MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 plasmid pJ7-1

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018225	TTCT	2	8	7576	7583	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018225	TCGT	2	8	7706	7713	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018225	CCCA	2	8	8030	8037	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_018225	CGCC	2	8	8528	8535	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_018225	CCAA	2	8	8569	8576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018225	GCCC	2	8	11433	11440	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_018225	TCGC	2	8	11465	11472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018225	GACC	2	8	11473	11480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018225	CCGC	2	8	11508	11515	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_018225	CGCT	2	8	11615	11622	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018225	CGGG	2	8	11624	11631	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018225	TCGC	2	8	11676	11683	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018225	GCGA	2	8	11708	11715	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018225	GTCG	2	8	11734	11741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018225	GACC	2	8	12718	12725	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018225	CCCA	2	8	12739	12746	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_018225	GCTC	2	8	12756	12763	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018225	GTGG	2	8	12949	12956	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018225	GATT	2	8	13068	13075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018225	TGGT	2	8	13986	13993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018225	CTCA	2	8	14368	14375	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018225	AGTG	2	8	14560	14567	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018225	TGAC	2	8	18439	18446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018225	GAGC	2	8	24053	24060	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018225	TCGG	2	8	25576	25583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018225	TGTT	2	8	29656	29663	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018225	CCGC	2	8	29696	29703	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_018225	TGGA	2	8	31004	31011	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018225	GTTC	2	8	31229	31236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018225	TCCA	2	8	31259	31266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018225	CGCT	2	8	32428	32435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018225	GTCC	2	8	38897	38904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018225	GGAC	2	8	41404	41411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018225	GGCC	2	8	41720	41727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018225	CGGC	2	8	41764	41771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018225	GCCC	2	8	42137	42144	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_018225	CAGC	2	8	43171	43178	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018225	ATCA	2	8	45266	45273	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018225	TGAT	2	8	46047	46054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018225	CGGC	2	8	49102	49109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018225	GGGC	2	8	49120	49127	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018225	AGAT	2	8	49584	49591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018225	GTGA	2	8	53006	53013	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018225	GGCG	2	8	53142	53149	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018225	GTCG	2	8	53466	53473	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018225	CCGT	2	8	54048	54055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018225	GGAT	2	8	54256	54263	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018225	GTAT	2	8	57653	57660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018225	TAGT	2	8	57883	57890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018225	TCAG	2	8	58258	58265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018225	TAGA	2	8	64324	64331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018225	CAAC	2	8	73462	73469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018225	GAAC	2	8	80467	80474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018225	GAAC	2	8	80530	80537	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018225	CGAA	2	8	80597	80604	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018225	ATCC	2	8	86457	86464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018225	GAAC	2	8	94272	94279	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018225	CGGA	2	8	94584	94591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.