494	2505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
5	NC_018225	AGTACG	2	12	9029	9040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397771731
6	NC_018225	GACGCG	2	12	9725	9736	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397771732
7	NC_018225	GCCGGC	2	12	12166	12177	0 %	0 %	50 %	50 %	397771736
8	NC_018225	GCCAGA	2	12	20490	20501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771742
9	NC_018225	TCTGAA	2	12	27429	27440	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397771747
10	NC_018225	GTCGAA	2	12	29349	29360	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397771749
11	NC_018225	CTCGAA	2	12	29556	29567	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397771749
12	NC_018225	CGGGAT	2	12	31323	31334	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018225	GAGGGC	2	12	39054	39065	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018225	ATCTGG	2	12	39818	39829	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397771758
15	NC_018225	TCGACG	2	12	40248	40259	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397771758
16	NC_018225	TTCCAT	2	12	45943	45954	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018225	GAGATC	2	12	48184	48195	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397771763
18	NC_018225	TGAACG	2	12	55106	55117	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397771767
19	NC_018225	CTGAAG	2	12	57072	57083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397771767
20	NC_018225	CGGCCT	2	12	60250	60261	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397771768
21	NC_018225	GCGTCC	2	12	65917	65928	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397771770
22	NC_018225	GACGAT	2	12	77220	77231	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397771775
23	NC_018225	CGAGGC	2	12	78473	78484	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397771775
24	NC_018225	TCGACG	2	12	79501	79512	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397771775
25	NC_018225	GACTAC	2	12	81028	81039	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397771776
26	NC_018225	GCCGAT	2	12	84193	84204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397771779
27	NC_018225	TACGAA	2	12	85062	85073	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397771780
28	NC_018225	CACGAA	2	12	87802	87813	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	397771782
29	NC_018225	CATACC	2	12	88320	88331	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018225	CACCGA	2	12	88662	88673	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	397771785
31	NC_018225	GACGTC	2	12	89795	89806	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397771786
32	NC_018225	AACATC	2	12	90200	90211	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	397771786
33	NC_018225	CGTGGA	2	12	92938	92949	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397771789
34	NC_018225	CCGGCG	2	12	95876	95887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.