MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Natrinema sp. J7-2 plasmid pJ7-1

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018225	CGACG	2	10	2335	2344	20 %	0 %	40 %	40 %	397771727
2	NC_018225	CGACA	2	10	2901	2910	40 %	0 %	20 %	40 %	397771727
3	NC_018225	CGGAT	2	10	3731	3740	20 %	20 %	40 %	20 %	397771727
4	NC_018225	AGATG	2	10	6217	6226	40 %	20 %	40 %	0 %	397771729
5	NC_018225	GGCTG	2	10	7089	7098	0 %	20 %	60 %	20 %	397771730
6	NC_018225	AGTTG	2	10	7797	7806	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018225	GAATG	2	10	8104	8113	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018225	GTCGC	2	10	8339	8348	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_018225	TCTGG	2	10	8403	8412	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018225	CGAGC	2	10	9652	9661	20 %	0 %	40 %	40 %	397771732
11	NC_018225	GGCGA	2	10	10247	10256	20 %	0 %	60 %	20 %	397771734
12	NC_018225	CGCGT	2	10	16559	16568	0 %	20 %	40 %	40 %	397771738
13	NC_018225	GGCTC	2	10	16800	16809	0 %	20 %	40 %	40 %	397771738
14	NC_018225	TTTCG	2	10	18720	18729	0 %	60 %	20 %	20 %	397771742
15	NC_018225	ATCGG	2	10	19565	19574	20 %	20 %	40 %	20 %	397771742
16	NC_018225	GCAAC	2	10	22725	22734	40 %	0 %	20 %	40 %	397771742
17	NC_018225	TCACG	2	10	22956	22965	20 %	20 %	20 %	40 %	397771742
18	NC_018225	CCCCT	2	10	23060	23069	0 %	20 %	0 %	80 %	397771742
19	NC_018225	TCGAA	2	10	23198	23207	40 %	20 %	20 %	20 %	397771742
20	NC_018225	ACATC	2	10	27446	27455	40 %	20 %	0 %	40 %	397771747
21	NC_018225	GAGTC	2	10	30660	30669	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018225	ATTCG	2	10	31699	31708	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018225	GGTGA	2	10	33176	33185	20 %	20 %	60 %	0 %	397771752
24	NC_018225	ACAGT	2	10	36162	36171	40 %	20 %	20 %	20 %	397771753
25	NC_018225	AGCTC	2	10	36204	36213	20 %	20 %	20 %	40 %	397771753
26	NC_018225	ACTCC	2	10	38655	38664	20 %	20 %	0 %	60 %	397771756
27	NC_018225	CCCAA	2	10	40464	40473	40 %	0 %	0 %	60 %	397771758
28	NC_018225	AGGCG	2	10	40698	40707	20 %	0 %	60 %	20 %	397771759
29	NC_018225	GCGTC	2	10	41313	41322	0 %	20 %	40 %	40 %	397771759
30	NC_018225	ACCGA	2	10	43660	43669	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_018225	GTGAC	2	10	44658	44667	20 %	20 %	40 %	20 %	397771762
32	NC_018225	AAGCA	2	10	45472	45481	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018225	GTCCT	2	10	46387	46396	0 %	40 %	20 %	40 %	397771763
34	NC_018225	TTCGT	2	10	48962	48971	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018225	CGATT	2	10	50078	50087	20 %	40 %	20 %	20 %	397771765
36	NC_018225	CAATC	2	10	50822	50831	40 %	20 %	0 %	40 %	397771765
37	NC_018225	GACGA	2	10	52483	52492	40 %	0 %	40 %	20 %	397771766
38	NC_018225	AGTTC	2	10	52748	52757	20 %	40 %	20 %	20 %	397771766
39	NC_018225	GGGGA	2	10	54071	54080	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018225	AGCAA	2	10	54447	54456	60 %	0 %	20 %	20 %	397771767
41	NC_018225	CCCGT	2	10	54922	54931	0 %	20 %	20 %	60 %	397771767
42	NC_018225	GAACG	2	10	56494	56503	40 %	0 %	40 %	20 %	397771767
43	NC_018225	ACGCG	2	10	57791	57800	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_018225	GCCTG	2	10	59782	59791	0 %	20 %	40 %	40 %	397771768
45	NC_018225	TCTCC	2	10	60856	60865	0 %	40 %	0 %	60 %	397771768
46	NC_018225	GCTCT	2	10	61178	61187	0 %	40 %	20 %	40 %	397771768
47	NC_018225	ATCGA	2	10	64173	64182	40 %	20 %	20 %	20 %	397771769
48	NC_018225	CGAAC	2	10	68043	68052	40 %	0 %	20 %	40 %	397771770
49	NC_018225	CGGTC	2	10	73804	73813	0 %	20 %	40 %	40 %	397771774
50	NC_018225	CCGTC	2	10	74200	74209	0 %	20 %	20 %	60 %	397771774
51	NC_018225	CGGAG	2	10	74282	74291	20 %	0 %	60 %	20 %	397771774
52	NC_018225	TCCTC	2	10	75033	75042	0 %	40 %	0 %	60 %	397771774
53	NC_018225	TCGAA	2	10	76479	76488	40 %	20 %	20 %	20 %	397771774
54	NC_018225	GGCGT	2	10	77327	77336	0 %	20 %	60 %	20 %	397771775
55	NC_018225	ACGCA	2	10	82244	82253	40 %	0 %	20 %	40 %	397771778
56	NC_018225	TCGGG	2	10	82754	82763	0 %	20 %	60 %	20 %	397771778
57	NC_018225	CCGCT	2	10	89269	89278	0 %	20 %	20 %	60 %	397771786
58	NC_018225	AGATC	2	10	91008	91017	40 %	20 %	20 %	20 %	397771787
59	NC_018225	TACTC	2	10	92344	92353	20 %	40 %	0 %	40 %	397771788
60	NC_018225	ACTCG	2	10	93257	93266	20 %	20 %	20 %	40 %	397771789
61	NC_018225	CGAGA	2	10	95338	95347	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.