MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Natrinema sp. J7-2 plasmid pJ7-1

Total Repeats: 260

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018225	AACG	2	8	762	769	50 %	0 %	25 %	25 %	397771727
2	NC_018225	CGTC	2	8	779	786	0 %	25 %	25 %	50 %	397771727
3	NC_018225	CTAC	2	8	1677	1684	25 %	25 %	0 %	50 %	397771727
4	NC_018225	AGCG	2	8	2279	2286	25 %	0 %	50 %	25 %	397771727
5	NC_018225	TCGA	2	8	2563	2570	25 %	25 %	25 %	25 %	397771727
6	NC_018225	CCGA	2	8	2611	2618	25 %	0 %	25 %	50 %	397771727
7	NC_018225	CTGG	2	8	2879	2886	0 %	25 %	50 %	25 %	397771727
8	NC_018225	CGAC	2	8	2936	2943	25 %	0 %	25 %	50 %	397771727
9	NC_018225	GACG	2	8	3075	3082	25 %	0 %	50 %	25 %	397771727
10	NC_018225	CAGA	2	8	4059	4066	50 %	0 %	25 %	25 %	397771728
11	NC_018225	CGCC	2	8	4643	4650	0 %	0 %	25 %	75 %	397771728
12	NC_018225	TCGG	2	8	4718	4725	0 %	25 %	50 %	25 %	397771728
13	NC_018225	CTCA	2	8	5113	5120	25 %	25 %	0 %	50 %	397771729
14	NC_018225	GCTC	2	8	5139	5146	0 %	25 %	25 %	50 %	397771729
15	NC_018225	CGGT	2	8	5385	5392	0 %	25 %	50 %	25 %	397771729
16	NC_018225	ACGA	2	8	5495	5502	50 %	0 %	25 %	25 %	397771729
17	NC_018225	CGAG	2	8	6916	6923	25 %	0 %	50 %	25 %	397771730
18	NC_018225	GTCG	2	8	6931	6938	0 %	25 %	50 %	25 %	397771730
19	NC_018225	TTCT	2	8	7576	7583	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018225	TCGT	2	8	7706	7713	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018225	CCCA	2	8	8030	8037	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_018225	CGCC	2	8	8528	8535	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_018225	CCAA	2	8	8569	8576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018225	AGCG	2	8	8869	8876	25 %	0 %	50 %	25 %	397771731
25	NC_018225	GCCG	2	8	9224	9231	0 %	0 %	50 %	50 %	397771731
26	NC_018225	CGGC	2	8	9714	9721	0 %	0 %	50 %	50 %	397771732
27	NC_018225	TCAC	2	8	9839	9846	25 %	25 %	0 %	50 %	397771733
28	NC_018225	CGCT	2	8	9938	9945	0 %	25 %	25 %	50 %	397771733
29	NC_018225	CTCG	2	8	10235	10242	0 %	25 %	25 %	50 %	397771734
30	NC_018225	CGCC	2	8	10806	10813	0 %	0 %	25 %	75 %	397771735
31	NC_018225	CGAC	2	8	11108	11115	25 %	0 %	25 %	50 %	397771735
32	NC_018225	CGGC	2	8	11120	11127	0 %	0 %	50 %	50 %	397771735
33	NC_018225	CTGA	2	8	11226	11233	25 %	25 %	25 %	25 %	397771735
34	NC_018225	GCCC	2	8	11433	11440	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_018225	TCGC	2	8	11465	11472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018225	GACC	2	8	11473	11480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018225	CCGC	2	8	11508	11515	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_018225	CGCT	2	8	11615	11622	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018225	CGGG	2	8	11624	11631	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018225	TCGC	2	8	11676	11683	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018225	GCGA	2	8	11708	11715	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018225	GTCG	2	8	11734	11741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018225	GCGG	2	8	11876	11883	0 %	0 %	75 %	25 %	397771736
44	NC_018225	CGAG	2	8	12003	12010	25 %	0 %	50 %	25 %	397771736
45	NC_018225	CGGT	2	8	12414	12421	0 %	25 %	50 %	25 %	397771736
46	NC_018225	CGGT	2	8	12661	12668	0 %	25 %	50 %	25 %	397771736
47	NC_018225	GACC	2	8	12718	12725	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018225	CCCA	2	8	12739	12746	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_018225	GCTC	2	8	12756	12763	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018225	GTGG	2	8	12949	12956	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018225	GATT	2	8	13068	13075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018225	TGGT	2	8	13986	13993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018225	CTCA	2	8	14368	14375	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018225	AGTG	2	8	14560	14567	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018225	GACG	2	8	15011	15018	25 %	0 %	50 %	25 %	397771737
56	NC_018225	GGCG	2	8	15102	15109	0 %	0 %	75 %	25 %	397771737
57	NC_018225	CGAA	2	8	15127	15134	50 %	0 %	25 %	25 %	397771737
58	NC_018225	GAAC	2	8	15211	15218	50 %	0 %	25 %	25 %	397771737
59	NC_018225	ACCA	2	8	16173	16180	50 %	0 %	0 %	50 %	397771738
60	NC_018225	ACGA	2	8	16203	16210	50 %	0 %	25 %	25 %	397771738
61	NC_018225	GCCG	2	8	16328	16335	0 %	0 %	50 %	50 %	397771738
62	NC_018225	CGAC	2	8	16717	16724	25 %	0 %	25 %	50 %	397771738
63	NC_018225	GCAG	2	8	17304	17311	25 %	0 %	50 %	25 %	397771740
64	NC_018225	CGAG	2	8	18277	18284	25 %	0 %	50 %	25 %	397771741
65	NC_018225	TGAC	2	8	18439	18446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018225	GCTC	2	8	18810	18817	0 %	25 %	25 %	50 %	397771742
67	NC_018225	AGGT	2	8	20540	20547	25 %	25 %	50 %	0 %	397771742
68	NC_018225	CCCA	2	8	21120	21127	25 %	0 %	0 %	75 %	397771742
69	NC_018225	CATA	2	8	21151	21158	50 %	25 %	0 %	25 %	397771742
70	NC_018225	CGAC	2	8	21546	21553	25 %	0 %	25 %	50 %	397771742
71	NC_018225	CCAA	2	8	21593	21600	50 %	0 %	0 %	50 %	397771742
72	NC_018225	CAGC	2	8	22246	22253	25 %	0 %	25 %	50 %	397771742
73	NC_018225	GCAA	2	8	23721	23728	50 %	0 %	25 %	25 %	397771743
74	NC_018225	GCTC	2	8	23870	23877	0 %	25 %	25 %	50 %	397771743
75	NC_018225	GAGC	2	8	24053	24060	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018225	GTGA	2	8	24956	24963	25 %	25 %	50 %	0 %	397771745
77	NC_018225	TCGG	2	8	25576	25583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018225	AAGC	2	8	26451	26458	50 %	0 %	25 %	25 %	397771747
79	NC_018225	CGGG	2	8	26529	26536	0 %	0 %	75 %	25 %	397771747
80	NC_018225	CTCC	2	8	27116	27123	0 %	25 %	0 %	75 %	397771747
81	NC_018225	TGTT	2	8	27385	27392	0 %	75 %	25 %	0 %	397771747
82	NC_018225	CGAG	2	8	27808	27815	25 %	0 %	50 %	25 %	397771748
83	NC_018225	CCGA	2	8	28127	28134	25 %	0 %	25 %	50 %	397771748
84	NC_018225	GCCA	2	8	28297	28304	25 %	0 %	25 %	50 %	397771749
85	NC_018225	GATG	2	8	28550	28557	25 %	25 %	50 %	0 %	397771749
86	NC_018225	TCGA	2	8	28663	28670	25 %	25 %	25 %	25 %	397771749
87	NC_018225	CCGG	2	8	29313	29320	0 %	0 %	50 %	50 %	397771749
88	NC_018225	TGTT	2	8	29656	29663	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018225	CCGC	2	8	29696	29703	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_018225	GCCC	2	8	29927	29934	0 %	0 %	25 %	75 %	397771750
91	NC_018225	CCAC	2	8	30423	30430	25 %	0 %	0 %	75 %	397771751
92	NC_018225	CGAC	2	8	30519	30526	25 %	0 %	25 %	50 %	397771751
93	NC_018225	TGGA	2	8	31004	31011	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018225	GTTC	2	8	31229	31236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018225	TCCA	2	8	31259	31266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018225	CGCT	2	8	32428	32435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018225	GCTC	2	8	33029	33036	0 %	25 %	25 %	50 %	397771752
98	NC_018225	CGAC	2	8	33084	33091	25 %	0 %	25 %	50 %	397771752
99	NC_018225	CCGG	2	8	33267	33274	0 %	0 %	50 %	50 %	397771752
100	NC_018225	GCTC	2	8	33381	33388	0 %	25 %	25 %	50 %	397771752
101	NC_018225	CGAG	2	8	33868	33875	25 %	0 %	50 %	25 %	397771752
102	NC_018225	TTGC	2	8	34220	34227	0 %	50 %	25 %	25 %	397771753
103	NC_018225	TTGC	2	8	34368	34375	0 %	50 %	25 %	25 %	397771753
104	NC_018225	AATC	2	8	34380	34387	50 %	25 %	0 %	25 %	397771753
105	NC_018225	CACC	2	8	34582	34589	25 %	0 %	0 %	75 %	397771753
106	NC_018225	GTTT	2	8	34872	34879	0 %	75 %	25 %	0 %	397771753
107	NC_018225	CCAC	2	8	34947	34954	25 %	0 %	0 %	75 %	397771753
108	NC_018225	ATAG	2	8	34978	34985	50 %	25 %	25 %	0 %	397771753
109	NC_018225	CTCC	2	8	35109	35116	0 %	25 %	0 %	75 %	397771753
110	NC_018225	GTCA	2	8	35635	35642	25 %	25 %	25 %	25 %	397771753
111	NC_018225	TCAC	2	8	35978	35985	25 %	25 %	0 %	50 %	397771753
112	NC_018225	ATGA	2	8	36074	36081	50 %	25 %	25 %	0 %	397771753
113	NC_018225	CCTG	2	8	36122	36129	0 %	25 %	25 %	50 %	397771753
114	NC_018225	AAAG	2	8	36395	36402	75 %	0 %	25 %	0 %	397771753
115	NC_018225	CATT	2	8	36554	36561	25 %	50 %	0 %	25 %	397771753
116	NC_018225	TCCA	2	8	37154	37161	25 %	25 %	0 %	50 %	397771754
117	NC_018225	CCAT	2	8	37234	37241	25 %	25 %	0 %	50 %	397771754
118	NC_018225	CCAG	2	8	37648	37655	25 %	0 %	25 %	50 %	397771755
119	NC_018225	CCGA	2	8	38063	38070	25 %	0 %	25 %	50 %	397771755
120	NC_018225	GCGA	2	8	38280	38287	25 %	0 %	50 %	25 %	397771755
121	NC_018225	CGGG	2	8	38343	38350	0 %	0 %	75 %	25 %	397771755
122	NC_018225	TAGA	2	8	38389	38396	50 %	25 %	25 %	0 %	397771755
123	NC_018225	TCGG	2	8	38515	38522	0 %	25 %	50 %	25 %	397771756
124	NC_018225	ATGA	2	8	38589	38596	50 %	25 %	25 %	0 %	397771756
125	NC_018225	GTCC	2	8	38897	38904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018225	TCGA	2	8	39126	39133	25 %	25 %	25 %	25 %	397771757
127	NC_018225	CGAC	2	8	39349	39356	25 %	0 %	25 %	50 %	397771757
128	NC_018225	TTCC	2	8	41369	41376	0 %	50 %	0 %	50 %	397771759
129	NC_018225	GGAC	2	8	41404	41411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018225	GGCC	2	8	41720	41727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018225	CGGC	2	8	41764	41771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018225	GCCC	2	8	42137	42144	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_018225	CGAG	2	8	42531	42538	25 %	0 %	50 %	25 %	397771760
134	NC_018225	GTCG	2	8	42725	42732	0 %	25 %	50 %	25 %	397771760
135	NC_018225	GCCG	2	8	42961	42968	0 %	0 %	50 %	50 %	397771760
136	NC_018225	CAGC	2	8	43171	43178	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018225	TCGT	2	8	43889	43896	0 %	50 %	25 %	25 %	397771762
138	NC_018225	CGTT	2	8	44289	44296	0 %	50 %	25 %	25 %	397771762
139	NC_018225	AGTC	2	8	44521	44528	25 %	25 %	25 %	25 %	397771762
140	NC_018225	CGTC	2	8	44530	44537	0 %	25 %	25 %	50 %	397771762
141	NC_018225	TCGG	2	8	44852	44859	0 %	25 %	50 %	25 %	397771762
142	NC_018225	ATCA	2	8	45266	45273	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018225	TGAT	2	8	46047	46054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018225	GTTA	2	8	46157	46164	25 %	50 %	25 %	0 %	397771763
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.